致谢 | 第5-6页 |
摘要 | 第6-9页 |
abstract | 第9-12页 |
1 绪论 | 第18-24页 |
1.1 沙蜥属简介 | 第18页 |
1.2 贵南沙蜥概述 | 第18页 |
1.3 沙蜥生活史研究概述 | 第18-20页 |
1.3.1 食性研究概况 | 第19页 |
1.3.2 种群性比与存活率研究概况 | 第19页 |
1.3.3 两性异形研究概况 | 第19-20页 |
1.4 脊椎动物体色研究概述 | 第20-22页 |
1.4.1 动物体色变异 | 第20页 |
1.4.2 体色变化的生态与遗传机制 | 第20-21页 |
1.4.3 MC1R基因概述 | 第21-22页 |
1.5 物种分布模型预测研究概述 | 第22-23页 |
1.5.1 物种模型预测简介 | 第22页 |
1.5.2 MAXENT模型研究概况 | 第22-23页 |
1.6 简化基因组测序研究概述 | 第23-24页 |
1.6.1 简化基因组测序简介 | 第23页 |
1.6.2 简化基因组测序研究进展 | 第23-24页 |
2 贵南沙蜥洞穴空间分布与食物资源分布特征的关系 | 第24-32页 |
2.1 材料与方法 | 第24-25页 |
2.1.1 调查方法 | 第24页 |
2.1.2 数据处理 | 第24-25页 |
2.2 结果 | 第25-31页 |
2.2.1 可利用昆虫资源组成 | 第25-28页 |
2.2.2 昆虫多样性分析 | 第28页 |
2.2.3 洞穴分布特征与昆虫资源分布特征 | 第28页 |
2.2.4 洞穴分布与昆虫资源分布关系 | 第28-31页 |
2.3 讨论 | 第31-32页 |
3 贵南沙蜥种群生长、存活、性比以及两性异形研究 | 第32-42页 |
3.1 材料与方法 | 第32-33页 |
3.1.1 数据收集 | 第32页 |
3.1.2 数据处理与分析 | 第32-33页 |
3.2 结果 | 第33-41页 |
3.2.1 存活率和性比 | 第33页 |
3.2.2 两性异形 | 第33-34页 |
3.2.3 成长率 | 第34-41页 |
3.3 讨论 | 第41-42页 |
4 贵南沙蜥与贵德沙蜥的体色变异与MC1R基因的进化研究 | 第42-48页 |
4.1 材料与方法 | 第42-44页 |
4.1.1 样本采集与表形测定 | 第42页 |
4.1.2 DNA抽提与MC1R基因全长序列的获取 | 第42-43页 |
4.1.3 数据分析以及基因网络图的构建 | 第43-44页 |
4.2 结果 | 第44-46页 |
4.2.1 MC1R样本全序列、变异位点与基因型 | 第44页 |
4.2.2 位点残基分布频率统计检验 | 第44-45页 |
4.2.3 MC1R基因网络图 | 第45-46页 |
4.3 讨论 | 第46-48页 |
5 基于MAXENT贵南沙蜥与贵德沙蜥潜在地理分布预测 | 第48-57页 |
5.1 材料与方法 | 第48-51页 |
5.1.1 贵南沙蜥与贵德沙蜥分布数据的获得与处理 | 第48-49页 |
5.1.2 环境变量的获取与处理 | 第49-50页 |
5.1.3 研究方法 | 第50-51页 |
5.2 结果 | 第51-55页 |
5.2.1 贵南沙蜥与贵德沙蜥的潜在适生区 | 第51-53页 |
5.2.2 变量因子对模型的贡献度 | 第53-54页 |
5.2.3 MAXENT模型预测能力检验 | 第54-55页 |
5.3 讨论 | 第55-57页 |
6 基于dd RAD-seq技术的贵南沙蜥与贵德沙蜥种群分化研究 | 第57-63页 |
6.1 材料与方法 | 第57-58页 |
6.1.1 样本采集 | 第57页 |
6.1.2 DNA提取与RAD测序 | 第57-58页 |
6.1.3 主成分判别分析 | 第58页 |
6.2 结果 | 第58-61页 |
6.2.1 dd RAD-seq结果 | 第58-59页 |
6.2.2 Cross-validation验证结果 | 第59页 |
6.2.3 主成分判别分析 | 第59-61页 |
6.3 讨论 | 第61-63页 |
7 结论、创新点与展望 | 第63-65页 |
7.1 结论 | 第63页 |
7.2 创新点 | 第63-64页 |
7.3 展望 | 第64-65页 |
参考文献 | 第65-76页 |
附录 | 第76-82页 |
附录一 贵南沙蜥与贵德沙蜥样本与地理分布 | 第76-77页 |
附录二 贵南沙蜥与贵德沙蜥各样本核酸变异位点与氨基酸变异位点 | 第77-78页 |
附录三 MC1R基因型对应样本编号 | 第78-80页 |
附录四 RAD测序样本编号及位置信息 | 第80-82页 |
作者简历 | 第82页 |