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海湾扇贝和栉孔扇贝EST分析及C型凝集素基因的克隆与分析

硕士学位论文第1-4页
摘   要第4-9页
第一章 文献综述第9-24页
   ·扇贝养殖业现状第9页
   ·扇贝养殖业面临的问题及养殖业健康的可持续发展第9-13页
     ·面临的问题及其原因第9-11页
     ·解决办法及可持续发展战略第11-13页
   ·软体动物免疫防御机制 第13-18页
     ·血淋巴细胞成分与免疫机制第14-15页
     ·体液因子第15-17页
     ·防御系统的相互联系和调节第17-18页
   ·基因克隆和筛选的主要方法第18-21页
     ·表达序列标签第18页
     ·差异显示反转录第18-19页
     ·随机引物法克隆未知序列基因第19页
     ·代表性差异分析第19-20页
     ·用特异抗体克隆基因第20页
     ·基因表达系列分析第20页
     ·基因芯片第20-21页
   ·扇贝基因组及功能基因的研究现状第21-22页
   ·研究意义第22-24页
第二章 海湾扇贝和栉孔扇贝CDNA文库构建和EST分析第24-60页
   ·简介 第24-29页
     ·EST技术的应用第24-26页
     ·基于EST的生物信息学分析第26-29页
   ·材料与方法第29-35页
     ·海湾扇贝和栉孔扇贝总RNA的提取第29页
     ·mRNA的分离纯化第29-30页
     ·cDNA的合成及重组第30-31页
     ·噬菌体的包装、滴度测定第31-32页
     ·噬菌体文库的扩增第32-33页
     ·重组质粒的筛选和测序PCR第33-34页
     ·EST序列测定和数据分析第34-35页
   ·实验结果第35-51页
     ·总RNA的提取第35-36页
     ·mRNA纯化结果第36-37页
     ·cDNA的合成第37-38页
     ·包装后原代库的滴度第38-39页
     ·扩增文库及其滴度第39页
     · 质粒插入和片段长度的检测第39-41页
     · 测序及数据处理第41-42页
     ·多序列比对结果第42-45页
     ·细胞及机体防御相关EST第45页
     ·重要的免疫相关分子分析第45-51页
   ·讨论第51-60页
     ·扇贝EST序列及其分析第51-52页
     ·免疫相关EST第52-58页
     ·意义和展望第58-60页
第三章 海湾扇贝EST数据中微卫星标记的筛选第60-69页
   ·简介第60-62页
   ·材料与方法第62-63页
     ·微卫星EST的查找和引物设计第62页
     ·模板DNA的提取第62页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳第62-63页
   ·结果第63-67页
     ·海湾扇贝EST微卫星序列的查找和引物设计第63-64页
     ·引物验证第64-67页
   ·讨论第67-69页
第四章 栉孔扇贝C型凝集素基因的克隆及表达研究第69-82页
   ·简介第69-72页
     ·凝集素家族分类第69-70页
     ·C型凝集素在免疫过程中的作用第70-72页
   ·材料与方法第72-73页
     ·栉孔扇贝C型凝集素全长序列的克隆第72页
     ·栉孔扇贝C型凝集素全长序列一级结构和二级结构分析 第72页
     ·C型凝集素的表达第72-73页
   ·结果第73-79页
     ·C型凝集素全长序列的克隆第73-74页
     ·栉孔扇贝C型凝集素cDNA全长序列的特征分析 第74-75页
     ·同源性分析第75-78页
     ·C型凝集素基因的表达第78-79页
   ·讨论第79-82页
第五章 结论第82-83页
参考文献第83-99页
附表 免疫相关EST第99-108页
已发表和已接收文章第108-109页
已在GENBANK数据库中注册的序列第109-110页
致 谢第110页

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