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基于毛细管电泳的基因分析方法及肿瘤遗传背景研究

第一章 文献综述第1-48页
 第一节 基因突变分析的进展第12-23页
     ·单链构象多态性分析第13-16页
     ·限制性片段长度多态性分析第16页
     ·异源双链核酸分子多态性分析第16页
     ·化学错配切割法第16-17页
     ·双脱氧链终止法第17-18页
     ·连接酶链反应法第18页
     ·变性梯度电泳和温度梯度电泳第18-19页
     ·等位基因特异性扩增反应法第19-20页
     ·核酸杂交法第20页
     ·引物延伸法第20-21页
     ·切割片段长度多态性分析第21页
     ·DNA 测序法第21-22页
     ·DNA 芯片技术第22页
     ·变性高效液相色谱法第22-23页
 第二节 微卫星不稳定性的检测方法第23-24页
     ·基本概念第23页
     ·微卫星不稳定性的常用检测方法第23-24页
       ·变性聚丙酰胺凝胶电泳第23-24页
       ·毛细管电泳技术第24页
 第三节 DNA甲基化分析的进展第24-29页
     ·限制性内切酶-PCR法第25页
     ·基因组直接测序法第25页
     ·亚硫酸氢盐法第25-29页
       ·甲基化特异性PCR 法第26-27页
       ·甲基化敏感的单核苷酸引物延伸法第27页
       ·甲基化敏感的单链构象分析第27页
       ·亚硫酸盐测序法第27-28页
       ·亚硫酸盐变性高效液相色谱法第28页
       ·PCR 荧光变性曲线分析第28页
       ·COBRA法第28-29页
 第四节 错配修复基因在肿瘤遗传背景研究的进展第29-34页
     ·人类DNA 错配修复系统第29-30页
     ·错配修复基因的作用机制第30-32页
     ·错配修复基因与肿瘤的关系第32-34页
 参考文献第34-48页
第二章 基因突变检测的无胶筛分毛细管电泳方法研究第48-78页
 第一节 无胶筛分毛细管电泳体系的建立第48-56页
     ·前言第48-49页
     ·实验部分第49-50页
       ·仪器与试剂第49页
       ·线性聚丙烯酰胺的合成第49页
       ·毛细管涂层柱的制备第49-50页
       ·线性聚丙烯酰胺特性粘度的测定第50页
       ·毛细管电泳分离双链DNA方法第50页
     ·结果与讨论第50-56页
       ·线性聚丙烯酰胺的特性粘度和分子量第50-51页
       ·线性聚丙烯酰胺浓度和分子量对双链DNA分离的影响第51-52页
       ·温度、电压对双链DNA 分离的影响第52-54页
       ·甘油添加剂对双链DNA分离的影响第54-55页
       ·自制胶和商品胶分离双链DNA的比较第55-56页
 第二节 单链构象多态性-毛细管电泳检测错配修复基因和K-ras 基因突变第56-67页
     ·前言第56-57页
     ·实验部分第57-59页
       ·仪器和试剂第57页
       ·基因组DNA提取第57-58页
       ·引物和PCR 反应第58-59页
       ·SSCP-CE 分析第59页
     ·结果与讨论第59-67页
       ·线性聚丙烯酰胺浓度对分离的影响第59-60页
       ·温度对分离的影响第60-62页
       ·分离电压的影响第62页
       ·甘油添加剂的影响第62-67页
 第三节 无胶筛分毛细管电泳方法用于临床样品的基因突变检测第67-73页
     ·实验部分第67-68页
       ·仪器和试剂第67页
       ·基因组DNA提取第67页
       ·引物和PCR 反应第67页
       ·SSCP-CE 分析第67页
       ·DNA 序列分析第67-68页
     ·结果与讨论第68-73页
 本章小结第73页
 参考文献第73-78页
第三章 检测基因启动子甲基化的毛细管电泳方法研究第78-87页
 第一节 限制性内切酶PCR-毛细管电泳法第78-81页
     ·前言第78页
     ·实验部分第78-79页
       ·仪器和试剂第78-79页
       ·基因组DNA提取第79页
       ·内切酶酶切方法和PCR 反应第79页
       ·毛细管电泳分析第79页
     ·结果与讨论第79-81页
 第二节 甲基化敏感的单链构象分析-毛细管电泳法第81-83页
     ·前言第81页
     ·实验部分第81-82页
       ·仪器和试剂第81-82页
       ·基因组DNA提取及亚硫酸氢钠处理第82页
       ·PCR 扩增反应第82页
       ·毛细管电泳分析第82页
     ·结果与讨论第82-83页
 第三节 毛细管电泳用于临床样品启动子甲基化的检测第83-85页
     ·实验部分第83-84页
       ·仪器和试剂第83页
       ·限制性内切酶PCR-毛细管电泳法第83页
       ·甲基化敏感的单链构象分析-毛细管电泳法第83-84页
     ·结果与讨论第84-85页
 本章小结第85页
 参考文献第85-87页
第四章 同时检测多个微卫星位点不稳定性的多色荧光标记-毛细管电泳方法研究第87-105页
   ·前言第87-88页
   ·实验部分第88-89页
     ·仪器和试剂第88页
     ·基因组DNA 提取第88页
     ·引物和PCR 反应第88-89页
     ·毛细管电泳分析第89页
   ·结果与讨论第89-102页
     ·毛细管电泳条件的优化第89-92页
     ·自制胶与商品胶的分离性能比较第92-93页
     ·影响微卫星片段长度的因素第93-97页
       ·尿素浓度的影响第94页
       ·温度的影响第94-97页
     ·微卫星位点片段标定长度的重现性第97页
     ·杂合性缺失的检测第97-98页
     ·临床样品检测第98-102页
 本章小结第102-103页
 参考文献第103-105页
第五章 基于毛细管电泳的基因分析平台用于肿瘤发生的遗传背景研究第105-137页
 第一节 错配修复基因突变与家族性胃癌的关系研究第106-114页
     ·前言第106页
     ·实验部分第106-108页
       ·仪器和试剂第106页
       ·临床病例第106-108页
       ·基因组DNA提取第108页
       ·引物和PCR 反应第108页
       ·SSCP-CE 分析和DNA 测序第108页
     ·结果与讨论第108-114页
 第二节 错配修复基因突变与散发性肿瘤的关系研究第114-123页
     ·前言第114页
     ·实验部分第114-115页
       ·仪器和试剂第114-115页
       ·临床病例第115页
       ·基因组DNA提取第115页
       ·引物和PCR 反应第115页
       ·SSCP-CE分析和DNA测序第115页
     ·结果与讨论第115-123页
       ·错配修复基因突变与散发性结直肠癌的关系第115-119页
       ·错配修复基因突变与其他散发性肿瘤的关系第119-122页
       ·错配修复基因突变与多原发癌的关系第122-123页
 第三节 错配修复基因功能失活机理研究第123-128页
     ·前言第123页
     ·实验部分第123-124页
       ·仪器和试剂第123-124页
       ·临床病例第124页
       ·基因组DNA提取第124页
       ·hMLH1 基因突变分析第124页
       ·hMLH1 基因启动子甲基化分析第124页
       ·蛋白表达测定方法第124页
     ·结果与讨论第124-128页
       ·临床样品检测结果第124-127页
       ·hMLH1基因突变、启动子甲基化与蛋白表达的关系第127-128页
 第四节 错配修复基因突变、启动子甲基化与微卫星不稳定的关系第128-133页
     ·前言第128-129页
     ·实验部分第129-130页
       ·仪器和试剂第129页
       ·临床病例第129页
       ·基因组DNA提取第129页
       ·hMLH1 基因突变分析第129页
       ·hMLH1 基因启动子甲基化分析第129-130页
       ·微卫星不稳定性分析第130页
     ·结果与讨论第130-133页
       ·临床样品检测结果第130-132页
       ·微卫星不稳定性与hMLH1 基因突变的关系第132页
       ·微卫星不稳定性与hMLH1 启动子甲基化的关系第132-133页
 本章小结第133-134页
 参考文献第134-137页
论文总结第137-139页
附录第139-140页
作者简介及发表论文第140-142页
致谢第142页

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