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雷蒙德氏棉基因组DNase I高敏感位点的鉴定

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
英文缩略表第11-12页
第一章 绪论第12-22页
    1.1 DHSs的研究及其应用第12-19页
        1.1.1 DHSs的特征第13页
        1.1.2 DHSs的鉴定方法第13-16页
        1.1.3 DHSs在基因组中的分布第16-18页
        1.1.4 DHSs在动物基因组研究中的应用第18-19页
        1.1.5 DHSs在植物基因组研究中的应用第19页
    1.2 雷蒙德氏棉的重要地位第19-20页
    1.3 本研究的目的及意义第20-22页
第二章 材料与方法第22-41页
    2.1 实验材料第22-25页
        2.1.1 雷蒙德氏棉幼叶第22页
        2.1.2 雷蒙德氏棉愈伤组织的培养第22-23页
        2.1.3 主要试剂第23-24页
        2.1.4 主要仪器第24-25页
    2.2 实验方法第25-39页
        2.2.1 细胞核的提取第25-27页
        2.2.2 包埋法提取高分子量DNA第27-28页
        2.2.3 高分子量DNA片段的末端修补第28-30页
        2.2.4 Adaptor1的连接第30页
        2.2.5 回收Adaptor1连接的HMW-DNA第30-31页
        2.2.6 MmeI酶切Adaptor1连接后的DNA片段并去磷酸化第31-32页
        2.2.7 磁珠回收小片段DNA第32-33页
        2.2.8 Adaptor2的连接第33页
        2.2.9 M-280珠子的碱处理第33-34页
        2.2.10 PCR扩增第34页
        2.2.11 PAGE纯化PCR产物第34-35页
        2.2.12 单克隆验证第35-38页
        2.2.13 DHSs文库的初步检测第38页
        2.2.14 DNase-seq的数据分析第38-39页
    2.3 本章小结第39-41页
第三章 结果与分析第41-58页
    3.1 雷蒙德氏棉DHSs文库构建的方法优化第41-51页
        3.1.1 PVP40和TritonX-100对细胞核提取的影响第41-43页
        3.1.2 最佳DNaseI用量的选择第43-44页
        3.1.3 高分子量DNA的回收和Adaptor1的连接第44-45页
        3.1.4 Adaptor2的连接及目的条带的扩增和纯化第45-46页
        3.1.5 DHSs文库的检测与保存第46-48页
        3.1.6 DHSs文库浓度的检测第48页
        3.1.7 DHSs文库条带大小的检测第48-49页
        3.1.8 小结第49-51页
    3.2 雷蒙德氏棉中DHSs的分布特征第51-57页
        3.2.1 DHSs在雷蒙德氏棉全基因中的分布第52-55页
        3.2.2 幼苗和愈伤组织中的DHSs在TSS和TTS及其附近的分布情况第55-57页
        3.2.3 DHSs在水稻和棉花基因组中的分布差异第57页
    3.3 小结第57-58页
第四章 总结与展望第58-60页
    4.1 总结第58-59页
    4.2 展望第59-60页
参考文献第60-68页
致谢第68-70页
攻读学位期间发表学术论文目录第70-71页

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