目录 | 第1-5页 |
摘要 | 第5-7页 |
ABSTRACT | 第7-9页 |
文献综述 | 第9-29页 |
一、精神分裂症分子遗传学 | 第9-14页 |
(一) 精神分裂症研究策略 | 第9-10页 |
(二) 精神分裂症分子遗传学研究常用方法 | 第10-11页 |
(三) 连锁分析结果 | 第11-13页 |
(四) 关联分析结果 | 第13-14页 |
二、生物信息学数据库 | 第14-23页 |
(一) 生物信息学数据库概论 | 第14-16页 |
(二) 几个主要的生物信息数据库 | 第16-23页 |
三、人类突变数据库及其应用 | 第23-29页 |
(一) 突变数据库分类 | 第24-27页 |
(二) 突变数据库应用 | 第27-29页 |
前言 | 第29-33页 |
材料与方法 | 第33-53页 |
一、数据来源 | 第33-34页 |
二、数据库的构建、管理及 Web发布 | 第34-53页 |
(一) 开发环境 | 第34-35页 |
(二) 设计思路 | 第35-36页 |
(三) 本地数据库结构和数据模型的设计 | 第36-39页 |
(四) XML用于数据格式的转换 | 第39-41页 |
(五) 信息获取程序的设计和实现 | 第41-51页 |
(六) 查询显示 | 第51页 |
(七) 数据库的管理和维护 | 第51-52页 |
(八) 数据库的Web发布 | 第52-53页 |
结果 | 第53-68页 |
一、数据库结构 | 第53-60页 |
(一) 变异信息 | 第53-56页 |
(二) 参考序列信息 | 第56-58页 |
(三) 蛋白质特征的信息 | 第58页 |
(四) 酶信息 | 第58-60页 |
二、数据库内容 | 第60-63页 |
(一) 在各染色体上的基因统计 | 第60-61页 |
(二) 单核苷酸多态性变异统计 | 第61页 |
(三) 有关于nsSNPs的统计 | 第61-63页 |
三、数据库界面与查询 | 第63-68页 |
(一) 关键词查询 | 第63-65页 |
(二) 功能查询 | 第65-67页 |
(三) 根据染色体位置的图像进行查询 | 第67-68页 |
讨论 | 第68-78页 |
一、当前变异数据库存在的问题 | 第68-69页 |
二、VSD数据库的特点 | 第69-74页 |
(一) 位点特异数据库(专业数据库) | 第69-70页 |
(二) VSD在不同的水平上来定位多态位点 | 第70页 |
(三) VSD显示了蛋白质水平变异和蛋白质特征之间的关系 | 第70-72页 |
(四) VSD显示了非同义 SNPs和蛋白质特征之间的关系 | 第72-74页 |
三、在 VSD中整合数据 | 第74-76页 |
(一) XML作为数据格式的标准 | 第74-76页 |
(二) 数据库的管理与查询 | 第76页 |
四、展望 | 第76-78页 |
小结 | 第78-79页 |
附录 | 第79-89页 |
附录 A: Webget.pl | 第79-83页 |
附录 B: KEGG.pl | 第83-89页 |
参考文献 | 第89-98页 |
致谢 | 第98-99页 |
个人简历 | 第99页 |