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SIRT1调节EZH2的表达并且影响PcG对靶基因SATB1的转录调控

目录第3-5页
中文摘要第5-7页
英文摘要第7-8页
前言第9-28页
    1. 表观遗传是基因表达的重要调控方式第9-13页
        1.1 表观遗传研究的起源第9-10页
        1.2 在多个物种中的表观遗传研究进展第10-11页
        1.3 表观遗传对多细胞生物的细胞分化很重要第11页
        1.4 表观遗传研究的方向第11-13页
    2. 组蛋白修饰的种类及其功能研究第13-19页
        2.1 组蛋白的磷酸化修饰第14页
        2.2 组蛋白的乙酰化修饰第14-16页
        2.3 组蛋白的甲基化修饰第16-19页
    3. H3K27甲基化及H3K27特异的甲基转移酶EZH2第19-24页
        3.1 H3K27甲基化修饰的生理意义第19-20页
        3.2 Polycomb Group蛋白家族通过组蛋白修饰引起的染色质高级结构改变实现对下游基因的沉默作用第20-23页
        3.3 EZH2与Ⅲ类HDAC的相互作用第23页
        3.4 芯片结果提示SATB1是PcG的靶基因第23-24页
    4. 组蛋白去乙酰化酶SIRT1及其底物H4K16Ac第24-27页
        4.1 SIRT1是一个功能多样的调节蛋白第24-25页
        4.2 SIRT1是组蛋白去乙酰化酶第25-26页
        4.3 SIRT1特异的组蛋白修饰位点H4K16Ac的功能第26-27页
    5. 本研究提出的主要科学间题和研究内容第27-28页
材料与方法第28-51页
    一、实验材料第28-30页
        1. 实验用细胞系、菌株和质粒第28页
        2. 限制性内切酶及其他修饰酶第28页
        3. 抗体第28-29页
        4. 其它主要试剂及试剂盒第29页
        5. 主要仪器设备第29-30页
    二、实验方法第30-51页
        1. 基本技术路线第30页
        2. HeLa、293等细胞的培养第30-31页
        3. 非病毒方法介导的哺乳动物细胞转染第31-32页
        4. 逆转录病毒的包装和靶细胞的感染第32-34页
        5. 转染后或者逆转录病毒感染后细胞的筛选和克隆细胞株的获得第34页
        6. 腺病毒表达载体的构建、包装及靶细胞的感染第34-37页
        7. 双荧光素酶报告系统的检测第37-38页
        8. 荧光实时定量PCR检测基因表达第38-41页
        9. DNA甲基化修饰抑制剂及Ⅰ/Ⅱ类组蛋白去乙酰化酶抑制剂处理细胞第41页
        10. 亚细胞组分蛋白样品的制备第41-42页
        11. 蛋白质免疫共沉淀检测蛋白质修饰状态第42-43页
        12. 染色质免疫共沉淀检测染色质上调控因子的结合和组蛋白的修饰第43-47页
        13. Western Blot第47-51页
实验结果第51-71页
    1. SATB1是典型的EZH2靶基因第51-57页
        1.1 DNA甲基化修饰抑制剂可以诱导SATB1表达第51-52页
        1.2 Ⅰ/Ⅱ类HDAC抑制剂TSA可以上调SATB1表达第52-53页
        1.3 过表达EZH2可以下调SATB1的表达第53-54页
        1.4 RNA干扰EZH2可以上调SATB1的表达第54-55页
        1.5 染色质免疫共沉淀检测到SATBI近端启动子区存在EZHZ的结合和H32K7m3e的富集第55-57页
    2. SIRT1干扰升高EZH2的蛋白水平和增强PcG对下游靶基因SATB1和HoxA9的沉默作用第57-65页
        2.1 RNA干扰SIRT1的细胞中EZH2蛋白水平升高第57-58页
        2.2 RNA干扰SIRT1的细胞中胞浆可溶和染色质结合部分的EZH2水平都上调第58-59页
        2.3 SIRT1干扰的细胞内总体的H4K16Ac水平上升而H3K27me3保持不变第59页
        2.4 SIRT1干扰的细胞中PcG靶基因SATB1和HoxA9转录水平改变第59-60页
        2.5 SIRT1干扰的细胞中H3K27me3和EZH2在SATB1和HoxA9的近端启动子区富集程度增加第60-62页
        2.6 SIRT1干扰的细胞中SATB1和HoxA9的近端启动子区H4K16Ac不改变第62-64页
        2.7 SIRT1干扰的细胞中H4 Ac和H3 Ac的改变第64-65页
    3. SIRT1不能在转录水平上调节EZH2表达,而SIRT1干扰的细胞中EZH2蛋白稳定性增加第65-71页
        3.1 SIRT1干扰的细胞中EZH2启动子报告基因的检测第65-67页
        3.2 SIRT1干扰的细胞中EZH2成熟的mRNA水平不改变第67页
        3.3 SIRT1在EZH2的启动子区没有检测到结合第67-68页
        3.4 SIRT1干扰的细胞中EZH2蛋白的稳定性增强第68-70页
        3.5 EZH2蛋白上没有检测到乙酰化修饰第70-71页
讨论第71-79页
    1. SIRT1可能通过间接途径调节EZH2的表达并影响其下游基因第71-73页
    2. EZH2可能通过对SATB1的调节参与淋巴细胞以及红系的分化过程第73-74页
    3. SIRT1不直接通过对组蛋白的去乙酰化作用调节SATB1和HoxA9第74-75页
    4. SIRT1对EZH2的调节作用增加了PcG下游基因SATB1和HoxA9调控方式的多样性第75-76页
    5. SIRT1对EZH2的调节作用可能与后者在肿瘤细胞中的过度表达相关第76-79页
参考文献第79-89页
小结第89-90页
非论文综述第90-107页
    参考文献第99-107页
致谢第107-108页
个人简历第108-110页

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