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猪内源性反转录病毒的检测、启动子活性分析及载体构建

目录第1-9页
中文摘要第9-12页
 1.中国五指山猪中PERV存在与表达情况的调查第9-10页
 2.对PERV 5’非编码区启动子活性的分析第10页
 3.基于PERV长末端重复序列的逆转录病毒载体的构建第10-12页
Abstract第12-15页
缩略词(Abbreviation)第15-17页
第一部分 猪内源性反转录病毒的研究进展(综述)第17-32页
 1 PERV分子生物学特性的研究第17-25页
   ·PERV的生活周期第17-18页
   ·PERV的形态学特征第18-19页
   ·PERV的基因组结构及功能第19-21页
   ·PERV基因组编码的蛋白质及功能第21-25页
     ·核心蛋白(gag)第21-23页
     ·酶蛋白(pol)第23-24页
     ·囊膜蛋白(env)第24-25页
 2 PERV的感染性与异种移植的安全性第25-29页
 3 PERV检测技术的研究进展第29-31页
   ·病毒的分离与鉴定第29页
   ·血清学诊断试验第29-30页
   ·单克隆抗体技术第30页
   ·分子生物学诊断技术第30-31页
 4 展望第31-32页
第二部分 中国五指山猪中PERV存在与表达情况的调查第32-43页
 1 研究目的与意义第33页
 2 材料与方法第33-37页
   ·材料第33-34页
     ·检测样品第33页
     ·工具酶和试剂第33-34页
     ·主要仪器第34页
     ·主要溶液配制第34页
   ·外周血淋巴细胞的分离第34页
   ·PBL DNA的制备第34-35页
     ·细胞的消化第34页
     ·核酸抽提与纯化第34-35页
   ·PBL RNA的制备第35页
   ·引物的设计与合成第35-36页
   ·PCR扩增与分析第36页
   ·RT-PCR反应与分析第36-37页
 3 结果第37-40页
   ·中国五指山猪基因组中PERV亚型存在的检测第37页
   ·PERV编码基因存在的检测第37-38页
   ·PERV亚型表达的检测第38-40页
   ·PERV编码基因表达的检测第40页
 4 讨论第40-42页
   ·PERV的存在第40-41页
   ·PERV的表达第41-42页
 5 结论第42-43页
第三部分 猪内源性反转录病毒5’非编码区启动子活性的分析第43-65页
 1 研究目的与意义第44页
 2 材料与方法第44-55页
   ·材料第44-50页
     ·菌株与质粒第45页
     ·细胞第45页
     ·工具酶及主要试剂第45页
     ·主要仪器第45页
     ·主要溶液配制第45-50页
   ·方法第50-55页
     ·引物的设计与合成第50页
     ·PCR扩增第50-51页
     ·重组PCR第51页
     ·PCR产物的回收与纯化第51页
     ·PCR产物的克隆第51页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第51-52页
     ·连接产物及质粒的转化第52页
     ·重组质粒的快速鉴定第52页
     ·质粒的制备第52-53页
     ·重组质粒外源片段插入方向的鉴定第53页
     ·萤光素酶表达载体的构建第53-54页
     ·纯化质粒及检测第54页
     ·转染COS-7细胞第54页
     ·萤光素酶报告基因检测第54-55页
 3 结果第55-61页
   ·PCR扩增第55页
   ·重组质粒的筛选和插入子方向的鉴定第55-56页
   ·测序结果第56-57页
   ·转录因子结合位点预测第57-58页
   ·PGL3系列重组质粒的筛选第58-59页
   ·各转染质粒浓度及纯度检测结果第59页
   ·含有不同功能区的UTR的启动子活性第59-61页
 4 讨论第61-64页
   ·PERV UTRs的结构第61-62页
   ·WZSP-PERV的进化年龄第62页
   ·R区第62页
   ·U3重复区第62-63页
   ·U3上游序列第63页
   ·UTR的下游序列(PBS和前导序列)第63-64页
 5 结论第64-65页
第四部分 逆转录病毒载体研究进展(综述)第65-75页
 1 逆转录病毒的生物学特性第65-67页
 2 逆转录病毒载体第67-70页
   ·逆转录病毒载体的优点第67页
   ·逆转录病毒载体的缺点第67页
   ·逆转录病毒载体系统的构建第67-70页
 3 逆转录病毒载体的类型第70-72页
   ·双表达载体第70-71页
   ·VIP载体第71页
   ·自我失活型载体第71-72页
   ·非自动失活的定位表达载体第72页
 4 逆转录病毒载体的安全性第72-73页
 5 逆转录病毒载体的应用及前景第73-75页
第五部分 基于猪内源性反转录病毒长末端重复序列的逆转录病毒载体的构建第75-102页
 1 研究目的与意义第76-78页
 2 材料与方法第78-86页
   ·材料第78-80页
     ·菌株与质粒第78-79页
     ·工具酶及主要试剂第79页
     ·主要仪器第79页
     ·常用溶液配制第79页
     ·Southern blotting试剂第79-80页
   ·方法第80-82页
     ·引物的设计与合成第80-81页
     ·PCR扩增第81-82页
   ·重组质粒MIGR1-5’UTR的构建第82页
   ·载体MIGR1-PERV(pMP)的构建第82页
   ·含neo基因的MIGR1-PERV-neo及MIGR1-neo载体(pMPN,pMN)的构建第82页
   ·纯化质粒及检测第82页
   ·转染PK-15细胞第82-83页
   ·G418抗性筛选第83页
   ·基因组DNA的提取第83-84页
   ·基因组DNA的PCR检测第84页
   ·Southern blotting检测第84-85页
     ·酶切与电泳第84页
     ·探针制备第84页
     ·标记探针第84-85页
     ·Southern印迹转移第85页
     ·杂交第85页
     ·洗膜第85页
     ·显色反应第85页
   ·pMPN和pMIGR1-5,UTR分别与包装质粒共转染HEK293-T细胞第85-86页
   ·pMPN载体与包装质粒共转染PK-15细胞第86页
 3 结果第86-97页
   ·扩增PERV 5’UTR,3’LTR,neo基因结果第86-87页
   ·重组质粒MIGR1-5’UTR酶切鉴定结果第87页
   ·pMP酶切鉴定结果第87-88页
   ·pMPN及pMN酶切鉴定结果第88-89页
   ·纯化质粒检测结果第89页
   ·pMPN、pMN转染PK-15结果第89-90页
   ·流式细胞分析转染效果第90-92页
   ·G418压力筛选阳性细胞第92-93页
   ·基因组DNA PCR检测neo基因第93-94页
   ·基因组DNA酶切及相应质粒酶切第94页
   ·Southern blotting第94-95页
   ·pMPN和pMIGR1-5’UTR分别与包装质粒共转染HEK293-T细胞结果第95-96页
   ·pMPN转染PK-15细胞包装结果第96-97页
 4 讨论第97-100页
   ·pMP载体的结构第97-98页
   ·pMPN的构建元件IRES第98页
   ·pMPN的表达及整合能力第98-99页
   ·pMPN的转染效率第99页
   ·pMP与异源结构蛋白的结合能力第99-100页
   ·pMP与不同类型PERV结构蛋白的结合能力第100页
 5 结论第100-102页
参考文献第102-114页
致谢第114-116页
附录第116-121页
作者简历第121-122页

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