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菱角萤叶甲种群分化研究

中文摘要第1-6页
英文摘要第6-22页
符号说明第22-23页
第一章 文献综述第23-44页
   ·萤叶甲研究概述第23-27页
     ·萤叶甲亚科研究概况第23-24页
     ·小萤叶甲属研究概况第24-25页
     ·菱角萤叶甲研究概况第25-26页
     ·分子生物学技术在小萤叶甲属中的研究概况第26-27页
   ·种群分化研究概述第27-32页
     ·种群分化的内在原因第27-28页
     ·种群分化的外在原因第28-32页
       ·地理隔离对昆虫种下分化的影响第28-29页
       ·环境条件对昆虫种下分化的影响第29-30页
       ·寄主植物对昆虫种下分化的影响第30-32页
         ·对异域物种分化的影响第30-31页
         ·对同域物种分化的影响第31-32页
   ·种下分化的验证方法第32-43页
     ·比较形态学第32-33页
       ·一般外部形态特征第32页
       ·外生殖器第32-33页
       ·超微结构特征第33页
     ·行为特征——杂交试验第33-34页
     ·生物学及生态学特征第34页
     ·地理分布特征第34页
     ·遗传性特征——染色体分析第34-35页
     ·数学方法第35-36页
       ·主成分分析第35页
       ·聚类分析第35-36页
     ·生理生化特征——同工酶分析第36-37页
     ·分子标记技术第37-43页
       ·微卫星DNA 标记第37-38页
       ·限制性片断长度多态性(RFLP)第38页
       ·随机扩增片段长度多态性(RAPD)第38-39页
       ·扩增片段长度多态性(AFLP)第39-40页
       ·单链构象多态性(SSCP)第40-41页
       ·单核苷酸多态性(SNP)第41页
       ·DNA 序列分析第41-43页
         ·核糖体DNA第41-42页
         ·线粒体DNA第42-43页
   ·研究目的与意义第43-44页
第二章 菱角萤叶甲不同地理种群形态学比较研究第44-54页
   ·小萤叶甲属Galerucella Croth 及部分种类形态描述第44-47页
     ·菱角萤叶甲 Galerucella birmanica Jacoby第44-46页
     ·褐背小萤叶甲 G. grisescens Joannis第46-47页
   ·菱角萤叶甲不同地理种群形态特征比较第47-53页
     ·菱角萤叶甲不同地理种群数量变异性状分析第47-50页
       ·分析原理和方法第48-49页
       ·聚类分析第49-50页
         ·模糊聚类分析第49页
         ·系统聚类分析第49-50页
       ·主成分分析第50页
         ·性状相关分析第50页
         ·主成分分析第50页
     ·菱角萤叶甲不同地理种群外生殖器比较第50-53页
   ·讨论第53-54页
第三章 菱角萤叶甲不同地理种群生物学、生态学特性比较研究第54-73页
   ·材料与方法第54-57页
     ·供试寄主第54页
     ·供试虫源第54页
     ·实验条件第54页
     ·温度对菱角萤叶甲不同地理种群生长发育的影响第54页
     ·菱角萤叶甲不同地理种群的发育速率与温度关系的拟合第54-55页
     ·菱角萤叶甲不同地理种群发育起点温度和有效积温的计算第55页
       ·直线回归法第55页
       ·直接最优法第55页
     ·菱角萤叶甲不同地理种群成虫生殖力的动态模拟第55-56页
     ·菱角萤叶甲不同地理种群成虫的过冷却点测定第56页
     ·温度对菱角萤叶甲不同地理种群取食量的影响第56-57页
   ·结果与分析第57-71页
     ·地理环境条件第57页
     ·温度对菱角萤叶甲不同地理种群发育历期的影响第57-61页
     ·温度对菱角萤叶甲不同地理种群发育速率的影响第61-62页
     ·菱角萤叶甲不同地理种群发育起点温度和有效积温第62页
     ·温度对菱角萤叶甲不同地理种群卵、幼虫和蛹存活的影响第62-64页
     ·温度对菱角萤叶甲不同地理种群生殖力的影响第64-66页
       ·菱角萤叶甲不同地理种群的繁殖力特征第64页
       ·菱角萤叶甲不同地理种群的生殖力动态模拟第64-66页
     ·菱角萤叶甲不同地理种群过冷却点的测定第66-68页
       ·冬季第66-67页
       ·夏季第67-68页
     ·温度对菱角萤叶甲不同地理种群取食量的影响第68-71页
       ·温度对江苏扬州种群菱角萤叶甲取食量的影响第68-69页
       ·温度对菱角萤叶甲不同地理种群取食量的影响第69-71页
   ·讨论第71-73页
第四章 菱角萤叶甲不同地理种群及近缘种杂交试验研究第73-84页
   ·菱角萤叶甲不同地理种群杂交试验第73-79页
     ·材料与方法第73-74页
       ·供试寄主和虫源第73页
       ·杂交组合第73-74页
         ·正交第73页
         ·反交第73页
         ·子代自交第73-74页
         ·回交第74页
       ·实验方法第74页
       ·结果的判定标准第74页
     ·结果与分析第74-79页
       ·江苏扬州种群与云南保山种群的杂交第74-75页
       ·江苏扬州种群与辽宁辽阳种群的杂交第75-76页
       ·江苏扬州种群与山东泰安种群的杂交第76-77页
       ·江苏扬州种群与广东广州种群的杂交第77-78页
       ·江苏扬州种群与上海青浦种群的杂交第78-79页
   ·菱角萤叶甲和褐背小萤叶甲种间杂交试验研究第79-82页
     ·材料与方法第79-80页
       ·供试寄主和虫源第79页
       ·杂交组合第79页
         ·正交第79页
         ·反交第79页
         ·子代自交第79页
         ·回交第79页
       ·实验方法第79-80页
       ·结果的判定标准第80页
     ·结果与分析第80-82页
       ·菱角萤叶甲和褐背小萤叶甲杂交第80-81页
       ·回交第81-82页
       ·自交第82页
   ·讨论第82-84页
     ·种内杂交第82-83页
     ·种间杂交第83-84页
第五章 菱角萤叶甲不同地理种群酯酶同工酶比较研究第84-96页
   ·研究材料与方法第84-89页
     ·实验材料第84页
     ·实验仪器设备及试剂药品第84-85页
       ·仪器设备第84-85页
       ·试剂及药品第85页
     ·实验步骤第85-89页
       ·试验材料的预处理第85-86页
       ·酶提取液的制备第86页
       ·电泳贮液及凝胶第86-88页
         ·溶液的配制第86-87页
         ·制胶第87-88页
       ·上样第88页
       ·电泳第88页
       ·清洗第88页
       ·染色第88页
       ·脱色固定第88-89页
       ·凝胶的保存第89页
       ·拍照第89页
       ·聚类分析第89页
   ·结果与分析第89-93页
     ·菱角萤叶甲同种不同体段间的酯酶同工酶比较第89页
     ·菱角萤叶甲同种不同个体及性别间的酯酶同工酶比较第89-90页
     ·菱角萤叶甲与褐背小萤叶甲杂交的酯酶同工酶比较第90-91页
     ·菱角萤叶甲不同地理种群的酯酶同工酶比较第91-93页
   ·讨论第93-96页
第六章 菱角萤叶甲不同地理种群核酸序列分析第96-181页
   ·基于mtDNA COI 基因的菱角萤叶甲不同地理种群遗传分化研究第96-121页
     ·材料与方法第96-104页
       ·实验材料第96-98页
       ·主要试剂和仪器第98-99页
         ·DNA 提取试剂第98页
         ·PCR 反应试剂第98页
         ·电泳试剂第98页
         ·主要仪器第98-99页
         ·主要试剂的配制第99页
       ·实验方法第99-101页
         ·昆虫基因组DNA 的提取第99-100页
           ·提取步骤第100页
           ·电泳检测第100页
         ·PCR 反应第100-101页
           ·引物第100-101页
           ·PCR 反应体系第101页
           ·PCR 反应条件第101页
           ·PCR 产物检测及测序第101页
       ·序列分析第101-104页
         ·种群遗传结构分析第102页
         ·构建进化树第102-104页
         ·选择外群第104页
     ·结果与分析第104-118页
       ·序列联配及分析第104页
       ·序列组成分析第104-108页
       ·密码子使用频率与氨基酸组成分析第108页
       ·序列多态位点第108-109页
       ·单倍型及其分布格局第109-111页
       ·种群遗传多样性参数的评估第111-112页
       ·种群间的遗传结构第112页
       ·种群间的遗传分化及基因流第112-113页
       ·种群遗传距离分析第113-114页
       ·单倍型的分子系统树第114-117页
       ·巢式进化支分析第117-118页
     ·讨论第118-121页
       ·不同地理种群的遗传分化第118-119页
       ·影晌菱角萤叶甲种群遗传分化的因素第119-121页
   ·基于mtDNA COII 基因的菱角萤叶甲不同地理种群遗传分化研究第121-137页
     ·材料与方法第121-123页
       ·实验材料第121页
       ·主要试剂和仪器第121页
       ·实验方法第121页
         ·昆虫基因组DNA 的提取第121页
         ·PCR 反应第121页
           ·引物第121页
           ·PCR 反应体系第121页
           ·PCR 反应条件第121页
           ·PCR 产物检测及测序第121页
       ·序列分析第121-123页
     ·结果与分析第123-135页
       ·序列联配及分析第123页
       ·序列组成分析第123页
       ·密码子使用频率与氨基酸组成分析第123-124页
       ·序列多态位点第124-125页
       ·单倍型及其分布格局第125页
       ·种群遗传多样性参数的评估第125页
       ·种群间的遗传结构第125页
       ·种群间的遗传分化及基因流第125-131页
       ·种群遗传距离分析第131-132页
       ·单倍型的分子系统树第132页
       ·巢式进化支分析第132-135页
     ·讨论第135-137页
   ·基于mtDNA Cyt b 基因的菱角萤叶甲不同地理种群遗传分化研究第137-153页
     ·材料与方法第137-139页
       ·实验材料第137页
       ·主要试剂和仪器第137页
       ·实验方法第137页
         ·昆虫基因组DNA 的提取第137页
         ·PCR 反应第137页
           ·引物第137页
           ·PCR 反应体系第137页
           ·PCR 反应条件第137页
           ·PCR 产物检测及测序第137页
       ·序列分析第137-139页
     ·结果与分析第139-151页
       ·序列联配及分析第139页
       ·序列组成分析第139页
       ·密码子使用频率与氨基酸组成分析第139-144页
       ·序列多态位点第144页
       ·单倍型及其分布格局第144页
       ·种群遗传多样性参数的评估第144页
       ·种群间的遗传结构第144-147页
       ·种群间的遗传分化及基因流第147-148页
       ·种群遗传距离分析第148页
       ·单倍型的分子系统树第148-150页
       ·巢式进化支分析第150-151页
     ·讨论第151-153页
   ·基于rDNA ITS2 基因的菱角萤叶甲不同地理种群遗传分化研究第153-161页
     ·材料与方法第153-155页
       ·实验材料第153页
       ·主要试剂和仪器第153页
       ·实验方法第153-154页
         ·昆虫基因组DNA 的提取第153-154页
         ·PCR 反应第154页
           ·引物第154页
           ·PCR 反应体系第154页
           ·PCR 反应条件第154页
           ·PCR 产物检测及测序第154页
       ·序列分析第154-155页
     ·结果与分析第155-160页
       ·序列联配及分析第155页
       ·序列组成分析及多态位点第155-156页
       ·序列相似性分析第156页
       ·序列差异性分析第156-158页
       ·分子系统树第158-160页
     ·讨论第160-161页
   ·基于rDNA ITS1 基因的菱角萤叶甲不同地理种群遗传分化研究第161-169页
     ·材料与方法第161-162页
       ·实验材料第161页
       ·主要试剂和仪器第161-162页
       ·实验方法第162页
         ·昆虫基因组DNA 的提取第162页
         ·PCR 反应第162页
           ·引物第162页
           ·PCR 反应体系第162页
           ·PCR 反应条件第162页
           ·PCR 产物检测及测序第162页
       ·序列分析第162页
     ·结果与分析第162-168页
       ·序列联配及分析第162页
       ·序列组成分析第162-163页
       ·碱基替换分析第163页
       ·系统发育信号检测第163-164页
       ·小萤叶甲属ITS1 序列相似性分析第164-166页
         ·小萤叶甲属间和种间ITS1 序列相似性分析第164-165页
         ·菱角萤叶甲地理种群之间ITS1 序列相似性分析第165-166页
       ·小萤叶甲属序列差异分析第166-168页
     ·讨论第168-169页
   ·基于mtDNA 多分子标记的菱角萤叶甲不同地理种群遗传分化研究第169-177页
     ·材料与方法第169页
       ·材料来源第169页
       ·序列分析第169页
     ·结果与分析第169-176页
       ·多态位点和序列组成分析第169-171页
       ·种群间的遗传结构第171-172页
       ·种群间的遗传分化及基因流第172-173页
       ·种群遗传距离分析第173页
       ·分子系统树第173-176页
     ·讨论第176-177页
   ·基于rDNA 和mtDNA 基因的菱角萤叶甲不同地理种群遗传分化研究第177-181页
     ·材料与方法第177页
       ·材料来源第177页
       ·序列分析第177页
     ·结果与分析第177-180页
       ·COI 序列变异第177-178页
       ·ITS2 序列变异第178页
       ·核苷酸距离第178页
       ·COI 和ITS2 基因的联合分析第178页
       ·基于COI 和ITS2 基因的分子系统树第178-180页
     ·讨论第180-181页
第七章 菱角萤叶甲及近缘种分子系统学研究第181-208页
   ·基于线粒体COI 基因的小萤叶甲属部分种类分子系统学研究第181-193页
     ·材料与方法第181-182页
       ·实验材料第181-182页
       ·主要试剂和仪器第182页
       ·实验方法第182页
       ·序列分析第182页
     ·结果与分析第182-191页
       ·序列联配及分析第182页
       ·序列组成分析第182页
       ·密码子使用频率与氨基酸组成分析第182-183页
       ·碱基替换分析第183页
       ·遗传距离分析第183页
       ·数据组系统发育信号检验第183-189页
         ·P 距离与R 的关系第183页
         ·碱基替换饱和性分析第183-189页
       ·小萤叶甲属11 种昆虫系统发育重建第189-191页
         ·距离法第189页
         ·简约法第189-190页
         ·贝叶斯推论第190-191页
     ·讨论第191-193页
   ·四种萤叶甲的165 基因序列分析及其亲缘关系第193-203页
     ·材料与方法第193-194页
       ·实验材料第193页
       ·主要试剂和仪器第193页
       ·实验方法第193-194页
         ·昆虫基因组DNA 的提取第194页
         ·PCR 反应第194页
           ·引物第194页
           ·PCR 反应体系第194页
           ·PCR 反应条件第194页
           ·PCR 产物检测及测序第194页
       ·序列分析第194页
     ·结果与分析第194-202页
       ·序列联配及分析第194页
       ·序列组成分析第194-195页
       ·密码子使用频率与氨基酸组成分析第195-197页
       ·碱基替换分析第197-198页
       ·遗传距离分析第198-199页
       ·数据组系统发育信号检验第199-200页
         ·P 距离与R 的关系第199页
         ·碱基替换饱和性分析第199-200页
       ·系统发育重建第200-201页
         ·距离法第200页
         ·简约法第200-201页
       ·序列相似性分析第201-202页
     ·讨论第202-203页
   ·菱角萤叶甲和褐背小萤叶甲杂交后代的碱基差异性分析第203-208页
     ·材料与方法第203页
       ·实验材料第203页
       ·主要试剂和仪器第203页
       ·实验方法第203页
       ·序列分析第203页
     ·结果与分析第203-207页
       ·序列联配及分析第203页
       ·序列组成分析第203-204页
       ·遗传距离分析第204页
       ·遗传关系第204-207页
     ·讨论第207-208页
第八章 总结与讨论第208-216页
   ·结果与讨论第208-213页
     ·形态学方法第208-209页
     ·生态学方法第209页
     ·遗传学方法第209-210页
     ·生理生化方法第210页
     ·分子生物学方法第210-213页
       ·目的基因片段的获得第210-211页
       ·菱角萤叶甲mtDNA 的遗传分化第211-212页
       ·菱角萤叶甲的rDNA 的遗传分化第212页
       ·不同分子标记在菱角萤叶甲种群分化研究中的有效性第212页
       ·其它分子标记的应用第212-213页
   ·本文的创新之处第213页
   ·不足之处第213-214页
   ·展望第214-216页
参考文献第216-231页
附录第231-247页
 附录I第231-245页
  附录I-1第231-235页
  附录I-2第235-236页
  附录I-3第236-237页
  附录I-4第237-239页
  附录I-5第239-240页
  附录I-6第240-242页
  附录I-7第242-243页
  附录I-8第243-245页
 附录 II GenBank 登录序列第245-247页
致谢第247-249页
博士在读期间发表的研究论文第249-251页

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