| 前言 | 第4-6页 |
| 摘要 | 第6-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 中英文缩略词对照表 | 第16-18页 |
| 第1章 绪论 | 第18-32页 |
| 1.1 肝硬化研究的必要性 | 第18-21页 |
| 1.1.1 肝硬化的病因和流行病学 | 第18-19页 |
| 1.1.2 肝硬化的治疗及最新进展 | 第19-21页 |
| 1.2 肝细胞水平研究的重要性 | 第21-24页 |
| 1.2.1 肝细胞的功能 | 第21页 |
| 1.2.2 肝细胞与肝脏炎症和纤维化 | 第21-24页 |
| 1.3 转录组表达谱构建的必要性 | 第24-29页 |
| 1.3.1 转录组研究概述 | 第24-25页 |
| 1.3.2 RNA测序技术与数据分析 | 第25-27页 |
| 1.3.3 lncRNA及其在肝病中的研究进展 | 第27-29页 |
| 1.4 本研究的流程 | 第29-32页 |
| 第2章 人原代肝细胞的分离培养与鉴定 | 第32-48页 |
| 2.1 实验仪器与材料 | 第32-35页 |
| 2.1.1 肝组织 | 第32页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第32-33页 |
| 2.1.3 实验仪器 | 第33页 |
| 2.1.4 主要溶液的配制 | 第33-35页 |
| 2.2 实验方法 | 第35-37页 |
| 2.2.1 肝组织的保存及运送 | 第35页 |
| 2.2.2 原代肝细胞的分离 | 第35-36页 |
| 2.2.3 原代肝细胞的纯化 | 第36-37页 |
| 2.2.4 原代肝细胞的培养与保存 | 第37页 |
| 2.2.5 统计分析 | 第37页 |
| 2.3 实验结果 | 第37-43页 |
| 2.3.1 患者及肝组织基本信息 | 第37-40页 |
| 2.3.2 原代肝细胞数量及活性的相关因素 | 第40-41页 |
| 2.3.3 培养后原代肝细胞的显微图像 | 第41-43页 |
| 2.4 讨论 | 第43-46页 |
| 2.5 小结 | 第46-48页 |
| 第3章 基于RNA-seq技术的乙肝相关肝硬化肝细胞差异表达mRNA研究 | 第48-78页 |
| 3.1 实验仪器与材料 | 第48-49页 |
| 3.1.1 实验试剂 | 第48页 |
| 3.1.2 实验仪器 | 第48页 |
| 3.1.3 实验细胞 | 第48-49页 |
| 3.2 实验方法 | 第49-54页 |
| 3.2.1 细胞中总RNA的提取与质控 | 第49-50页 |
| 3.2.2 建库和测序 | 第50页 |
| 3.2.3 测序数据的分析与统计 | 第50-52页 |
| 3.2.4 差异表达mRNA的检测 | 第52页 |
| 3.2.5 差异表达mRNA的功能分析 | 第52-53页 |
| 3.2.6 差异剪接基因的筛选及功能分析 | 第53-54页 |
| 3.3 实验结果 | 第54-73页 |
| 3.3.1 样本中RNA纯度和完整性鉴定结果 | 第54-58页 |
| 3.3.2 测序数据过滤 | 第58-60页 |
| 3.3.3 参考基因组比对 | 第60-61页 |
| 3.3.4 基因表达量统计 | 第61-62页 |
| 3.3.5 差异表达mRNA筛选 | 第62-65页 |
| 3.3.6 差异表达mRNA的GO功能分类及富集分析 | 第65-67页 |
| 3.3.7 差异表达mRNA KEGG生物通路分类及富集分析 | 第67-70页 |
| 3.3.8 差异剪接基因筛选及功能分析 | 第70-73页 |
| 3.4 讨论 | 第73-76页 |
| 3.5 小结 | 第76-78页 |
| 第4章 基于RNA-seq技术的乙肝相关肝硬化肝细胞差异表达lnc RNA研究 | 第78-96页 |
| 4.1 实验仪器与材料 | 第78页 |
| 4.2 实验方法 | 第78-81页 |
| 4.2.1 细胞中总RNA的提取与质控 | 第78页 |
| 4.2.2 建库和测序 | 第78页 |
| 4.2.3 测序数据的分析与统计 | 第78-80页 |
| 4.2.4 差异表达lncRNA的检测 | 第80页 |
| 4.2.5 差异表达lnRNA的功能分析 | 第80-81页 |
| 4.2.6 差异表达lncRNA-mRNA互作分析 | 第81页 |
| 4.3 实验结果 | 第81-92页 |
| 4.3.1 样本总RNA纯度和完整性鉴定结果 | 第81页 |
| 4.3.2 测序数据过滤 | 第81页 |
| 4.3.3 参考基因组比对 | 第81-82页 |
| 4.3.4 差异表达lncRNA筛选 | 第82-87页 |
| 4.3.5 差异表达lncRNA GO功能分类及富集分析 | 第87-88页 |
| 4.3.6 差异表达lncRNA KEGG生物通路分类及富集分析 | 第88-89页 |
| 4.3.7 差异表达lncRNA-mRNA互作分析 | 第89-92页 |
| 4.4 讨论 | 第92-94页 |
| 4.5 小结 | 第94-96页 |
| 第5章 结论 | 第96-98页 |
| 第6章 本实验创新点及意义 | 第98-100页 |
| 参考文献 | 第100-116页 |
| 作者简介及在学期间所取得的科研成果 | 第116-118页 |
| 致谢 | 第118页 |
