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基于定点切除和COLD-PCR技术对基因损伤的检测

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 绪论第17-28页
    1.1 基因损伤的种类第17-19页
        1.1.1 物理损伤第17页
        1.1.2 化学损伤第17页
        1.1.3 自发性损伤第17-19页
    1.2 体内基因损伤的调控机制第19-20页
        1.2.1 蛋白传感器第19页
        1.2.2 转导蛋白第19-20页
        1.2.3 效应蛋白第20页
    1.3 基因损伤的检测方法第20-22页
        1.3.1 单细胞凝胶电泳第20-21页
        1.3.2 荧光原位杂交法第21页
        1.3.3 DNA片段标记第21-22页
    1.4 碱基切除修复技术第22-23页
        1.4.1 碱基切除修复技术的简介第22-23页
        1.4.2 碱基切除修复技术的研究现状第23页
    1.5 COLD-PCR第23-27页
        1.5.1 COLD-PCR的原理第24页
        1.5.2 COLD-PCR模式第24-26页
        1.5.3 COLD-PCR研究进展第26-27页
    1.6 论文主要研究内容第27-28页
第二章 DNA损伤的检测第28-54页
    2.1 实验研究目的和意义第28页
    2.2 实验材料及仪器第28-30页
        2.2.1 实验主要试剂第28-29页
        2.2.2 实验主要仪器第29页
        2.2.3 实验所用寡核苷酸序列第29-30页
    2.3 定点切除修复第30-36页
        2.3.1 DNA寡核苷酸链溶液的配制第30-31页
        2.3.2 定点切除修复第31-33页
        2.3.3 熔解曲线的监测第33-34页
        2.3.4 核酸探针杂交实验第34-36页
    2.4 特异性杂交的热力学变化第36-37页
    2.5 DNA损伤的检测第37-38页
        2.5.1 COLD-PCR扩增第37-38页
        2.5.2 Tc值的选择第38页
    2.6 反应模式的选择和优化第38-39页
        2.6.1 COLD-PCR反应模式的选择第38-39页
        2.6.2 T4 DNA连接酶反应时间的优化第39页
    2.7 实验结果与讨论第39-52页
        2.7.1 核酸探针杂交实验结果第39-40页
        2.7.2 熔解曲线监测结果第40-43页
        2.7.3 不同Tc值对检测效果的影响第43-46页
        2.7.4 不同特异性杂交的吉布斯自由能差第46-48页
        2.7.5 COLD-PCR扩增实验结果第48-49页
        2.7.6 不同个数的碱基损伤的检测第49-50页
        2.7.7 两种COLD-PCR模式结果的比较结果第50-51页
        2.7.8 T4 DNA连接酶反应时间优化结果第51-52页
    2.8 本章小结第52-54页
第三章 DNA损伤检测灵敏度的研究第54-65页
    3.1 实验研究目的和意义第54页
    3.2 实验材料及仪器第54-55页
        3.2.1 实验主要试剂第54页
        3.2.2 实验主要仪器第54-55页
        3.2.3 实验所用寡核苷酸序列第55页
    3.3 DNA损伤的低丰度检测第55-57页
        3.3.1 C>U损伤的低丰度检测第55-56页
        3.3.2 G>8-oxoG氧化损伤的低丰度检测第56-57页
    3.4 修复酶活性的检测第57-58页
        3.4.1 UDG活性的检测第57-58页
        3.4.2 hOGG1活性的检测第58页
    3.5 实验结果与讨论第58-64页
        3.5.1 DNA损伤低丰度检测结果第58-61页
        3.5.2 修复酶活性检测的结果第61-64页
    3.6 本章小结第64-65页
第四章 活性氧引起的DNA氧化损伤的检测第65-80页
    4.1 实验研究的目的及意义第65页
    4.2 实验材料及仪器第65-67页
        4.2.1 实验主要仪器第65-66页
        4.2.2 实验主要试剂第66页
        4.2.3 实验所用的DNA序列第66-67页
    4.3 H_2O_2引起的DNA寡核苷酸链的损伤第67-68页
        4.3.1 H_2O_2处理DNA链第67页
        4.3.2 碱基切除修复第67-68页
        4.3.3 COLD-PCR对基因损伤的检测第68页
    4.4 细胞的准备与培养第68-70页
        4.4.1 细胞复苏第69页
        4.4.2 细胞传代第69页
        4.4.3 细胞换液第69页
        4.4.4 细胞冻存第69-70页
    4.5 H_2O_2引起的细胞中的氧化损伤第70-72页
        4.5.1 H_2O_2处理细胞第70页
        4.5.2 细胞中基因组DNA的提取第70-71页
        4.5.3 碱基切除修复第71-72页
        4.5.4 COLD-PCR的检测第72页
    4.6 其他ROS物种引起DNA寡核苷酸连的氧化损伤第72-75页
        4.6.1 ~1O_2第73页
        4.6.2 HClO第73页
        4.6.3 OH第73页
        4.6.4 纳米材料光热第73-74页
        4.6.5 碱基切除修复和COLD-PCR的检测第74-75页
    4.7 实验结果与讨论第75-78页
        4.7.1 H_2O_2引起的DNA的氧化损伤检测结果第75-76页
        4.7.2 H_2O_2对细胞氧化损伤的检测结果第76-77页
        4.7.3 其他ROS物种对DNA氧化损伤的检测结果第77-78页
    4.8 本章小结第78-80页
第五章 结论与展望第80-83页
    5.1 结论第80页
    5.2 展望第80-83页
参考文献第83-87页
致谢第87-89页
研究成果及发表的学术论文第89-91页
作者和导师简介第91-92页
附件第92-93页

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