摘要 | 第1-6页 |
Abstract | 第6-8页 |
目录 | 第8-10页 |
前言 | 第10-20页 |
一、分子标记技术 | 第10-16页 |
1 DNA分子标记 | 第10页 |
2 微卫星标记 | 第10-16页 |
·微卫星DNA的定义及其分类 | 第10-11页 |
·微卫星DNA的突变机制 | 第11-12页 |
·微卫星序列的分布与特点 | 第12页 |
·微卫星标记技术的不足之处 | 第12-13页 |
·多态性微卫星位点的筛选 | 第13-14页 |
·微卫星标记在野生濒危动物保护中的应用 | 第14-16页 |
二、野生濒危动物生存现状的研究概况 | 第16-19页 |
1 蛤蚧(Gekko gecko)生存现状以及研究概况 | 第17-18页 |
2 穿山甲(Manis spp.)生存现状以及研究概况 | 第18-19页 |
三、本研究的目的和意义 | 第19-20页 |
第一章 磁珠富集法制备蛤蚧的微卫星分子标记 | 第20-40页 |
一、材料及仪器设备 | 第20-21页 |
1 样品 | 第20页 |
2 主要试剂 | 第20页 |
3 主要仪器设备 | 第20-21页 |
二、方法 | 第21-32页 |
1 蛤蚧基因组DNA提取 | 第21-22页 |
·样本基因组DNA的提取 | 第21-22页 |
·基因组DNA的电泳检测 | 第22页 |
2 微卫星位点的筛选 | 第22-32页 |
·基因组DNA的酶切与片段回收 | 第22-24页 |
·选择性片段的连接及扩增 | 第24-25页 |
·一次PCR的纯化 | 第25-26页 |
·微卫星的富集和捕获 | 第26-29页 |
·二次PCR产物的纯化 | 第29页 |
·连接载体 | 第29页 |
·转化 | 第29页 |
·阳性克隆的筛选与鉴定 | 第29-31页 |
·测序 | 第31页 |
·PCR引物设计与筛选 | 第31-32页 |
3 微卫星数据的采集、整理和校正 | 第32页 |
4 微卫星数据的处理和分析 | 第32页 |
三、结果 | 第32-38页 |
1 微卫星检测结果 | 第32-35页 |
·微卫星序列分析 | 第32-33页 |
·微卫星引物检测结果 | 第33-35页 |
2 微卫星位点的数据分析 | 第35-38页 |
·12个位点的相关信息 | 第35-36页 |
·22个样本基因型 | 第36页 |
·蛤蚧群体杂和度及等位基因数统计结果 | 第36-37页 |
·多态信息含量(Polymorphic information content,PIC) | 第37页 |
·Hardy-weinberg平衡与连锁不平衡 | 第37-38页 |
四、讨论 | 第38-40页 |
1 磁珠富集法的优越性 | 第38页 |
2 微卫星DNA检测中的"影子带" | 第38-39页 |
3 微卫星分子标记在蛤蚧研究中的展望 | 第39-40页 |
第二章 微卫星标记在穿山甲个体识别中的应用 | 第40-49页 |
一、材料 | 第40页 |
1 样品 | 第40页 |
2 主要试剂 | 第40页 |
3 主要仪器设备 | 第40页 |
二、方法 | 第40-45页 |
1 基因组DNA提取 | 第40-41页 |
2 DNA电泳检测 | 第41-42页 |
3 PCR扩增和统计分析 | 第42-45页 |
·微卫星引物信息 | 第42-43页 |
·聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第43-44页 |
·统计分析 | 第44页 |
·匹配概率(Probability of matching,PM) | 第44页 |
·个体识别能力(Ddiscrimination power,DP) | 第44-45页 |
三、结果分析 | 第45-46页 |
1 6个微卫星基因座位的遗传多态性分析 | 第45页 |
2 6个位点个体识别能力的评估 | 第45-46页 |
3 个体识别 | 第46页 |
四、讨论 | 第46-49页 |
1 实验过程对结果的影响 | 第47页 |
2 系统树聚类分析的局限性 | 第47-48页 |
3 穿山甲的个体识别在制定群体遗传保护策略的展望 | 第48-49页 |
本研究的主要成果及创新点 | 第49-50页 |
1 本研究的主要成果 | 第49页 |
2 本研究的主要创新点 | 第49-50页 |
参考文献 | 第50-56页 |
附录 | 第56-60页 |
致谢 | 第60页 |