摘要 | 第1-9页 |
ABSTRACT | 第9-11页 |
引言 | 第11-13页 |
上篇文献综述 | 第13-34页 |
第一章 疫霉菌转录组的研究方法与进展 | 第14-22页 |
1 转录组的研究方法 | 第14-15页 |
2 RNA-Seq技术的原理及操作路线 | 第15页 |
3 RNA-Seq技术的优点 | 第15-17页 |
4 RNA-Seq技术的应用 | 第17页 |
参考文献 | 第17-22页 |
第二章 真菌G蛋白偶联受体的研究进展 | 第22-34页 |
1 G蛋白偶联受体 | 第22-24页 |
·G蛋白偶联受体的结构 | 第22页 |
·G蛋白偶联受体的分类 | 第22-23页 |
·G蛋白偶联受体的信号通路 | 第23页 |
·G蛋白偶联受体的功能和意义 | 第23-24页 |
2 真菌G蛋白偶联受体 | 第24-28页 |
·G蛋白偶联受体在子囊菌(Ascoycetes)中的研究 | 第24-26页 |
·G蛋白偶联受体在担子菌(Basidiomycetes)中的研究 | 第26-27页 |
·卵菌的G蛋白偶联受体 | 第27-28页 |
参考文献 | 第28-34页 |
下篇研究内容 | 第34-86页 |
第一章 大豆疫霉不同阶段RNA-Seq分析 | 第36-56页 |
1 材料和方法 | 第37-40页 |
·供试菌株 | 第37-38页 |
·培养基制备 | 第38页 |
·大豆疫霉RNA-Seq样品的准备 | 第38-39页 |
·考马斯亮蓝染色 | 第39页 |
·大豆疫霉侵染菌丝的显微观察 | 第39页 |
·RNA的提取 | 第39-40页 |
·信息分析路线 | 第40页 |
·相关性分析方法 | 第40页 |
2 结果 | 第40-51页 |
·与大豆Williams互作的大豆疫霉菌丝显微观察 | 第40-41页 |
·大豆疫霉各个样品RNA的质量检测 | 第41-42页 |
·大豆疫霉各个样品RNA测序结果的相关性分析 | 第42-43页 |
·大豆疫霉RNA-Seq数据分析 | 第43-48页 |
·大豆疫霉游动孢子阶段基因的分析 | 第48-51页 |
·游动孢子阶段上调表达基因的分析 | 第48-50页 |
·游动孢子阶段低表达基因的分析 | 第50-51页 |
·对已预测的G蛋白偶联受体在游动孢子阶段表达量分析 | 第51页 |
3 讨论 | 第51-53页 |
参考文献 | 第53-56页 |
第二章 大豆疫霉PsGPR7的功能分析 | 第56-76页 |
1 材料和方法 | 第57-66页 |
·供试菌株 | 第57-58页 |
·大豆疫霉的培养 | 第58页 |
·基因组DNA | 第58-59页 |
·基因组DNA和RNA的提取 | 第59-60页 |
·大肠杆菌JM109感受态细胞的制备(SSCS法) | 第60页 |
·Southern blot | 第60-61页 |
·沉默载体的构建 | 第61-62页 |
·大豆疫霉转化 | 第62-64页 |
·沉默转化子的筛选 | 第64-65页 |
·半定量RT-PCR | 第65页 |
·致病性分析 | 第65页 |
·趋化性分析 | 第65-66页 |
2 结果与分析 | 第66-72页 |
·PsGPR7生物信息学分析 | 第66-67页 |
·PsGPR7的转录分析 | 第67页 |
·PsGPR7在大豆疫霉基因组中的拷贝数验证 | 第67-68页 |
·大豆疫霉PsGPR7沉默突变体的获得 | 第68-69页 |
·沉默突变体的表型分析 | 第69-72页 |
·菌丝生长速率和卵孢子产量 | 第69-70页 |
·趋化性 | 第70页 |
·致病性 | 第70-71页 |
·休止孢的萌发率 | 第71-72页 |
3 讨论 | 第72页 |
参考文献 | 第72-76页 |
第三章 大豆疫霉PsGPR8的功能分析 | 第76-86页 |
1 材料和方法 | 第77-78页 |
·供试菌株 | 第77页 |
·大豆疫霉的培养 | 第77页 |
·基因组DNA、质粒DNA和RNA的提取 | 第77页 |
·沉默载体的构建 | 第77-78页 |
·大豆疫霉转化 | 第78页 |
·沉默转化子的筛选 | 第78页 |
·逆转录程序 | 第78页 |
·毒性分析 | 第78页 |
·趋化性分析 | 第78页 |
2 结果与分析 | 第78-83页 |
·PsGPR8生物信息学分析 | 第78-79页 |
·PsGPR8的转录分析 | 第79-80页 |
·大豆疫霉PsGPR8的基因沉默 | 第80-81页 |
·沉默突变体的表型分析 | 第81-83页 |
·菌丝生长速率和卵孢子产量 | 第81页 |
·趋化性 | 第81-82页 |
·致病性 | 第82-83页 |
3 讨论 | 第83-84页 |
参考文献 | 第84-86页 |
攻读硕士学位期间发表的研究论文 | 第86-88页 |
致谢 | 第88页 |