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猪DECR1基因SNPs筛选及其与部分经济性状相关性研究

摘要第1-6页
Abstract第6-12页
第一部分 文献综述第12-22页
 1 前言第12页
 2 DECRl基因国内外研究进展第12-15页
   ·DECR1基因概述第12-14页
   ·DECR1基因的定位、结构及蛋白质特性第14页
   ·DECR1基因遗传多态性研究第14-15页
 3 影响猪肉质性状基因概述第15-17页
 4 单核苷酸多态性(SNPs)技术第17-21页
   ·SNPs的概念及特点第17-18页
   ·SNPs检测方法第18-21页
     ·随机扩增多态性DNA(RAPD)技术第19页
     ·限制性片段长度多态性(RFLP)技术第19-20页
     ·PCR-SSCP技术第20-21页
 5 研究目的与意义第21-22页
第二部分 材料与方法第22-30页
 1 材料第22-23页
   ·试验用猪与耳样采集第22页
   ·主要仪器和设备第22页
   ·主要药品和试剂第22页
   ·试剂配制第22-23页
   ·主要分子生物学分析工具软件第23页
 2 实验方法第23-30页
   ·猪基因组DNA的提取第23-24页
   ·基因组DNA的浓度测定和质量检测第24页
   ·猪DECR1基因Exon2、Exon5的PCR扩增第24-26页
     ·PCR扩增引物的设计与合成第24-25页
     ·Exon2 PCR扩增反应条件第25页
     ·Exon5 PCR扩增反应条件第25-26页
     ·PCR扩增产物检测第26页
   ·猪DECRl基因Exon2、Exon5的PCR-SSCP分析第26-28页
     ·PCR扩增产物变性第26页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳第26-28页
       ·聚丙烯酰胺凝胶的制备第27页
       ·点样与电泳第27页
       ·银染第27-28页
   ·猪DECR1基因Exon2、Exon5的测序第28页
   ·统计分析第28-30页
第三部分 结果与分析第30-45页
 1 猪DECR1基因的序列分析第30-33页
   ·猪DECR1基因的突变位置第30页
   ·不同物种DECR1基因CDS序列的同源性分析第30-31页
   ·不同物种DECR1基因蛋白质同源性分析第31-33页
 2 DECR1基因SNP的筛选第33-34页
 3 DECR1基因Exon2、Exon5产物扩增及PCR-SSCP检测第34-36页
   ·猪DECR1基因Exon2产物扩增第34页
   ·猪DECR1基因Exon2的PCR-SSCP分析第34-35页
   ·猪DECR1基因Exon2的测序分析第35页
   ·猪DECR1基因Exon5产物扩增第35页
   ·猪DECR1基因Exon5的PCR-SSCP分析第35-36页
   ·猪DECR1基因Exon5的测序分析第36页
 4 DECR1基因Exon2、Exon5的遗传结构分析第36-41页
   ·DECR1基因Exon2的Hardy-Weinberg平衡检验第36-38页
   ·DECR1基因Exon2的多态性分析第38-39页
   ·DECR1基因Exon5的Hardy-Weinberg平衡检验第39-40页
   ·DECR1基因Exon5的多态性分析第40-41页
 5 DECR1基因Exon2、Exon5位点与大白猪肉质性状关联性分析第41-42页
   ·DECR1基因Exon2位点与大白猪肉质性状的关联性分析第41页
   ·DECR1基因Exon5位点与大白猪肉质性状的关联性分析第41-42页
 6 DECR1基因Exon2、Exon5位点与大白猪胴体性状关联性第42-45页
   ·DECR1基因Exon2位点与大白猪胴体性状的关联性分析第43-44页
   ·DECR1基因Exon5位点与大白猪胴体性状的关联性分析第44-45页
第四部分 讨论与结论第45-52页
 1 引物的设计第45-46页
 2 SNPs的筛选方法第46页
 3 不同物种DECR1基因同源性分析第46-47页
 4 猪DECR1基因各多态位点的遗传结构分析第47-49页
   ·猪DECR1基因Exon2多态位点的遗传结构分析第47-48页
   ·猪DECR1基因Exon5多态位点的遗传结构分析第48-49页
 5 大白猪DECR1基因各多态位点与肉质和胴体性状的相关性第49-51页
   ·Exon2多态性与大白猪肉质和胴体性状的相关性第49-50页
   ·Exon5多态性与大白猪肉质和胴体性状的相关性第50-51页
 6 结论第51-52页
参考文献第52-58页
致谢第58-59页
作者简介第59页

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