| 致谢 | 第6-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1 文献综述及本文研究目的 | 第15-25页 |
| 1.1 烟粉虱概述 | 第15页 |
| 1.2 烟粉虱的危害方式 | 第15-16页 |
| 1.3 烟粉虱的危害现状 | 第16-17页 |
| 1.4 入侵烟粉虱 | 第17-21页 |
| 1.4.1 抗药性 | 第17-18页 |
| 1.4.2 入侵种与土著种间生殖干涉 | 第18-19页 |
| 1.4.3 寄主的适应性 | 第19-20页 |
| 1.4.4 入侵种间的竞争 | 第20-21页 |
| 1.5 烟粉虱虫体分子生物学数据分析 | 第21页 |
| 1.5.1 隐种间虫体表达谱分析 | 第21页 |
| 1.5.2 MED和MEAM1转录组比较分析 | 第21页 |
| 1.6 昆虫中肠功能 | 第21-23页 |
| 1.7 本研究目的与主要内容 | 第23-25页 |
| 1.7.1 本研究目的 | 第23-24页 |
| 1.7.2 主要研究内容 | 第24-25页 |
| 2 基本材料和方法 | 第25-39页 |
| 2.1 供试植物及种植 | 第25页 |
| 2.2 供试昆虫及种群维持 | 第25页 |
| 2.3 生态学相关仪器设备 | 第25-27页 |
| 2.3.1 养虫笼 | 第26页 |
| 2.3.2 人工吸虫器 | 第26页 |
| 2.3.3 人工气候室 | 第26页 |
| 2.3.4 解剖针 | 第26页 |
| 2.3.5 其他设备 | 第26-27页 |
| 2.4 生化及分子生物学研究相关的主要试验仪器与化学试剂 | 第27-28页 |
| 2.4.1 分子生物学研究主要仪器设备 | 第27页 |
| 2.4.2 主要化学试剂 | 第27-28页 |
| 2.5 实验中用到的相关软件 | 第28页 |
| 2.6 基本方法 | 第28-34页 |
| 2.6.1 烟粉虱总DNA提取 | 第28页 |
| 2.6.2 烟粉虱隐种的鉴定 | 第28-30页 |
| 2.6.3 烟粉虱虫体总RNA的提取 | 第30-31页 |
| 2.6.4 烟粉虱肠道获取及RNA提取 | 第31-32页 |
| 2.6.5 RNA反转录及cDNA扩增 | 第32-33页 |
| 2.6.6 测序 | 第33页 |
| 2.6.7 荧光定量PCR | 第33-34页 |
| 2.7 数据分析 | 第34-39页 |
| 2.7.1 原始数据过滤 | 第34-35页 |
| 2.7.2 短序列拼接 | 第35页 |
| 2.7.3 GO、COG和KEGG注释及KEGG富集分析 | 第35-39页 |
| 3 MEAM1中肠转录组信息 | 第39-49页 |
| 3.1 材料与方法 | 第39-40页 |
| 3.1.1 供试昆虫和植物 | 第39页 |
| 3.1.2 MEAM1烟粉虱肠道收集及RNA提取 | 第39页 |
| 3.1.3 反转录、cDNA的扩增与转录组测序 | 第39-40页 |
| 3.1.4 测序及拼接 | 第40页 |
| 3.1.5 GO及KEGG归类及功能注释 | 第40页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第40-49页 |
| 3.2.1 转录组测序数据 | 第40-41页 |
| 3.2.2 中肠转录组基因注释 | 第41页 |
| 3.2.3 GO、COG和KEGG分类 | 第41-49页 |
| 4 MEAM1中肠与虫体转录组对比分析 | 第49-56页 |
| 4.1 材料与方法 | 第49-50页 |
| 4.1.1 供试昆虫和植物 | 第49页 |
| 4.1.2 MEAM1烟粉虱虫体RNA提取 | 第49页 |
| 4.1.3 MEAM1烟粉虱肠道收集及RNA提取 | 第49-50页 |
| 4.1.4 KEGG富集分析 | 第50页 |
| 4.1.5 中肠特有基因的筛选 | 第50页 |
| 4.2 结果与分析 | 第50-56页 |
| 4.2.1 KEGG富集分析 | 第50-51页 |
| 4.2.2 中肠特异表达基因 | 第51页 |
| 4.2.3 中肠特有基因的表达量分析 | 第51-56页 |
| 5 在MEAM1中肠与MED中肠转录组对比分析 | 第56-69页 |
| 5.1 材料与方法 | 第56-58页 |
| 5.1.1 供试昆虫和植物 | 第56页 |
| 5.1.2 MEAM1与MED烟粉虱肠道收集及RNA提取 | 第56-57页 |
| 5.1.3 MEAM1与MED中肠同源基因的筛选 | 第57页 |
| 5.1.4 MEAM1与MED中肠同源基因KEGG分析 | 第57页 |
| 5.1.5 同义替换(Ks)和非同义替换的(Ka)分析 | 第57页 |
| 5.1.6 同源基因的差异表达 | 第57-58页 |
| 5.2 结果与分析 | 第58-69页 |
| 5.2.1 MEAM1与MED中肠同源基因 | 第58页 |
| 5.2.2 低氨基酸序列相似度同源基因分析 | 第58-59页 |
| 5.2.3 同义替换与非同义替换分析 | 第59-60页 |
| 5.2.4 MEAM1和MED中肠差异表达基因分析 | 第60-69页 |
| 6 总讨论 | 第69-72页 |
| 6.1 MEAM1中肠转录组的测序 | 第69页 |
| 6.2 中肠在整个虫体中的作用至关重要 | 第69-70页 |
| 6.3 MEAM1和MED中肠同源基因表达存在显著差异 | 第70页 |
| 6.4 本研究的特色和创新之处 | 第70页 |
| 6.5 值得继续研究的问题 | 第70-72页 |
| 7 参考文献 | 第72-81页 |
| 作者简介 | 第81页 |
