摘要 | 第5-7页 |
Abstract | 第7-8页 |
缩略词 | 第12-15页 |
第一章 前言 | 第15-36页 |
1.1 植物响应创伤机制研究进展 | 第16-23页 |
1.1.1 创伤对植物的影响 | 第16-17页 |
1.1.2 创伤与抗氧化系统 | 第17-18页 |
1.1.3 创伤与次生代谢 | 第18页 |
1.1.4 创伤信号转导与基因表达调控 | 第18-23页 |
1.2 茶树创伤应答反应研究概况 | 第23-24页 |
1.3 转录组学研究概况 | 第24-31页 |
1.3.1 转录组学概述 | 第24-25页 |
1.3.2 转录组测序 | 第25-31页 |
1.4 ERF转录因子研究概况 | 第31-34页 |
1.4.1 ERF转录因子结构特点 | 第31-32页 |
1.4.2 ERF转录因子的功能 | 第32-33页 |
1.4.3 茶树ERF转录因子研究概况 | 第33-34页 |
1.5 研究意义、内容和技术路线 | 第34-36页 |
1.5.1 研究意义 | 第34页 |
1.5.2 研究内容 | 第34-35页 |
1.5.3 技术路线 | 第35-36页 |
第二章 茶树创伤转录组分析 | 第36-61页 |
引言 | 第36页 |
2.1 试验材料及其处理方法 | 第36-37页 |
2.2 研究方法 | 第37-39页 |
2.2.1 RNA提取和质量分析 | 第37页 |
2.2.2 文库的构建和测序 | 第37页 |
2.2.3 测序数据过滤和序列的组装 | 第37-38页 |
2.2.4 组装序列的验证 | 第38页 |
2.2.5 组装序列去冗余 | 第38页 |
2.2.6 组装序列的功能注释和聚类 | 第38页 |
2.2.7 表达量统计及差异表达转录本的筛选 | 第38-39页 |
2.2.8 Real time PCR验证 | 第39页 |
2.3 结果与分析 | 第39-58页 |
2.3.1 RNA提取及质量检测 | 第39-41页 |
2.3.2 测序数据 | 第41页 |
2.3.3 测序数据组装与组装质量检测 | 第41-43页 |
2.3.4 组装结果ORF预测 | 第43页 |
2.3.5 组装结果功能注释 | 第43-50页 |
2.3.6 差异表达转录本筛选与分析 | 第50-51页 |
2.3.7 转录因子家族表达模式分析 | 第51-54页 |
2.3.8 信号转导通路分析 | 第54-55页 |
2.3.9 次级代谢途径分析 | 第55-58页 |
2.4 讨论 | 第58-61页 |
第三章 CsERFα基因的克隆与分析 | 第61-77页 |
引言 | 第61页 |
3.1 试验材料 | 第61-62页 |
3.2 实验方法 | 第62-70页 |
3.2.1 茶树总RNA提取、cDNA的合成 | 第62-64页 |
3.2.2 CsERFα基因的克隆 | 第64-66页 |
3.2.3 CsERFα基因的生物信息学分析 | 第66页 |
3.2.4 CsERFα基因的烟草转化 | 第66-70页 |
3.3 结果与分析 | 第70-76页 |
3.3.1 CsERFα基因在创伤过程中的表达变化 | 第70页 |
3.3.2 CsERFα基因的克隆 | 第70-71页 |
3.3.3 CsERFα基因编码蛋白的生物信息学分析 | 第71-76页 |
3.3.4 CsERFα基因的烟草转化及转化子的筛选与鉴定 | 第76页 |
3.4 讨论 | 第76-77页 |
第四章 结论 | 第77-79页 |
致谢 | 第79-80页 |
参考文献 | 第80-90页 |
攻读学位期间获得与学位论文相关的科研成果目录 | 第90-91页 |
附录 | 第91-94页 |