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堆肥过程中硝化细菌和反硝化细菌多样性的分析

摘要第8-9页
Abstract第9页
1 前言第10-18页
    1.1 堆肥第10-12页
        1.1.1 堆肥化概述第10页
        1.1.2 堆肥化的发展第10-11页
        1.1.3 堆肥化微生物学研究进展第11-12页
    1.2 硝化及反硝化作用第12-16页
        1.2.1 氮循环第12页
        1.2.2 硝化作用第12-14页
        1.2.3 反硝化作用第14-16页
    1.3 本实验的研究目的和意义第16-17页
    1.4 本研究的技术路线第17-18页
2 材料与方法第18-29页
    2.1 实验材料第18页
        2.1.1 堆肥原料及理化性质第18页
        2.1.2 功能菌剂和堆肥接种及取样方法第18页
    2.2 试验仪器设备第18页
    2.3 常用溶液配方第18-21页
        2.3.1 DNA提取纯化实验试剂第18-19页
        2.3.2 变性梯度凝胶电泳药品的配制第19-21页
    2.4 实验方法第21-29页
        2.4.1 堆肥建堆第21页
        2.4.2 堆肥温度测量第21页
        2.4.3 堆肥全碳、全氮、C/N、NH4+-N、N03--N的测定第21-22页
        2.4.4 堆肥样品总DNA粗提取第22页
        2.4.5 DNA电泳检验第22页
        2.4.6 基因组总DNA的纯化第22页
        2.4.7 硝化细菌和反硝化细菌的PCR扩增第22-26页
        2.4.8 变性梯度凝胶电泳操作步骤第26-27页
        2.4.9 硝酸银染色第27页
        2.4.10 DGGE图谱分析第27页
        2.4.11 DGGE条带回收和目的片段的测序第27-28页
        2.4.12 系统发育分析第28-29页
3 结果与分析第29-43页
    3.1 堆肥过程中温度的变化第29页
    3.2 堆肥过程中全碳、全氮、C/N的变化第29-30页
    3.3 堆肥过程中NH_4+-N、NO_3~--N、NH_4~+-N/NO_3~--N的变化第30-31页
    3.4 堆肥中硝化细菌的多样性分析第31-37页
        3.4.1 硝化细菌amoA基因的DGGE电泳第31-33页
        3.4.2 硝化菌图谱多样性指数分析第33页
        3.4.3 硝化菌的DGGE聚类分析(UPGAMA)第33-35页
        3.4.4 硝化细菌amoA基因的系统发育分析第35-37页
    3.5 堆肥中反硝化细菌的多样性分析第37-43页
        3.5.1 反硝化菌DGGE图谱分析第37-39页
        3.5.2 反硝化菌nosZ基因DGGE图谱多样性指数分析第39页
        3.5.3 反硝化菌的DGGE聚类分析(UPGAMA)第39-41页
        3.5.4 反硝化细菌nosZ基因的系统发育分析第41-43页
4 讨论第43-46页
    4.1 amoA引物的选择第43页
    4.2 单对引物和多对引物的区别第43-44页
    4.3 温度及添加菌剂对堆肥过程中硝化细菌和反硝化细菌多样性的影响第44页
    4.4 系统进化树分析第44-46页
5 结论第46-47页
致谢第47-48页
参考文献第48-52页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第52页

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