定量序效模拟
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-10页 |
| 1 绪论 | 第10-16页 |
| ·定量序效模拟的学科位置 | 第10-12页 |
| ·定量序效模拟的定义 | 第12页 |
| ·定量序效模拟的发展 | 第12-14页 |
| ·本文框架 | 第14-16页 |
| 2 统计建模工具及模型诊断 | 第16-24页 |
| ·多元线性回归 | 第16-17页 |
| ·主成分分析 | 第17-18页 |
| ·偏最小二乘回归 | 第18-19页 |
| ·遗传算法 | 第19-21页 |
| ·模型诊断 | 第21-24页 |
| 3 碱基表征子 | 第24-32页 |
| ·概述 | 第24页 |
| ·碱基表征子的提出 | 第24-26页 |
| ·建模及分析 | 第26-29页 |
| ·启动子改造 | 第29-30页 |
| ·小结 | 第30-32页 |
| 4 氨基酸广义疏水标度 | 第32-44页 |
| ·概述 | 第32页 |
| ·氨基酸广义疏水标度的提出 | 第32-37页 |
| ·QSAM 建模及分析 | 第37-43页 |
| ·小结 | 第43-44页 |
| 5 三维原子场全息相互作用矢量 | 第44-60页 |
| ·概述 | 第44-45页 |
| ·三维原子场全息相互作用矢量的提出 | 第45-46页 |
| ·QSAM 建模及分析 | 第46-56页 |
| ·二肽苦味强度与ACE 抑制活性之间的相关性分析 | 第56-59页 |
| ·小结 | 第59-60页 |
| 6 基于结构的定量序效模拟 | 第60-76页 |
| ·概述 | 第60-61页 |
| ·基于结构的定量序效模拟的提出 | 第61-65页 |
| ·HLA-A*0201 限制性CTL 表位集 | 第65-68页 |
| ·QSAM 建模及分析 | 第68-73页 |
| ·小结 | 第73-76页 |
| 7 基于定量序效模型的计算机辅助虚拟疫苗库设计 | 第76-86页 |
| ·概述 | 第76-77页 |
| ·氨基酸综合性质得分 | 第77-78页 |
| ·虚拟疫苗库设计流程 | 第78-79页 |
| ·QSAM 模型分析 | 第79-81页 |
| ·虚拟组合疫苗库实现 | 第81-83页 |
| ·小结 | 第83-86页 |
| 8 分子对接模拟蛋白质色谱保留行为 | 第86-96页 |
| ·概述 | 第86-87页 |
| ·理论分析 | 第87-88页 |
| ·柔性分子对接 | 第88-89页 |
| ·氨基酸疏水参数 | 第89-90页 |
| ·实验部分 | 第90-91页 |
| ·模拟过程 | 第91-92页 |
| ·结果及分析 | 第92-95页 |
| ·小结 | 第95-96页 |
| 9 核序列自相关函数 | 第96-106页 |
| ·概述 | 第96-97页 |
| ·核序列自相关函数的提出 | 第97-99页 |
| ·Bayes 判别法 | 第99-100页 |
| ·蛋白质数据集 | 第100-101页 |
| ·结果及分析 | 第101-104页 |
| ·小结 | 第104-106页 |
| 10 结论与展望 | 第106-112页 |
| ·研究结论 | 第106-109页 |
| ·思考和展望 | 第109-112页 |
| 致谢 | 第112-114页 |
| 参考文献 | 第114-130页 |
| 附录 | 第130页 |
