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大豆疫霉转录组研究及GPR功能分析

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
引言第11-13页
上篇文献综述第13-34页
 第一章 疫霉菌转录组的研究方法与进展第14-22页
  1 转录组的研究方法第14-15页
  2 RNA-Seq技术的原理及操作路线第15页
  3 RNA-Seq技术的优点第15-17页
  4 RNA-Seq技术的应用第17页
  参考文献第17-22页
 第二章 真菌G蛋白偶联受体的研究进展第22-34页
  1 G蛋白偶联受体第22-24页
   ·G蛋白偶联受体的结构第22页
   ·G蛋白偶联受体的分类第22-23页
   ·G蛋白偶联受体的信号通路第23页
   ·G蛋白偶联受体的功能和意义第23-24页
  2 真菌G蛋白偶联受体第24-28页
   ·G蛋白偶联受体在子囊菌(Ascoycetes)中的研究第24-26页
   ·G蛋白偶联受体在担子菌(Basidiomycetes)中的研究第26-27页
   ·卵菌的G蛋白偶联受体第27-28页
  参考文献第28-34页
下篇研究内容第34-86页
 第一章 大豆疫霉不同阶段RNA-Seq分析第36-56页
  1 材料和方法第37-40页
   ·供试菌株第37-38页
   ·培养基制备第38页
   ·大豆疫霉RNA-Seq样品的准备第38-39页
   ·考马斯亮蓝染色第39页
   ·大豆疫霉侵染菌丝的显微观察第39页
   ·RNA的提取第39-40页
   ·信息分析路线第40页
   ·相关性分析方法第40页
  2 结果第40-51页
   ·与大豆Williams互作的大豆疫霉菌丝显微观察第40-41页
   ·大豆疫霉各个样品RNA的质量检测第41-42页
   ·大豆疫霉各个样品RNA测序结果的相关性分析第42-43页
   ·大豆疫霉RNA-Seq数据分析第43-48页
   ·大豆疫霉游动孢子阶段基因的分析第48-51页
     ·游动孢子阶段上调表达基因的分析第48-50页
     ·游动孢子阶段低表达基因的分析第50-51页
   ·对已预测的G蛋白偶联受体在游动孢子阶段表达量分析第51页
  3 讨论第51-53页
  参考文献第53-56页
 第二章 大豆疫霉PsGPR7的功能分析第56-76页
  1 材料和方法第57-66页
   ·供试菌株第57-58页
   ·大豆疫霉的培养第58页
   ·基因组DNA第58-59页
   ·基因组DNA和RNA的提取第59-60页
   ·大肠杆菌JM109感受态细胞的制备(SSCS法)第60页
   ·Southern blot第60-61页
   ·沉默载体的构建第61-62页
   ·大豆疫霉转化第62-64页
   ·沉默转化子的筛选第64-65页
   ·半定量RT-PCR第65页
   ·致病性分析第65页
   ·趋化性分析第65-66页
  2 结果与分析第66-72页
   ·PsGPR7生物信息学分析第66-67页
   ·PsGPR7的转录分析第67页
   ·PsGPR7在大豆疫霉基因组中的拷贝数验证第67-68页
   ·大豆疫霉PsGPR7沉默突变体的获得第68-69页
   ·沉默突变体的表型分析第69-72页
     ·菌丝生长速率和卵孢子产量第69-70页
     ·趋化性第70页
     ·致病性第70-71页
     ·休止孢的萌发率第71-72页
  3 讨论第72页
  参考文献第72-76页
 第三章 大豆疫霉PsGPR8的功能分析第76-86页
  1 材料和方法第77-78页
   ·供试菌株第77页
   ·大豆疫霉的培养第77页
   ·基因组DNA、质粒DNA和RNA的提取第77页
   ·沉默载体的构建第77-78页
   ·大豆疫霉转化第78页
   ·沉默转化子的筛选第78页
   ·逆转录程序第78页
   ·毒性分析第78页
   ·趋化性分析第78页
  2 结果与分析第78-83页
   ·PsGPR8生物信息学分析第78-79页
   ·PsGPR8的转录分析第79-80页
   ·大豆疫霉PsGPR8的基因沉默第80-81页
   ·沉默突变体的表型分析第81-83页
     ·菌丝生长速率和卵孢子产量第81页
     ·趋化性第81-82页
     ·致病性第82-83页
  3 讨论第83-84页
  参考文献第84-86页
攻读硕士学位期间发表的研究论文第86-88页
致谢第88页

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