| 中文摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 目录 | 第9-15页 |
| 缩略词 | 第15-16页 |
| 引言 | 第16-17页 |
| 第一部分 中医理论研究 | 第17-27页 |
| 1. 中医寒病因理论的辨析 | 第17-18页 |
| 2. 中医卫气理论的辨析 | 第18-21页 |
| ·阳气 | 第18页 |
| ·卫气 | 第18-19页 |
| ·卫气与脏腑 | 第19-21页 |
| ·卫气与肺 | 第19-20页 |
| ·卫气与脾 | 第20页 |
| ·卫气与肾 | 第20页 |
| ·结语 | 第20-21页 |
| 3. 转录组和代谢组研究方法整合 | 第21-27页 |
| ·中医卫气与脏腑研究的现状 | 第21-23页 |
| ·现代生物学技术研究寒邪及寒冷刺激的现状 | 第23-25页 |
| ·转录组和代谢组研究方法整合的必然 | 第25-27页 |
| 第二部分 “寒淫”致病前期实验研究 | 第27-34页 |
| 1. 急性寒冷应激人体初期实验研究 | 第27-30页 |
| ·一般指标分析 | 第27页 |
| ·差异表达基因分析 | 第27-28页 |
| ·寒淫相关差异表达基因 | 第28-29页 |
| ·RT-PCR验证结果 | 第29-30页 |
| ·GAPDH、ENO1等四个基因验证分析 | 第29页 |
| ·ATP6VOD1基因的验证及分析 | 第29-30页 |
| ·讨论 | 第30页 |
| 2. “寒淫”致病与中药干预的动物实验初期研究 | 第30-34页 |
| ·一般指标 | 第30-31页 |
| ·动物的体重、血糖和IL-2情况 | 第31-32页 |
| ·转录组实验结果 | 第32页 |
| ·讨论 | 第32-34页 |
| 第三部分 “寒淫”致病与中药干预的转录组与代谢组实验 | 第34-55页 |
| 1. 模拟寒淫致病动物实验 | 第34-36页 |
| ·实验材料 | 第34-35页 |
| ·实验动物 | 第34-35页 |
| ·实验药物 | 第35页 |
| ·实验模拟 | 第35页 |
| ·实验动物分组及模拟寒淫致病 | 第35页 |
| ·动物实验讨论 | 第35-36页 |
| 2. “寒淫”致病与中药干预的转录组实验研究 | 第36-50页 |
| ·转录组实验样本的提取 | 第36页 |
| ·表达谱芯片操作流程 | 第36-50页 |
| ·AFFYMETRIX3’IVT表达谱芯片操作 | 第36-43页 |
| ·仪器和试剂 | 第36页 |
| ·总RNA的纯化 | 第36-37页 |
| ·由RNA合成双链DNA | 第37-40页 |
| ·反转录合成第一链cDNA | 第37-38页 |
| ·反转录合成第二链cDNA | 第38页 |
| ·体外转录合成标记cRNA | 第38页 |
| ·aRNA纯化 | 第38-39页 |
| ·片断化 | 第39页 |
| ·杂交 | 第39-40页 |
| ·洗涤、染色和扫描 | 第40页 |
| ·样品质检结果 | 第40-43页 |
| ·RNA样品质控信息 | 第40-41页 |
| ·芯片实验质控情况 | 第41-42页 |
| ·散点图和矩阵图 | 第42-43页 |
| ·Agilent基因表达谱芯片(单标)操作 | 第43-50页 |
| ·仪器和试剂 | 第43-44页 |
| ·总RNA的纯化 | 第44页 |
| ·荧光标记 | 第44-46页 |
| ·芯片杂交 | 第46-47页 |
| ·芯片洗涤和扫描 | 第47页 |
| ·样品质检结果 | 第47-50页 |
| ·RNA样品质控信息 | 第47-48页 |
| ·芯片实验质控情况 | 第48-49页 |
| ·散点图和矩阵图 | 第49-50页 |
| 3. “寒淫”致病与中药干预的代谢组实验研究 | 第50-55页 |
| ·代谢组实验样本提取 | 第50页 |
| ·代谢组实验操作 | 第50-51页 |
| ·仪器与试剂 | 第50-51页 |
| ·样本处理 | 第51页 |
| ·实验参数 | 第51页 |
| ·质谱条件 | 第51页 |
| ·液相条件 | 第51页 |
| ·实验结果 | 第51-55页 |
| ·总TIC图 | 第51-52页 |
| ·三组不同样本的棒状图 | 第52页 |
| ·三组不同样本的2D图 | 第52-53页 |
| ·三组不同样本的3D图 | 第53页 |
| ·数据转化 | 第53-55页 |
| 第四部分 转录组和代谢组整合研究探讨 | 第55-111页 |
| 1. 转录组网络构建 | 第56-99页 |
| ·网络构建 | 第56-57页 |
| ·共表达分析 | 第56页 |
| ·GO分析 | 第56-57页 |
| ·KEGG | 第57页 |
| ·芯片分析结果 | 第57-98页 |
| ·模型组与正常组网络构建分析 | 第57-71页 |
| ·模型组与正常型组共表达基因分析 | 第57-59页 |
| ·模型组与正常组elimGO分析 | 第59-62页 |
| ·共表达基因Pathway分析结果 | 第62-70页 |
| ·抗原加工递呈 | 第64-65页 |
| ·细胞外基质受体相互作用 | 第65页 |
| ·内吞作用 | 第65-66页 |
| ·粘着斑 | 第66-67页 |
| ·P53信号通路 | 第67页 |
| ·细胞周期 | 第67-68页 |
| ·细胞因子受体相互作用 | 第68-69页 |
| ·心肌收缩 | 第69-70页 |
| ·共表达基因相互作用网络构架分析 | 第70-71页 |
| ·给药组与模型组网络构建分析 | 第71-83页 |
| ·给药组与模型组共表达基因分析 | 第71-72页 |
| ·给药组与模型组elimGO分析 | 第72-74页 |
| ·共表达基因Pathway分析结果 | 第74-82页 |
| ·抗原加工与递呈 | 第76-77页 |
| ·吞噬体 | 第77-78页 |
| ·细胞黏附分子 | 第78-79页 |
| ·钙信号通路 | 第79-80页 |
| ·刺激神经组织的配体受体相互作用 | 第80-81页 |
| ·IgA生成的肠道免疫网络 | 第81页 |
| ·细胞因子受体相互作用 | 第81-82页 |
| ·共表达基因相互作用网络构架分析 | 第82-83页 |
| ·给药组与正常组网络构建分析 | 第83-98页 |
| ·给药组与正常组共表达基因分析 | 第83-85页 |
| ·给药组与正常组elimGO分析 | 第85-88页 |
| ·共表达基因Pathway分析结果 | 第88-96页 |
| ·抗原加工提呈 | 第90-91页 |
| ·吞噬体 | 第91页 |
| ·IgA产生的肠道免疫网络 | 第91-92页 |
| ·细胞粘附分子 | 第92-93页 |
| ·细胞因子受体相互作用 | 第93-94页 |
| ·钙信号通路 | 第94-95页 |
| ·胞外基质受体相互作用 | 第95页 |
| ·P53信号通路 | 第95-96页 |
| ·细胞周期 | 第96页 |
| ·共表达基因相互作用网络构架分析 | 第96-98页 |
| ·结论 | 第98-99页 |
| ·“寒淫”致病的信号通路及关键基因 | 第98页 |
| ·辛热中药对“寒淫”致病的信号通路及关键基因 | 第98-99页 |
| 2. 代谢组质谱分析 | 第99-108页 |
| ·数据分析 | 第99-102页 |
| ·数据检验 | 第99-100页 |
| ·PCA主成份分析(SIMCA-P 11.5) | 第100-101页 |
| ·PLS-DA(SIMCA-P 11.5) | 第101页 |
| ·给药组与模型组PLS-DA | 第101-102页 |
| ·给药组与模型组的PCA和PLS-DA分析结果 | 第102-108页 |
| ·给药组与模型组代谢产物分析 | 第102-108页 |
| ·代谢产物与酪氨酸代谢 | 第104页 |
| ·代谢产物与甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢 | 第104页 |
| ·代谢产物与丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢 | 第104-105页 |
| ·代谢产物与色氨酸代谢 | 第105页 |
| ·代谢产物与ABC转运蛋白和赖氨酸降解 | 第105-106页 |
| ·代谢产物与精氨酸和脯氨酸代谢 | 第106页 |
| ·代谢产物与半胱氨酸和蛋氨酸代谢 | 第106页 |
| ·代谢产物与花生四烯酸代谢 | 第106-108页 |
| ·代谢产物与丙氨酸代谢 | 第108页 |
| ·代谢产物与丙氣酸代谢 | 第108页 |
| 3. “寒淫”致病及中药干预的转录组与代谢组的整合分析 | 第108-109页 |
| 4. 问题与展望 | 第109-111页 |
| 结语 | 第111-112页 |
| 参考文献 | 第112-119页 |
| 致谢 | 第119-120页 |
| 综述 | 第120-126页 |
| 参考文献 | 第123-126页 |
| 附件 | 第126-128页 |