| 中文摘要 | 第1-5页 |
| 英文摘要 | 第5-9页 |
| 引言 | 第9-23页 |
| 1 植物远缘杂交的研究进展 | 第9-12页 |
| ·远缘杂交与新种的形成 | 第9-10页 |
| ·远缘杂交引起基因组遗传变异 | 第10页 |
| ·远缘杂交引起基因组甲基化变异 | 第10-11页 |
| ·远缘杂交引起基因表达的改变 | 第11页 |
| ·远缘杂交可激活沉默的转座元件 | 第11-12页 |
| 2 转座子的分子生物学研究进展 | 第12-17页 |
| ·转座子及其结构特点 | 第12-14页 |
| ·转座子与基因组进化 | 第14-16页 |
| ·转座子的应用 | 第16-17页 |
| 3 DNA 甲基化的分子生物学研究进展 | 第17-21页 |
| ·DNA甲基化 | 第17-18页 |
| ·DNA去甲基化 | 第18-19页 |
| ·DNA甲基化的生物学功能 | 第19-20页 |
| ·转座子活性与DNA甲基化的关系 | 第20-21页 |
| 4 本研究的目的、背景和意义 | 第21-23页 |
| 材料和方法 | 第23-35页 |
| 1 实验材料 | 第23页 |
| 2 实验方法 | 第23-35页 |
| ·实验材料的获得 | 第23页 |
| ·植物基因组DNA的提取与纯化 | 第23-24页 |
| ·Southern 杂交分析 | 第24-27页 |
| ·LTR类反转座子插入位点侧翼序列的克隆和序列分析 | 第27-30页 |
| ·PCR产物的纯化与克隆 | 第30页 |
| ·感受态细胞的制备、转化及α互补筛选 | 第30-31页 |
| ·DNA序列测定、同源性探寻及LTR类反转座子侧翼序列表达序列同源性分析 | 第31页 |
| ·亚硫酸盐测序 | 第31-33页 |
| ·植物总RNA的提取与RT-PCR | 第33-35页 |
| 结果与分析 | 第35-56页 |
| 1.菰DNA 渐渗诱导渐渗系RZ1、RZ2 和RZ35 中LTR 类反转座子发生结构变异 | 第35-39页 |
| ·Southern Blot估测LTR类反转座子的RT和LTR在松前和菰中的拷贝数 | 第35-37页 |
| ·菰DNA渐渗诱导水稻中LTR类反转座子发生重组 | 第37-39页 |
| 2 菰DNA 渐渗诱导渐渗系RZ1、RZ2 和RZ35 中LTR 类反转座子发生高频率的DNA 甲基化变异 | 第39-42页 |
| 3 LTR 类反转座子在转录水平上的活性 | 第42-44页 |
| 4 亚硫酸盐测序 | 第44-49页 |
| ·LTR 类反转座子Osr7、Osr42、Osr43 中CpG、CpHpG 甲基化发生频率高于CpHpH | 第44页 |
| ·菰DNA 渐渗诱导水稻内源LTR 类反转座子发生超甲基化和去甲基化变异 | 第44-49页 |
| 5 松前、渐渗系基因组中反转座子对侧翼序列表达的影响 | 第49-56页 |
| ·利用反转座子展示技术克隆到13个LTR类反转座子位点 | 第49-50页 |
| ·LTR类反转座子侧翼基因的表达分析 | 第50-56页 |
| 讨论 | 第56-60页 |
| 结论 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-73页 |
| 致谢 | 第73-74页 |
| 在学期间公开发表论文及著作情况 | 第74页 |
