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O型口蹄疫病毒东南亚基因型全长的克隆和序列分析

中文摘要第1-9页
英文摘要第9-11页
1 引言第11-17页
   ·口蹄疫简介第11页
   ·反向遗传系统概述第11-13页
     ·反向遗传系统简介第11-12页
     ·体外转录的拯救系统第12页
     ·基于T7 RNA聚合酶的体内转录拯救系统第12-13页
   ·FMDV反向遗传系统的国内外研究概况第13页
     ·FMDV反向遗传系统的国外研究概况第13页
     ·FMDV反向遗传系统的国内研究概况第13页
   ·FMDV基因组学研究进展第13-16页
     ·基因组的基本结构第13-14页
     ·基因组VPg、非转录区、Poly(A)尾巴及其功能第14页
     ·基因组的开放阅读框及其功能第14-16页
   ·本研究的目的和意义第16-17页
2 材料与方法第17-24页
   ·实验材料第17-19页
     ·仪器和设备第17页
     ·质粒和菌株第17页
     ·工具酶和主要试剂第17页
     ·试剂盒第17页
     ·细胞和细胞培养液第17-18页
     ·引物合成第18页
     ·常用溶液的配制第18-19页
   ·实验方法第19-21页
     ·病毒培养第19页
     ·RNA抽提第19页
     ·RT-PCR第19-20页
     ·目的片段克隆第20-21页
     ·序列测定和分析第21页
     ·基因组拼接策略第21页
   ·基因组cDNA的组装过程第21-24页
3 实验结果第24-38页
   ·基因组cDNA 5个片段的克隆和鉴定第24-25页
     ·基因组cDNA 5个片段的RT-PCR第24页
     ·重组质粒的酶切鉴定第24-25页
   ·基因组cDNA的组装第25-28页
     ·重组质粒3'UTR的获得第25页
     ·重组质粒pMD-NSP-3D-3’UTR的获得第25页
     ·重组质粒pOK-NSP-3D-3'UTR的获得第25-26页
     ·重组质粒pOK-mut-SR-NSP-3D-3'UTR的获得第26-27页
     ·重组质粒 pOK-SR的获得第27页
     ·病毒全基因组的获得第27-28页
   ·病毒全基因组序列分析第28-38页
     ·O型 FMDV参考毒株序列第28页
     ·全基因组序列分析第28-30页
     ·1D基因第30-32页
     ·L基因第32-33页
     ·3A基因第33-35页
     ·HW04株主要抗原位点第35-38页
4 讨论第38-43页
   ·全基因组cDNA的克隆、测序和拼接第38-40页
     ·实验方法的探讨第38-39页
     ·拼接策略第39-40页
   ·HW04株全长基因组cDNA序列分析第40-43页
     ·遗传演化和分类地位第40-41页
     ·抗原位点第41页
     ·毒力第41-42页
     ·宿主嗜性第42-43页
5 结论第43-44页
致谢第44-45页
参考文献第45-49页
附录A: 质粒构建流程图第49-53页
附录B: HW04株与参考序列基因同源性比对结果第53-59页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第59页

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