| 摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 缩略词表 | 第12-13页 |
| 资源家系测定性状的英文缩写 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-29页 |
| 1 常用分子遗传标记 | 第15-17页 |
| ·RFLP标记 | 第15页 |
| ·DNA指纹标记 | 第15-16页 |
| ·RAPD标记 | 第16页 |
| ·微卫星标记 | 第16页 |
| ·AFLP标记 | 第16-17页 |
| ·PCR-SSCP标记 | 第17页 |
| 2 新基因分离方法 | 第17-21页 |
| ·根据EST分离基因 | 第17-20页 |
| ·比较基因组学在分离新基因中的应用 | 第20页 |
| ·位置克隆在分离新基因中的应用 | 第20-21页 |
| 3.抗性的遗传与抗病育种 | 第21-25页 |
| ·抗性的遗传 | 第21页 |
| ·抗性基因 | 第21-24页 |
| ·主要组织相容性复合体 | 第22页 |
| ·NRAMP1基因 | 第22-23页 |
| ·干扰素基因 | 第23-24页 |
| ·大肠杆菌F18受体 | 第24页 |
| ·抗病育种的途径 | 第24-25页 |
| ·直接选择 | 第24-25页 |
| ·间接选择 | 第25页 |
| 4 拟分离基因的研究进展 | 第25-27页 |
| ·免疫相关蛋白家族C(immunity-related GTPase family,cinema,IRGC)基因 | 第25-26页 |
| ·抗黏病毒1(myxovirus resistance 1,MXI)基因 | 第26-27页 |
| 5 本研究的目的和意义 | 第27-29页 |
| 第二章 材料与方法 | 第29-38页 |
| 1 试验材料 | 第29-31页 |
| ·试验样品及性状测定 | 第29页 |
| ·DNA样品 | 第29页 |
| ·组织样品 | 第29页 |
| ·试验猪群及性状测定 | 第29页 |
| ·主要仪器和设备 | 第29页 |
| ·主要药品及试剂 | 第29-30页 |
| ·缓冲液和常用试剂的配制 | 第30-31页 |
| 2 试验方法 | 第31-37页 |
| ·猪基因组DNA的提取 | 第31页 |
| ·基因组DNA的浓度测定和质量检测 | 第31页 |
| ·利用RT-PCR方法扩增cDNA片段 | 第31-32页 |
| ·总RNA的提取 | 第31-32页 |
| ·cDNA第一链的合成 | 第32页 |
| ·RT-PCR反应 | 第32页 |
| ·RT-PCR反应产物的检测 | 第32页 |
| ·候选基因的确定及引物设计 | 第32-34页 |
| ·候选基因的确定 | 第33页 |
| ·引物设计 | 第33-34页 |
| ·PCR产物的回收、纯化、克隆测序 | 第34-35页 |
| ·PCR产物回收与纯化 | 第34页 |
| ·回收DNA片段与载体的连接 | 第34页 |
| ·感受态细胞的制备(CaCl_2法制备感受态) | 第34-35页 |
| ·连接产物的转化 | 第35页 |
| ·阳性克隆子鉴定及测序 | 第35页 |
| ·生物信息学分析相应软件 | 第35-36页 |
| ·猪候选基因组序列的扩增及部分SNP的PCR-RFLP检测 | 第36页 |
| ·引物设计 | 第36页 |
| ·PCR产物的酶切及检测 | 第36页 |
| ·组织表达谱分析 | 第36-37页 |
| 3 统计分析 | 第37-38页 |
| ·分子标记在不同猪种中的等位基因频率及基因型频率计算 | 第37页 |
| ·分子标记的基因效应分析 | 第37-38页 |
| 第三章 结果与分析 | 第38-65页 |
| 1 总RNA的提取 | 第38页 |
| 2 猪IRGC基因 | 第38-47页 |
| ·根据猪EST信息设计特异性引物及RT-PCR扩增结果 | 第38页 |
| ·猪IRGC基因cDNA序列生物信息学分析结果 | 第38-41页 |
| ·推导的IRGC蛋白质的基本特征分析 | 第41-45页 |
| ·蛋白质的结构及功能域分析 | 第41-42页 |
| ·IRGC编码氨基酸的保守结构域及3-D结构预测结果 | 第42-43页 |
| ·猪IRGC蛋白与部分物种IRGC的进化关系 | 第43-45页 |
| ·猪IRGC基因组序列的克隆、测序和序列分析 | 第45-46页 |
| ·猪IRGC基因的组织表达谱分析 | 第46-47页 |
| 3 猪MX1基因 | 第47-57页 |
| ·根据猪EST信息设计特异性引物及RT-PCR扩增结果 | 第47页 |
| ·猪MX1基因cDNA序列生物信息学分析结果 | 第47-50页 |
| ·推导的MX1蛋白质的基本特征分析 | 第50-54页 |
| ·蛋白质的结构及功能域分析 | 第50-51页 |
| ·MX1编码氨基酸的保守结构域及3-D结构预测结果 | 第51页 |
| ·猪MX1蛋白与部分物种MX1的进化关系 | 第51-54页 |
| ·猪MX1基因的组织表达谱分析 | 第54-55页 |
| ·猪MX1基因组序列的克隆、测序和序列分析 | 第55-56页 |
| ·猪MX1基因第12内含子遗传变异多态性检测 | 第56-57页 |
| 4 猪MX1基因在优质猪品系中的应用研究 | 第57-65页 |
| ·猪MX1基因多态性在不同猪群中的分布及应用 | 第57页 |
| ·猪MX1基因在大梅F2代生产中的应用 | 第57-60页 |
| ·MX1基因标记辅助选择技术在大白猪选育中的应用 | 第60-62页 |
| ·大白猪繁殖性能与抗病性能的选育 | 第60-61页 |
| ·大白后备猪生长发育后备猪生长发育测定结果 | 第61-62页 |
| ·MX1分子标记在大白猪群体中的应用 | 第62页 |
| ·MX1基因标记辅助选择在杜洛克中选育中的应用 | 第62-65页 |
| ·杜洛克繁殖性能的选育 | 第62-63页 |
| ·杜洛克后备猪生长发育测定结果 | 第63页 |
| ·MX1分子标记在杜洛克猪群体中的应用 | 第63-65页 |
| 第四章 讨论 | 第65-69页 |
| 1 分离猪基因cDNA序列的策略 | 第65页 |
| 2 候选基因序列以及基因结构的分析 | 第65-66页 |
| 3 候选基因预测的蛋白结构域、功能位点的分析 | 第66页 |
| 4 候选基因的SNPs研究 | 第66页 |
| 5 SNPs的生物学效应 | 第66-67页 |
| 6 猪MX1在不同群体中基因型频率分布和遗传效应分析 | 第67页 |
| 7 关于IRGC和MX1蛋白的进化树分析 | 第67-68页 |
| 8 组织表达谱分析 | 第68页 |
| 9 分子标记辅助选择在优质猪品系选育中的应用 | 第68-69页 |
| 小结 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-75页 |
| 附录 | 第75-80页 |
| 猪IRGC基因的基因组序列 | 第75-78页 |
| 猪IRGC基因的eDNA序列 | 第78-80页 |
| 致谢 | 第80页 |
