| 摘要 | 第8-10页 |
| 英文摘要 | 第10-12页 |
| 1 前言 | 第13-19页 |
| 1.1 研究的目的和意义 | 第13页 |
| 1.2 文献综述 | 第13-19页 |
| 1.2.1 植物低温应答分子机制研究进展 | 第13-16页 |
| 1.2.2 多毛番茄和类番茄茄 | 第16-17页 |
| 1.2.3 高通量测序技术 | 第17-19页 |
| 2 材料与方法 | 第19-24页 |
| 2.1 实验材料 | 第19-20页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第19页 |
| 2.1.2 菌种 | 第19页 |
| 2.1.3 分子生物学试剂和生化试剂 | 第19页 |
| 2.1.4 培养基的配置 | 第19页 |
| 2.1.5 主要仪器设备 | 第19-20页 |
| 2.2 实验方法 | 第20-24页 |
| 2.2.1 生理生化指标测定 | 第20-21页 |
| 2.2.2 测序与数据分析 | 第21-22页 |
| 2.2.3 荧光定量PCR检测 | 第22-24页 |
| 3 结果与分析 | 第24-85页 |
| 3.1 表型与生理 | 第24-27页 |
| 3.2 转录组测序 | 第27-31页 |
| 3.2.1 高通量测序 | 第27-29页 |
| 3.2.2 全基因组定位分析 | 第29-31页 |
| 3.3 差异表达基因识别 | 第31-47页 |
| 3.3.1 样品相关性分析 | 第31-34页 |
| 3.3.2 荧光定量PCR验证 | 第34-38页 |
| 3.3.3 差异表达基因识别 | 第38-47页 |
| 3.4 低温应答分子机制分析 | 第47-68页 |
| 3.4.1 栽培番茄和多毛番茄低温应答分子机制分析 | 第47-51页 |
| 3.4.2 类番茄茄低温应答分子机制分析 | 第51-62页 |
| 3.4.3 转录因子的低温调控 | 第62-65页 |
| 3.4.4 植物激素生物合成与信号相关低温调控基因 | 第65-68页 |
| 3.5 低温应答可变剪接的识别 | 第68-77页 |
| 3.5.1 栽培番茄和多毛番茄新可变剪接的识别 | 第68-71页 |
| 3.5.2 栽培番茄和多毛番茄低温应答可变剪接的识别 | 第71-75页 |
| 3.5.3 低温应答可变剪接基因的功能聚类分析 | 第75-77页 |
| 3.6 栽培番茄和多毛番茄的SNP分析 | 第77页 |
| 3.7 Micro RNA识别 | 第77-85页 |
| 3.7.1 高通量测序 | 第77-78页 |
| 3.7.2 新Micro RNA的识别 | 第78-79页 |
| 3.7.3 Micro RNA差异表达与低温应答Micro RNA的识别 | 第79-80页 |
| 3.7.4 Micro RNA靶基因的识别 | 第80-81页 |
| 3.7.5 低温应答Micro RNA-靶基因通路识别 | 第81-85页 |
| 4 讨论 | 第85-91页 |
| 4.1 低温应答基因识别 | 第85-88页 |
| 4.2 低温应答可变剪接识别 | 第88-89页 |
| 4.3 低温应答Micro RNA识别 | 第89-91页 |
| 5 结论 | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-97页 |
| 致谢 | 第97-98页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第98页 |
