| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 第1章 绪论 | 第9-16页 |
| 1.1 课题背景及研究的目的和意义 | 第9-10页 |
| 1.1.1 课题研究的背景 | 第9页 |
| 1.1.2 课题研究的目的和意义 | 第9-10页 |
| 1.2 国内外研究现状及分析 | 第10-14页 |
| 1.2.1 国内外研究现状 | 第10-13页 |
| 1.2.2 研究现状分析 | 第13-14页 |
| 1.3 本文的主要研究内容 | 第14页 |
| 1.4 本文的结构安排 | 第14-16页 |
| 第2章 理论基础 | 第16-31页 |
| 2.1 基本概念 | 第16-18页 |
| 2.1.1 拷贝数 | 第16-17页 |
| 2.1.2 DNA 甲基化 | 第17页 |
| 2.1.3 基因表达 | 第17-18页 |
| 2.1.4 基因突变 | 第18页 |
| 2.2 可视化形式 | 第18-21页 |
| 2.2.1 染色体 G 带图 | 第18页 |
| 2.2.2 热图 | 第18页 |
| 2.2.3 箱线图 | 第18-20页 |
| 2.2.4 比例图 | 第20页 |
| 2.2.5 K-M Plot | 第20-21页 |
| 2.3 主流的可视化技术比较及选取 | 第21-23页 |
| 2.3.1 Canvas | 第21-22页 |
| 2.3.2 SVG | 第22-23页 |
| 2.3.3 Flash | 第23页 |
| 2.3.4 可视化技术比较及选取 | 第23页 |
| 2.4 坐标体系比较及选取 | 第23-25页 |
| 2.5 颜色模型比较及选取 | 第25-27页 |
| 2.5.1 RGB 模型 | 第25页 |
| 2.5.2 HSI 颜色模型 | 第25-26页 |
| 2.5.3 颜色模型选取 | 第26-27页 |
| 2.6 可视化算法 | 第27-29页 |
| 2.6.1 直线生成算法 | 第27-28页 |
| 2.6.2 颜色填充算法 | 第28-29页 |
| 2.7 图形区分理论 | 第29-30页 |
| 2.7.1 图像的质量 | 第29-30页 |
| 2.7.2 人眼视觉现象 | 第30页 |
| 2.8 本章小结 | 第30-31页 |
| 第3章 癌症基因组数据预处理 | 第31-43页 |
| 3.1 HEATMAP 数据预处理 | 第31-37页 |
| 3.1.1 copy number 型数据预处理 | 第31-35页 |
| 3.1.2 Gene expression 型数据预处理 | 第35-37页 |
| 3.2 箱线图数据预处理 | 第37-40页 |
| 3.2.1 copy number 型数据 | 第37-38页 |
| 3.2.2 gene expression 型数据 | 第38-40页 |
| 3.3 PROPORTIONS 图数据预处理 | 第40页 |
| 3.4 K-M PLOT 数据预处理 | 第40-41页 |
| 3.5 CYTOBAND 数据预处理 | 第41-42页 |
| 3.6 本章小结 | 第42-43页 |
| 第4章 癌症基因组数据可视化系统设计与实现 | 第43-55页 |
| 4.1 系统总体需求分析 | 第43页 |
| 4.2 系统功能需求分析 | 第43-44页 |
| 4.2.1 cytoband 绘制模块 | 第43页 |
| 4.2.2 热图绘制模块 | 第43-44页 |
| 4.2.3 临床信息模块 | 第44页 |
| 4.2.4 箱线图绘制模块 | 第44页 |
| 4.2.5 比例图绘制模块 | 第44页 |
| 4.2.6 生存曲线 K-M plot | 第44页 |
| 4.3 系统总体结构设计 | 第44-47页 |
| 4.3.1 前端页面布局 | 第44-45页 |
| 4.3.2 数据字典 | 第45-47页 |
| 4.4 系统实现 | 第47-54页 |
| 4.4.1 cytoband 实现 | 第48页 |
| 4.4.2 热图绘制模块 | 第48-50页 |
| 4.4.3 临床信息可视化 | 第50-52页 |
| 4.4.4 箱线图绘制模块 | 第52-53页 |
| 4.4.5 比例图绘制模块 | 第53-54页 |
| 4.4.6 悬浮信息显示模块 | 第54页 |
| 4.4.7 生存曲线绘制模块 | 第54页 |
| 4.5 本章小结 | 第54-55页 |
| 第5章 系统测试及改进 | 第55-59页 |
| 5.1 系统特点 | 第55页 |
| 5.2 系统测试 | 第55-58页 |
| 5.2.1 性能测试 | 第55-56页 |
| 5.2.2 兼容性测试 | 第56-58页 |
| 5.3 系统评价及改进 | 第58页 |
| 5.4 本章小结 | 第58-59页 |
| 结论 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-63页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第63-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |