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精神分裂症相关基因变异数据库的构建

目录第1-5页
摘要第5-7页
ABSTRACT第7-9页
文献综述第9-29页
 一、精神分裂症分子遗传学第9-14页
  (一) 精神分裂症研究策略第9-10页
  (二) 精神分裂症分子遗传学研究常用方法第10-11页
  (三) 连锁分析结果第11-13页
  (四) 关联分析结果第13-14页
 二、生物信息学数据库第14-23页
  (一) 生物信息学数据库概论第14-16页
  (二) 几个主要的生物信息数据库第16-23页
 三、人类突变数据库及其应用第23-29页
  (一) 突变数据库分类第24-27页
  (二) 突变数据库应用第27-29页
前言第29-33页
材料与方法第33-53页
 一、数据来源第33-34页
 二、数据库的构建、管理及 Web发布第34-53页
  (一) 开发环境第34-35页
  (二) 设计思路第35-36页
  (三) 本地数据库结构和数据模型的设计第36-39页
  (四) XML用于数据格式的转换第39-41页
  (五) 信息获取程序的设计和实现第41-51页
  (六) 查询显示第51页
  (七) 数据库的管理和维护第51-52页
  (八) 数据库的Web发布第52-53页
结果第53-68页
 一、数据库结构第53-60页
  (一) 变异信息第53-56页
  (二) 参考序列信息第56-58页
  (三) 蛋白质特征的信息第58页
  (四) 酶信息第58-60页
 二、数据库内容第60-63页
  (一) 在各染色体上的基因统计第60-61页
  (二) 单核苷酸多态性变异统计第61页
  (三) 有关于nsSNPs的统计第61-63页
 三、数据库界面与查询第63-68页
  (一) 关键词查询第63-65页
  (二) 功能查询第65-67页
  (三) 根据染色体位置的图像进行查询第67-68页
讨论第68-78页
 一、当前变异数据库存在的问题第68-69页
 二、VSD数据库的特点第69-74页
  (一) 位点特异数据库(专业数据库)第69-70页
  (二) VSD在不同的水平上来定位多态位点第70页
  (三) VSD显示了蛋白质水平变异和蛋白质特征之间的关系第70-72页
  (四) VSD显示了非同义 SNPs和蛋白质特征之间的关系第72-74页
 三、在 VSD中整合数据第74-76页
  (一) XML作为数据格式的标准第74-76页
  (二) 数据库的管理与查询第76页
 四、展望第76-78页
小结第78-79页
附录第79-89页
 附录 A: Webget.pl第79-83页
 附录 B: KEGG.pl第83-89页
参考文献第89-98页
致谢第98-99页
个人简历第99页

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