| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 插图索引 | 第10-11页 |
| 附表索引 | 第11-12页 |
| 第1章 绪论 | 第12-18页 |
| ·项目来源 | 第12页 |
| ·研究背景和意义 | 第12-14页 |
| ·国内外现状、水平与发展趋势 | 第14-16页 |
| ·本文的主要工作 | 第16-17页 |
| ·本文结构组织 | 第17-18页 |
| 第2章 基于图形的DNA序列相似性分析及进化树构建算法概述 | 第18-31页 |
| ·DNA序列的图形表示 | 第18-21页 |
| ·二维坐标轴的图形表示 | 第18-19页 |
| ·三维坐标轴的图形表示 | 第19-20页 |
| ·高维坐标轴的图形表示 | 第20-21页 |
| ·基于图形的序列相似性分析 | 第21-24页 |
| ·特征矩阵 | 第21-22页 |
| ·矩阵不变量 | 第22-23页 |
| ·向量之间的距离 | 第23页 |
| ·基于图形的DNA序列的相似性分析 | 第23-24页 |
| ·构建进化树 | 第24-30页 |
| ·传统的进化树构建算法 | 第24-26页 |
| ·用PHYLIP进行进化树构建 | 第26-27页 |
| ·模糊聚类分析在进化树中的运用 | 第27-30页 |
| ·小结 | 第30-31页 |
| 第3章 基于DNA序列的图形表示的相似性分析 | 第31-44页 |
| ·引言 | 第31页 |
| ·DNA序列的图形表示 | 第31-37页 |
| ·一种新的DNA序列的图形表示 | 第31-32页 |
| ·新图形的特性 | 第32-34页 |
| ·11个物种基因序列的JZ曲线组图形 | 第34-37页 |
| ·基于JZ曲线组的序列相似性分析 | 第37-43页 |
| ·一种基于JZ图形组的特征矩阵 | 第37-38页 |
| ·11个物种基因序列的相似性分析算法 | 第38-39页 |
| ·实验结果与分析 | 第39-43页 |
| ·小结 | 第43-44页 |
| 第4章 进化树构建算法 | 第44-60页 |
| ·引言 | 第44页 |
| ·基于谱图理论的模糊聚类的传递算法构建生物系统进化树 | 第44-48页 |
| ·谱图理论 | 第44-45页 |
| ·模糊聚类分析的传递算法 | 第45-46页 |
| ·一种新的构建进化树的算法描述 | 第46-48页 |
| ·实验结果与讨论 | 第48-59页 |
| ·对11个物种β球蛋白基因的第一个外显子聚类生成进化树 | 第48-52页 |
| ·对11个H1N1病毒NA基因聚类生成进化树 | 第52-56页 |
| ·对8个H1N1病毒NA基因片段聚类生成进化树 | 第56-59页 |
| ·小结 | 第59-60页 |
| 结论 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-68页 |
| 致谢 | 第68-69页 |
| 附录A (攻读硕士期间发表论文和参加的项目) | 第69页 |
