第一章 文献综述 | 第1-48页 |
第一节 基因突变分析的进展 | 第12-23页 |
·单链构象多态性分析 | 第13-16页 |
·限制性片段长度多态性分析 | 第16页 |
·异源双链核酸分子多态性分析 | 第16页 |
·化学错配切割法 | 第16-17页 |
·双脱氧链终止法 | 第17-18页 |
·连接酶链反应法 | 第18页 |
·变性梯度电泳和温度梯度电泳 | 第18-19页 |
·等位基因特异性扩增反应法 | 第19-20页 |
·核酸杂交法 | 第20页 |
·引物延伸法 | 第20-21页 |
·切割片段长度多态性分析 | 第21页 |
·DNA 测序法 | 第21-22页 |
·DNA 芯片技术 | 第22页 |
·变性高效液相色谱法 | 第22-23页 |
第二节 微卫星不稳定性的检测方法 | 第23-24页 |
·基本概念 | 第23页 |
·微卫星不稳定性的常用检测方法 | 第23-24页 |
·变性聚丙酰胺凝胶电泳 | 第23-24页 |
·毛细管电泳技术 | 第24页 |
第三节 DNA甲基化分析的进展 | 第24-29页 |
·限制性内切酶-PCR法 | 第25页 |
·基因组直接测序法 | 第25页 |
·亚硫酸氢盐法 | 第25-29页 |
·甲基化特异性PCR 法 | 第26-27页 |
·甲基化敏感的单核苷酸引物延伸法 | 第27页 |
·甲基化敏感的单链构象分析 | 第27页 |
·亚硫酸盐测序法 | 第27-28页 |
·亚硫酸盐变性高效液相色谱法 | 第28页 |
·PCR 荧光变性曲线分析 | 第28页 |
·COBRA法 | 第28-29页 |
第四节 错配修复基因在肿瘤遗传背景研究的进展 | 第29-34页 |
·人类DNA 错配修复系统 | 第29-30页 |
·错配修复基因的作用机制 | 第30-32页 |
·错配修复基因与肿瘤的关系 | 第32-34页 |
参考文献 | 第34-48页 |
第二章 基因突变检测的无胶筛分毛细管电泳方法研究 | 第48-78页 |
第一节 无胶筛分毛细管电泳体系的建立 | 第48-56页 |
·前言 | 第48-49页 |
·实验部分 | 第49-50页 |
·仪器与试剂 | 第49页 |
·线性聚丙烯酰胺的合成 | 第49页 |
·毛细管涂层柱的制备 | 第49-50页 |
·线性聚丙烯酰胺特性粘度的测定 | 第50页 |
·毛细管电泳分离双链DNA方法 | 第50页 |
·结果与讨论 | 第50-56页 |
·线性聚丙烯酰胺的特性粘度和分子量 | 第50-51页 |
·线性聚丙烯酰胺浓度和分子量对双链DNA分离的影响 | 第51-52页 |
·温度、电压对双链DNA 分离的影响 | 第52-54页 |
·甘油添加剂对双链DNA分离的影响 | 第54-55页 |
·自制胶和商品胶分离双链DNA的比较 | 第55-56页 |
第二节 单链构象多态性-毛细管电泳检测错配修复基因和K-ras 基因突变 | 第56-67页 |
·前言 | 第56-57页 |
·实验部分 | 第57-59页 |
·仪器和试剂 | 第57页 |
·基因组DNA提取 | 第57-58页 |
·引物和PCR 反应 | 第58-59页 |
·SSCP-CE 分析 | 第59页 |
·结果与讨论 | 第59-67页 |
·线性聚丙烯酰胺浓度对分离的影响 | 第59-60页 |
·温度对分离的影响 | 第60-62页 |
·分离电压的影响 | 第62页 |
·甘油添加剂的影响 | 第62-67页 |
第三节 无胶筛分毛细管电泳方法用于临床样品的基因突变检测 | 第67-73页 |
·实验部分 | 第67-68页 |
·仪器和试剂 | 第67页 |
·基因组DNA提取 | 第67页 |
·引物和PCR 反应 | 第67页 |
·SSCP-CE 分析 | 第67页 |
·DNA 序列分析 | 第67-68页 |
·结果与讨论 | 第68-73页 |
本章小结 | 第73页 |
参考文献 | 第73-78页 |
第三章 检测基因启动子甲基化的毛细管电泳方法研究 | 第78-87页 |
第一节 限制性内切酶PCR-毛细管电泳法 | 第78-81页 |
·前言 | 第78页 |
·实验部分 | 第78-79页 |
·仪器和试剂 | 第78-79页 |
·基因组DNA提取 | 第79页 |
·内切酶酶切方法和PCR 反应 | 第79页 |
·毛细管电泳分析 | 第79页 |
·结果与讨论 | 第79-81页 |
第二节 甲基化敏感的单链构象分析-毛细管电泳法 | 第81-83页 |
·前言 | 第81页 |
·实验部分 | 第81-82页 |
·仪器和试剂 | 第81-82页 |
·基因组DNA提取及亚硫酸氢钠处理 | 第82页 |
·PCR 扩增反应 | 第82页 |
·毛细管电泳分析 | 第82页 |
·结果与讨论 | 第82-83页 |
第三节 毛细管电泳用于临床样品启动子甲基化的检测 | 第83-85页 |
·实验部分 | 第83-84页 |
·仪器和试剂 | 第83页 |
·限制性内切酶PCR-毛细管电泳法 | 第83页 |
·甲基化敏感的单链构象分析-毛细管电泳法 | 第83-84页 |
·结果与讨论 | 第84-85页 |
本章小结 | 第85页 |
参考文献 | 第85-87页 |
第四章 同时检测多个微卫星位点不稳定性的多色荧光标记-毛细管电泳方法研究 | 第87-105页 |
·前言 | 第87-88页 |
·实验部分 | 第88-89页 |
·仪器和试剂 | 第88页 |
·基因组DNA 提取 | 第88页 |
·引物和PCR 反应 | 第88-89页 |
·毛细管电泳分析 | 第89页 |
·结果与讨论 | 第89-102页 |
·毛细管电泳条件的优化 | 第89-92页 |
·自制胶与商品胶的分离性能比较 | 第92-93页 |
·影响微卫星片段长度的因素 | 第93-97页 |
·尿素浓度的影响 | 第94页 |
·温度的影响 | 第94-97页 |
·微卫星位点片段标定长度的重现性 | 第97页 |
·杂合性缺失的检测 | 第97-98页 |
·临床样品检测 | 第98-102页 |
本章小结 | 第102-103页 |
参考文献 | 第103-105页 |
第五章 基于毛细管电泳的基因分析平台用于肿瘤发生的遗传背景研究 | 第105-137页 |
第一节 错配修复基因突变与家族性胃癌的关系研究 | 第106-114页 |
·前言 | 第106页 |
·实验部分 | 第106-108页 |
·仪器和试剂 | 第106页 |
·临床病例 | 第106-108页 |
·基因组DNA提取 | 第108页 |
·引物和PCR 反应 | 第108页 |
·SSCP-CE 分析和DNA 测序 | 第108页 |
·结果与讨论 | 第108-114页 |
第二节 错配修复基因突变与散发性肿瘤的关系研究 | 第114-123页 |
·前言 | 第114页 |
·实验部分 | 第114-115页 |
·仪器和试剂 | 第114-115页 |
·临床病例 | 第115页 |
·基因组DNA提取 | 第115页 |
·引物和PCR 反应 | 第115页 |
·SSCP-CE分析和DNA测序 | 第115页 |
·结果与讨论 | 第115-123页 |
·错配修复基因突变与散发性结直肠癌的关系 | 第115-119页 |
·错配修复基因突变与其他散发性肿瘤的关系 | 第119-122页 |
·错配修复基因突变与多原发癌的关系 | 第122-123页 |
第三节 错配修复基因功能失活机理研究 | 第123-128页 |
·前言 | 第123页 |
·实验部分 | 第123-124页 |
·仪器和试剂 | 第123-124页 |
·临床病例 | 第124页 |
·基因组DNA提取 | 第124页 |
·hMLH1 基因突变分析 | 第124页 |
·hMLH1 基因启动子甲基化分析 | 第124页 |
·蛋白表达测定方法 | 第124页 |
·结果与讨论 | 第124-128页 |
·临床样品检测结果 | 第124-127页 |
·hMLH1基因突变、启动子甲基化与蛋白表达的关系 | 第127-128页 |
第四节 错配修复基因突变、启动子甲基化与微卫星不稳定的关系 | 第128-133页 |
·前言 | 第128-129页 |
·实验部分 | 第129-130页 |
·仪器和试剂 | 第129页 |
·临床病例 | 第129页 |
·基因组DNA提取 | 第129页 |
·hMLH1 基因突变分析 | 第129页 |
·hMLH1 基因启动子甲基化分析 | 第129-130页 |
·微卫星不稳定性分析 | 第130页 |
·结果与讨论 | 第130-133页 |
·临床样品检测结果 | 第130-132页 |
·微卫星不稳定性与hMLH1 基因突变的关系 | 第132页 |
·微卫星不稳定性与hMLH1 启动子甲基化的关系 | 第132-133页 |
本章小结 | 第133-134页 |
参考文献 | 第134-137页 |
论文总结 | 第137-139页 |
附录 | 第139-140页 |
作者简介及发表论文 | 第140-142页 |
致谢 | 第142页 |