Abstract | 第1-14页 |
Section Ⅰ Literature Review | 第14-33页 |
Chapter 1 Background and history of conservation genetics | 第15-28页 |
·Background | 第15-17页 |
·Biodiversity | 第15页 |
·Conservation biology | 第15-17页 |
·Development history of conservation genetics | 第17-18页 |
·Definition and special interest items of conservation genetics | 第18-25页 |
·Definition and content of conservation genetics | 第18-20页 |
·Some special interest items in conservation genetics | 第20-25页 |
·Defining conservation units | 第20-21页 |
·Loss of variability and inbreeding depression | 第21-22页 |
·Levels of inbreeding depression and genetic load | 第22-23页 |
·Mutational meltdown | 第23-24页 |
·Rare does not mean depauperate/Depauperate does not mean bottlenecked | 第24-25页 |
References | 第25-28页 |
Chapter 2 Baekground, goals and organizations of the thesis | 第28-33页 |
·Applications of conservation genetics | 第28-29页 |
·Background of the thesis | 第29-31页 |
·Technical routes | 第31-32页 |
References | 第32-33页 |
Section Ⅱ Studies on Conservation Genetics of the giant panda | 第33-88页 |
Chapter 3 Formalin removal by critical point drying | 第34-43页 |
·Introduction | 第34-35页 |
·Materials and methods | 第35-39页 |
·Isolation of DNA | 第35-37页 |
·PCR amplification | 第37页 |
·Silver mirror test | 第37-38页 |
·PFGE | 第38页 |
·DNA Digestion and electrophoreis | 第38页 |
·Probe and Southern blotting | 第38页 |
·Hybridization and autoradiography | 第38-39页 |
·Results and discussion | 第39-41页 |
References | 第41-43页 |
Chapter 4 A new oligonucleotide probe for the giant panda | 第43-49页 |
·Introduction | 第43-44页 |
·Materials and methods | 第44-45页 |
·Materals | 第44页 |
·Isolation of DNA, DNA digestion and electrophoresis | 第44页 |
·Probe, Southern hybridization and autoradiography | 第44-45页 |
·Statistical analyses | 第45页 |
·Results | 第45-47页 |
·Discussion | 第47-48页 |
References | 第48-49页 |
Chapter 5 Genetic structure of the giant panda in the case of small fragmented populations | 第49-58页 |
·Introduction | 第49-50页 |
·Materials and methods | 第50-52页 |
·Sample collection | 第50页 |
·DNA preparation and DNA fingerprinting | 第50页 |
·Satistical analyses | 第50-52页 |
·Results and discussion | 第52-55页 |
References | 第55-58页 |
Chapter 6 Genetic differentiation and subspecies development of the giant panda | 第58-69页 |
·Introduction | 第58-59页 |
·Materials and methods | 第59-60页 |
·Sample collection and DNA preparation and DNA fingerprinting | 第59-60页 |
·Statistical analyses | 第60页 |
·Results | 第60-66页 |
·Analyses of DNA banding patterns | 第60-63页 |
·Reconstruction of the phylogenetic tree | 第63页 |
·Confirmation of subspecies development | 第63-65页 |
·Patterns of genetic differentiation of the giant panda | 第65-66页 |
·Discussion | 第66-67页 |
References | 第67-69页 |
Chapter 7 Population history of the giant panda | 第69-87页 |
·Introduction | 第69-71页 |
·Materials and methods | 第71-72页 |
·Material collection | 第71页 |
·Sample preparation and DNA fingerprinting | 第71页 |
·Population genetic analyses | 第71-72页 |
·Results | 第72-81页 |
·Migration patterns between sub-populations of each population | 第72-76页 |
·Analyses of population history of the giant panda | 第76-81页 |
·Discussion | 第81-84页 |
References | 第84-87页 |
Chapter 8 Recommendations for protecting giant pandas | 第87-88页 |
Section Ⅲ Other Issues of Conservation Genetics | 第88-129页 |
Chapter 9 Issue Ⅰ of Conservation Genetics: Loss of Genetic Variability | 第89-103页 |
·Case study-1: Loss of Genetic diversity in the Dabry's sturgeon | 第89-95页 |
·Introduction | 第89-90页 |
·Materials and methods | 第90-92页 |
·Materials | 第90页 |
·Isolation of DNA, DNA fingerprinting and statistical analyses | 第90-92页 |
·Results | 第92页 |
·Discussion | 第92-94页 |
References | 第94-95页 |
·Case study-2: Reduced Genetic Diversity in a Breeding Population of the Chinese Sucker, Myxocyrinus asiaticus Bleeker | 第95-99页 |
·Introduction | 第95-96页 |
·Materials and methods | 第96页 |
·Results | 第96-97页 |
·Discussion | 第97-98页 |
References | 第98-99页 |
·Case study-3: The influence of the Gezhouba Reservoir on the genetic diversity of Chinese sturgeon, Acipenser sinensis | 第99-103页 |
·Introduction | 第99页 |
·Materials and methods | 第99-100页 |
·Results | 第100页 |
·Discussion | 第100-102页 |
References | 第102-103页 |
Chapter 10 Issue Ⅱ of Conservation Genetics: Forensics | 第103-129页 |
·Development of species-specific probes | 第103-114页 |
·Development of Cervidae-specific probe | 第103-110页 |
·Introduction | 第103-104页 |
·Materials and methods | 第104页 |
·Materials | 第104页 |
·Probe preparation, DNA extraction and DNA fingerprinting | 第104页 |
·Results | 第104页 |
·Discussion | 第104-108页 |
References | 第108-110页 |
·Development of Felidae-specific probe | 第110-114页 |
·Introduction | 第110页 |
·Materials and methods | 第110-112页 |
·Results and discussion | 第112页 |
References | 第112-114页 |
·Applications of species-specific probes | 第114-123页 |
·Identifying carcasses of protected deer species using pta_2 probe | 第114-117页 |
·Introduction | 第114页 |
·Materials and methods | 第114-115页 |
·Materials | 第114-115页 |
·Isolation of DNA and DNA fingerprinting | 第115页 |
·Results | 第115页 |
·Discussion | 第115-116页 |
References | 第116-117页 |
·Identifying distribution of the Chinese tiger using pta_2 probe | 第117-123页 |
·Introduction | 第117页 |
·Materials and methods | 第117-118页 |
·Materials | 第117-118页 |
·DNA extraction and DNA fingerprinting | 第118页 |
·Results | 第118-120页 |
·Discussion | 第120-121页 |
References | 第121-123页 |
·Application of species-specific polymerase chain reaction in the forensic identification of tiger species | 第123-129页 |
·Introduction | 第123页 |
·Case report | 第123页 |
·Case study | 第123-125页 |
·Material collection | 第123-124页 |
·Isolation of DNA | 第124页 |
·Designing of species-specific primers | 第124-125页 |
·Results | 第125-126页 |
·Discussion | 第126-129页 |
Appendixes | 第129-138页 |
Appendix Ⅰ Publication list | 第130-132页 |
Appendix Ⅱ Acknowledgements | 第132-133页 |
Appendix Ⅲ DNA fingerprints for paternity testing | 第133-134页 |
Appendix Ⅳ The presence-absence matrix of restriction fragments of pandas from six populations | 第134-138页 |