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微滴式数字PCR技术检测肺癌血浆游离DNA中的EGFR及KRAS基因的方法建立

摘要第5-7页
ABSTRACT第7-8页
缩写表第12-13页
第一章 绪论第13-23页
    1.1 肺癌研究进展第13-14页
    1.2 血浆游离DNA应用肺癌研究第14-16页
    1.3 微滴式数字PCR技术第16-21页
        1.3.1 数字PCR技术发展史第16-17页
        1.3.2 数字PCR技术介绍及与其他技术比较第17-18页
        1.3.3 数字PCR技术的四种平台第18-19页
        1.3.4 数字PCR应用第19-21页
    1.4 研究的意义第21-23页
第二章 实验材料和实验方法第23-44页
    2.1 主要试剂第23页
    2.2 实验样本第23页
        2.2.1 测试样本第23页
        2.2.2 临床样本第23页
    2.3 实验设备第23-24页
    2.4 样本准备第24-28页
        2.4.1 对照品制备YH细胞的DNA提取第24页
        2.4.2 血浆游离DNA提取(血浆分离)第24-26页
        2.4.3 组织样本提取第26-27页
        2.4.4 质控品的制备第27-28页
    2.5 引物及探针的设计第28-31页
        2.5.1 引物的设计第28页
        2.5.2 探针的设计第28-29页
        2.5.3 引物及探针的设计原则第29-31页
    2.6 QPCR染料法及探针法实验流程第31-34页
        2.6.1 采用Q-PCR染料法(SYBR-GREEN)测试第31-34页
        2.6.2 Q-PCR(探针法)测试流程第34页
    2.7 五个位点探针的筛选过程第34-40页
        2.7.1 EGFR18探针筛选过程第34-36页
        2.7.2 EGFR19探针筛选过程第36-37页
        2.7.3 EGFR20探针筛选过程第37-38页
        2.7.4 EGFR21探针筛选过程第38-40页
        2.7.5 KRAS探针筛选过程第40页
    2.8 DDPCR检测过程第40页
        2.8.1 按照如下流程进行DDPCR检测第40页
    2.9 下机数据分析流程第40-44页
        2.9.1 EGFR18/EGFR19/KRAS信息分析流程第40-42页
        2.9.2 EGFR20/EGFR21信息分析流程第42-44页
第三章 结果与分析第44-58页
    3.1 引物测试结果第44-46页
        3.1.1 引物的特异性与扩增效果第44页
        3.1.2 退火温度选择第44-46页
    3.2 探针测试结果第46-47页
    3.3 反应酶、缓冲液第47-48页
    3.4 引物浓度第48-49页
    3.5 探针浓度第49-50页
    3.6 最终体系确定第50页
    3.7 反应条件第50-53页
        3.7.1 退火/延伸温度第51页
        3.7.2 变性时间第51-52页
        3.7.3 退火/延伸时间第52-53页
    3.8 标准品及临床样本验证第53-58页
        3.8.1 检出限第53页
        3.8.2 准确性第53页
        3.8.3 敏感性第53-57页
        3.8.4 临床样本验证结果第57-58页
第四章 结论与展望第58-60页
    4.1 结论第58-59页
    4.2 展望第59-60页
参考文献第60-65页
附录第65-69页
攻读硕士学位期间取得的研究成果第69-70页
致谢第70-71页
附件第71页

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