基于Tiling Array的拟南芥基因结构分析
摘要 | 第1-5页 |
ABSTRACT | 第5-12页 |
第一章 绪论 | 第12-21页 |
·生物信息相关知识 | 第13-16页 |
·基因芯片相关知识 | 第16-19页 |
·研究意义以及研究内容 | 第19-20页 |
·本文的结构 | 第20-21页 |
第二章 实验设计与方法 | 第21-28页 |
·实验平台 | 第21-23页 |
·Tiling array芯片原理 | 第21-22页 |
·数据处理软件 | 第22-23页 |
·实验内容 | 第23-28页 |
第三章 数据预处理 | 第28-36页 |
·基本思路 | 第28-29页 |
·DNA参考标准化理论方法 | 第29-31页 |
·模型 | 第29-30页 |
·参数估计 | 第30页 |
·芯片间的标准化 | 第30-31页 |
·算法流程 | 第31-33页 |
·实验分析 | 第33-36页 |
·实验数据 | 第33-34页 |
·数据制图 | 第34-35页 |
·实验小结 | 第35-36页 |
第四章 探针过滤 | 第36-49页 |
·问题描述 | 第36-37页 |
·方法探索Ⅰ | 第37-38页 |
·序列比对Ⅰ | 第37页 |
·探针过滤Ⅰ | 第37-38页 |
·实验小结Ⅰ | 第38页 |
·方法探索Ⅱ | 第38-40页 |
·序列比对Ⅱ | 第38页 |
·探针过滤Ⅱ | 第38-39页 |
·实验小结Ⅱ | 第39-40页 |
·方法探索Ⅲ | 第40-42页 |
·理论分析 | 第40-41页 |
·实验模拟 | 第41-42页 |
·实验小结Ⅲ | 第42页 |
·合并过滤 | 第42-47页 |
·基本思路 | 第42-44页 |
·参数估计 | 第44-45页 |
·结果分析 | 第45-47页 |
·实验结论 | 第47-49页 |
第五章 分割与注释 | 第49-66页 |
·片段分割 | 第49-53页 |
·理论基础 | 第49-51页 |
·实验模拟 | 第51-52页 |
·实验小结 | 第52-53页 |
·注释 | 第53-54页 |
·程序设计 | 第54-61页 |
·程序设计 | 第54-56页 |
·数据描述 | 第56-58页 |
·ProbeViewer软件分析 | 第58-61页 |
·识别基因结构实验 | 第61-65页 |
·过滤对比 | 第61-63页 |
·分段效果模拟 | 第63-65页 |
·实验结论 | 第65-66页 |
第六章 总结与展望 | 第66-68页 |
·全文总结 | 第66-67页 |
·后续展望 | 第67-68页 |
附录 | 第68-70页 |
参考文献 | 第70-73页 |
致谢 | 第73页 |