T-DNA标签在水稻基因组中的分布与特征
| 致谢 | 第1-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 一、 文献综述 | 第13-28页 |
| 1 水稻基因组测序计划 | 第13-14页 |
| ·“基因组”及“基因组学”概念的提出 | 第13页 |
| ·水稻基因组测序计划研究现状 | 第13-14页 |
| 2 水稻功能基因组的研究 | 第14-19页 |
| ·水稻突变体库的构建 | 第14-15页 |
| ·获得T-DNA或转座子插入旁邻序列的方法 | 第15-18页 |
| ·利用正向遗传学和反向遗传学方法研究基因功能 | 第18-19页 |
| 3 农杆菌介导的水稻遗传转化 | 第19-23页 |
| ·农杆菌Ti质粒的发现 | 第19-21页 |
| ·农杆菌转化植物细胞的过程 | 第21-22页 |
| ·农杆菌介导的水稻转化的发展 | 第22-23页 |
| ·利用农杆菌转化法构建水稻突变体库 | 第23页 |
| 4 T-DNA整合的机理及特征 | 第23-27页 |
| ·T-DNA整合的机理 | 第23-25页 |
| ·T-DNA整合位点及其特性 | 第25-26页 |
| ·T-DNA整合的复杂结构 | 第26-27页 |
| ·T-DNA在植物基因组中的分布 | 第27页 |
| 5 本研究的内容、目的和意义 | 第27-28页 |
| 二、 材料和方法 | 第28-40页 |
| 1 植物材料、载体及水稻转化 | 第28-30页 |
| ·植物材料 | 第28页 |
| ·载体 | 第28-29页 |
| ·转化方法 | 第29-30页 |
| ·水稻愈伤组织的诱导和继代培养 | 第29页 |
| ·农杆菌培养 | 第29页 |
| ·共培养和抗性愈伤组织的选择 | 第29-30页 |
| ·转基因苗的获得 | 第30页 |
| 2 微量DNA的提取及转基因植株的检测 | 第30-31页 |
| ·水稻DNA小量提取方法 | 第30-31页 |
| ·转基因植株检测 | 第31页 |
| 3 T-DNA插入水稻旁邻序列的获得 | 第31-34页 |
| ·TAIL-PCR | 第31-32页 |
| ·TAIL-PCR产物的回收及测序 | 第32-34页 |
| 4 序列的生物信息学分析 | 第34-40页 |
| ·系统概述 | 第34-35页 |
| ·本地数据库的建立 | 第35-36页 |
| ·各模块的运作 | 第36-40页 |
| ·数据下载 | 第36-38页 |
| ·文件的转换和转入 | 第38-39页 |
| ·T-DNA旁邻序列的分析 | 第39-40页 |
| 三、 结果与分析 | 第40-58页 |
| 1 转基因植株的获得 | 第40页 |
| 2 T-DNA插入旁邻序列的获得 | 第40-41页 |
| 3 T-DNA在水稻基因组中的插入分布 | 第41-52页 |
| ·T-DNA在水稻12条染色体上的插入分布 | 第41-44页 |
| ·T-DNA在水稻基因组中各区域的插入分布 | 第44-52页 |
| 4 T-DNA整合的特征分析 | 第52-58页 |
| ·T-DNA插入位点附近染色体序列的特征 | 第52页 |
| ·T-DNA整合的特征 | 第52-58页 |
| 四、 讨论 | 第58-64页 |
| 1 农杆菌介导的水稻遗传转化体系的完善 | 第58页 |
| 2 T-DNA在水稻基因组中的非随机分布 | 第58-60页 |
| 3 水稻基因组饱和插入所需群体大小的估计 | 第60-61页 |
| 4 T-DNA整合的分子特征分析 | 第61-64页 |
| 参考文献 | 第64-75页 |
| 附录 | 第75-77页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文 | 第77页 |
