| Table of Contents | 第6-9页 |
| List of Tables | 第9-10页 |
| List of Figures | 第10-11页 |
| Abstract | 第11页 |
| Acknowledgements | 第12-13页 |
| Chapter One | 第13-27页 |
| 1.0 Introduction | 第13页 |
| 1.1 Sequences and Structures | 第13-15页 |
| 1.2 Biological sequences | 第15-18页 |
| 1.3 Biological structures | 第18-23页 |
| 1.3.1 Primary Structure | 第20-21页 |
| 1.3.2 Secondary Structure | 第21-23页 |
| 1.3.2.1.Domains | 第22-23页 |
| 1.3.3 Tertiary Structure | 第23页 |
| 1.3.4 Quaternary structure | 第23页 |
| 1.4 Protein Structure determination | 第23-24页 |
| 1.5 The protein folding problem | 第24-27页 |
| Chapter Two | 第27-36页 |
| 2.0 Overview of Computational methods | 第27-29页 |
| Methods for protein structure prediction | 第27-29页 |
| 2.1 Monte Carlo search | 第29页 |
| 2.2 Threading | 第29-30页 |
| 2.3 Techniques used to predict tertiary protein structure. | 第30-36页 |
| 2.3.1 Prediction Based on Multi-Level Description (MLD) | 第30-31页 |
| 2.3.2 3-D skeletonization | 第31页 |
| 2.3.3 Hidden Markov Models (HMMs) | 第31-32页 |
| 2.3.4 Homology modelling | 第32-33页 |
| 2.3.5 LINUS | 第33-36页 |
| Chapter 3 | 第36-45页 |
| 3.0 Fractals in Biology and Medicine | 第36-37页 |
| 3.1 Features of fractals | 第37-38页 |
| 3.1.1 Self –similarity | 第37页 |
| 3.1.2 Scaling: | 第37页 |
| 3.1.3 Dimension: | 第37-38页 |
| 3.1.4 Statistical Properties | 第38页 |
| 3.1.5 Lacunarity | 第38页 |
| 3.2 Biological examples where the Fractal Dimension has been measured | 第38-40页 |
| 3.3 Biological Examples of the Statistical Properties of Fractals | 第40-43页 |
| 3.4 Relevance of study | 第43-45页 |
| Chapter Four | 第45-55页 |
| 4.0 MATERIALS AND METHODS | 第45-47页 |
| 4.1 Feature Extraction and Matching Strategy | 第47-49页 |
| 4.2 Volume Fractal Dimensionality of proteins | 第49-52页 |
| 4.3 Experiments | 第52-55页 |
| Chapter Five | 第55-56页 |
| 5.0 Discussion of Results | 第55-56页 |
| Chapter Six | 第56-57页 |
| 6.0 Future Work and Conclusion | 第56-57页 |
| 6.1 Future Work | 第56页 |
| 6.2 Conclusion | 第56-57页 |
| References | 第57-61页 |
| Appendix A | 第61页 |
| A1. Submitted Papers | 第61页 |
