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基于转录组测序的中国水仙成花基因的研究

缩略词表第9-10页
摘要第10-12页
Abstract第12-14页
第一章 前言第15-24页
    1 植物成花调控的研究进展第15-21页
        1.1 光周期途径第15-17页
        1.2 春化途径第17-18页
        1.3 自主途径第18-19页
        1.4 赤霉素途径第19-20页
        1.5 温度途径第20-21页
    2 中国水仙花芽分化的研究进展第21-22页
        2.1 中国水仙花芽分化的过程第21页
        2.2 中国水仙花芽分化研究进展第21-22页
    3 SOC1及AGL6基因的研究进展第22-23页
        3.1 SOC1基因的研究进展第22页
        3.2 AGL6基因的研究进展第22-23页
    4 本研究的目的和意义第23-24页
第二章 中国水仙成花相关基因的筛选第24-37页
    1 试验材料第24页
    2 试验方法第24-25页
        2.1 中国水仙主芽总RNA的提取第24-25页
        2.2 转录组测序第25页
            2.2.1 测序第25页
            2.2.2 生物信息学分析第25页
    3 结果与分析第25-34页
        3.1 中国水仙主芽总RNA的提取第25-26页
        3.2 测序与组装结果分析第26-27页
        3.3 转录组序列功能注释第27-31页
            3.3.1 NR数据库注释第28页
            3.3.2 GO数据库注释第28-29页
            3.3.3 COG数据库注释第29-31页
            3.3.4 代谢途径分析第31页
        3.4 成花相关基因分析第31-34页
    4 讨论第34-37页
        4.1 中国水仙主芽转录组测序分析第34-35页
        4.2 中国水仙成花的调控途径第35-37页
第三章 中国水仙成花基因的表达分析第37-47页
    1 试验材料第37页
    2 试验方法第37-39页
        2.1 水仙总RNA的提取及检测第37页
        2.2 cDNA的合成第37-38页
        2.3 中国水仙开花途径相关基因引物设计第38-39页
        2.4 荧光定量PCR反应第39页
            2.4.1 荧光定量PCR反应体系第39页
            2.4.2 荧光定量PCR反应程序第39页
    3 结果与分析第39-44页
        3.1 RNA质量检测第39-40页
        3.2 中国水仙不同组织器官中11个基因的表达分析第40-42页
        3.3 中国水仙不同花芽分化时期11个基因的表达分析第42-44页
    4 讨论第44-47页
第四章 中国水仙NtSOC1基因克隆及功能分析第47-63页
    1 试验材料第47页
    2 试验方法第47-51页
        2.1 水仙总RNA的提取及检测第47页
        2.2 cDNA的合成第47-48页
        2.3 中国水仙NtSOC1基因的克隆第48页
            2.3.1 NtSOC1基因3'末端序列分离第48页
            2.3.2 NtSOC1基因ORF的获取第48页
        2.4 NtSOC1序列的生物信息学分析第48页
        2.5 NtSOC1基因的表达分析第48-49页
        2.6 NtSOC1基因植物超表达载体的构建第49-50页
        2.7 NtSOC1基因的亚细胞定位第50页
        2.8 NtSOC1基因烟草的转化第50-51页
            2.8.1 烟草预培养第50页
            2.8.2 共培养第50页
            2.8.3 抗性芽筛选第50页
            2.8.4 生根培养第50-51页
            2.8.5 炼苗及移栽第51页
            2.8.6 烟草抗性植株的分子鉴定第51页
            2.8.7 NtSOC1基因在烟草中的表达分析第51页
    3 结果与分析第51-61页
        3.1 NtSOC1基因的克隆和序列分析第51-54页
            3.1.1 NtSOC1基因的克隆第51-52页
            3.1.2 NtSOC1基因生物信息学分析第52-54页
        3.2 NtSOC1在中国水仙不同组织和花芽不同分化阶段的表达分析第54-55页
        3.3 NtSOC1基因植物超表达载体的构建第55-56页
        3.4 NtSOC1基因编码蛋白的亚细胞定位第56-57页
        3.5 NtSOC1基因烟草的遗传转化第57-61页
            3.5.1 烟草外植体的转化及培养第58页
            3.5.2 转基因植株分子鉴定第58页
            3.5.3 转基因烟草植株的性状观察第58-59页
            3.5.4 NtSOC1在转基因烟草植株中的表达分析第59-61页
    4 讨论第61-63页
第五章 中国水仙NtAGL61基因克隆及功能分析第63-75页
    1 试验材料第63页
    2 试验方法第63-65页
        2.1 水仙总RNA的提取检测及cDNA的合成第63页
        2.2 中国水仙NtAGL61基因的克隆第63页
        2.3 NtAGL61序列的生物信息学分析第63页
        2.4 NtAGL61基因的表达分析第63-64页
        2.5 NtAGL61基因植物超表达载体的构建第64页
        2.6 NtAGL61基因的亚细胞定位第64页
        2.7 NtAGL61基因烟草的转化和检测第64-65页
    3 结果与分析第65-73页
        3.1 NtAGL61基因的克隆和序列分析第65-68页
            3.1.1 NtAGL61基因的克隆第65页
            3.1.2 NtAGL61基因生物信息学分析第65-68页
        3.2 NtAGL61在中国水仙不同组织和花芽不同分化阶段的表达分析第68-69页
        3.3 NtAGL61基因植物表达载体的构建第69页
        3.4 NtAGL61基因编码蛋白的亚细胞定位第69-70页
        3.5 转NtAGL61基因烟草的表型观察第70-73页
            3.5.1 NtAGL61转基因烟草植株鉴定与观察第70-72页
            3.5.2 NtAGL61在转基因烟草植株中的表达分析第72-73页
    4 讨论第73-75页
第六章 总结与展望第75-77页
参考文献第77-88页
附录 中国水仙Unigene的KEGG通路分析第88-91页
硕士期间的科研成果第91-92页
致谢第92页

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