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基于转录组水平的枣疯病发病机理研究

摘要第6-7页
Abstract第7-8页
第一章 文献综述第11-19页
    1.1 枣疯病研究现状第11-13页
        1.1.1 枣疯病病原的发现第11页
        1.1.2 枣疯病的发病症状第11-12页
        1.1.3 枣疯病的传播途径第12页
        1.1.4 枣疯病的防治措施第12页
        1.1.5 枣疯病发病在生理水平的研究第12-13页
        1.1.6 枣疯病发病在分子水平的研究第13页
    1.2 植原体及其感染其他植物的研究概况第13-15页
        1.2.1 植原体研究概况第13页
        1.2.2 植原体感染泡桐(泡桐丛枝病)第13-14页
        1.2.3 植原体感染葡萄(葡萄黄化病)第14页
        1.2.4 植原体感染桑树(桑树萎缩病)第14-15页
        1.2.5 植原体感染椰子树(椰子树致死性黄化病)第15页
    1.3 转录组测序技术及其应用第15-17页
        1.3.1 转录组的概念第15页
        1.3.2 转录组的测序原理第15-16页
        1.3.3 RNA-Seq测序平台第16-17页
        1.3.4 转录组测序应用第17页
    1.4 本研究的目的意义及技术路线第17-19页
        1.4.1 研究目的和意义第17-18页
        1.4.2 研究内容第18页
        1.4.3 研究的技术路线第18-19页
第二章 材料与方法第19-28页
    2.1 材料第19页
    2.2 主要仪器和试剂第19-22页
        2.2.1 主要仪器第19-21页
        2.2.2 主要试剂第21页
        2.2.3 相关试剂配置方法第21-22页
    2.3 内源激素测定第22-23页
        2.3.1 样品提取方法第22页
        2.3.2 色谱-质谱条件第22-23页
    2.4 酶活性测定第23-24页
        2.4.1 过氧化物酶(POD)活性测定第23-24页
        2.4.2 超氧化物歧化酶(SOD)活性测定第24页
        2.4.3 过氧化氢酶(CAT)活性测定第24页
    2.5 转录组测序及分析第24-26页
        2.5.1 总RNA制备与文库构建第24-25页
        2.5.2 库检及上机测序第25页
        2.5.3 生物信息分析流程第25-26页
        2.5.4 差异表达基因筛选及功能注释第26页
    2.6 实时荧光定量PCR验证第26-27页
        2.6.1 RNA提取及cDNA合成第26页
        2.6.2 荧光定量分析第26-27页
    2.7 数据处理与分析第27-28页
第三章 结果与分析第28-40页
    3.1 枣树感染枣疯病植原体的发病症状观察第28-29页
    3.2 内源激素含量变化分析第29-30页
    3.3 保护酶活性变化分析第30-31页
    3.4 转录组测序数据分析第31-36页
        3.4.1 转录组测序质量第31-32页
        3.4.2 GO功能注释富集分析第32-34页
        3.4.3 KEGG代谢通路富集分析第34-36页
        3.4.4 差异表达基因筛选第36页
    3.5 内参基因筛选第36-38页
    3.6 关键基因的定量表达验证第38-40页
第四章 结论与讨论第40-43页
    4.1 结论第40-41页
        4.1.1 感病后内源激素含量和保护酶活性变化的研究第40页
        4.1.2 关键基因的筛选与定量分析第40-41页
    4.2 讨论第41-43页
        4.2.1 内源激素含量变化及其合成相关基因的研究第41页
        4.2.2 保护酶活性变化及相关基因的研究第41页
        4.2.3 转录组测序揭示枣疯病发病机理第41-43页
参考文献第43-48页
缩略词第48-49页
致谢第49-50页
作者简介第50页

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