| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 绪论 | 第10-29页 |
| 1.1 文献综述 | 第10-17页 |
| 1.1.1 渗透胁迫和植物的抗逆性 | 第10页 |
| 1.1.2 渗透胁迫对植物的影响 | 第10-13页 |
| 1.1.2.1 渗透胁迫对植物生长发育的影响 | 第10-12页 |
| 1.1.2.2 渗透胁迫对植物生理特性的影响 | 第12-13页 |
| 1.1.3 植物响应渗透胁迫的生理和分子机制 | 第13-17页 |
| 1.1. 3.1 生长发育调节 | 第13页 |
| 1.1.3.2 代谢调节 | 第13页 |
| 1.1.3.3 渗透调节 | 第13-15页 |
| 1.1.3.4 抗氧化系统酶的调节 | 第15-16页 |
| 1.1.3.5 基因表达及调控 | 第16-17页 |
| 1.1.3.6 逆境信息转导 | 第17页 |
| 1.2 基因表达谱 | 第17-26页 |
| 1.2.1 基因芯片 | 第18-21页 |
| 1.2.1.1 基因芯片的原理 | 第18页 |
| 1.2.1.2 基因芯片的分类 | 第18-19页 |
| 1.2.1.3 基因芯片的发展 | 第19-20页 |
| 1.2.1.4 基因芯片的优缺点 | 第20-21页 |
| 1.2.2 数字基因表达谱 | 第21-26页 |
| 1.2.2.1 DNA测序技术的发展历程 | 第21-24页 |
| 1.2.2.2 高通量测序技术在植物研究中的应用 | 第24-26页 |
| 1.3 研究内容及研究意义 | 第26-29页 |
| 1.3.1 突变体CS859633背景信息 | 第26-27页 |
| 1.3.2 研究内容及意义 | 第27-29页 |
| 第二章 突变体CS859633纯合体鉴定及对渗透胁迫的响应 | 第29-40页 |
| 2.1 突变体CS859633纯合体鉴定 | 第29-35页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第29页 |
| 2.1.2 拟南芥幼苗培养方法 | 第29页 |
| 2.1.3 纯合体鉴定 | 第29-35页 |
| 2.2 突变体CS859633对渗透胁迫的响应 | 第35-40页 |
| 2.2.1 渗透胁迫实验 | 第35-36页 |
| 2.2.2 渗透胁迫实验结果分析 | 第36-38页 |
| 2.2.3 讨论 | 第38-40页 |
| 第三章 数字基因表达谱分析 | 第40-82页 |
| 3.1 高通量测序 | 第40-52页 |
| 3.1.1 实验材料准备 | 第40页 |
| 3.1.2 总RNA提取和定量分析 | 第40-44页 |
| 3.1.3 高通量测序实验 | 第44-46页 |
| 3.1.4 高通量测序原始数据处理 | 第46-52页 |
| 3.1.4.1 原始测序数据量统计 | 第46-47页 |
| 3.1.4.2 原始测序数据质量控制 | 第47-48页 |
| 3.1.4.3 测序数据去杂 | 第48-51页 |
| 3.1.4.4 测序结果与参考基因组比对 | 第51-52页 |
| 3.2 基因表达差异分析 | 第52-61页 |
| 3.2.1 差异基因计算方式 | 第52-54页 |
| 3.2.2 差异表达基因的筛选 | 第54-55页 |
| 3.2.3 差异表达可视化分析 | 第55-61页 |
| 3.3 差异表达基因的GO显著性富集分析 | 第61-71页 |
| 3.3.1 GO及其分析方法 | 第61-63页 |
| 3.3.2 4组样品两两比对的差异基因GO显著性富集 | 第63-71页 |
| 3.3.3 讨论 | 第71页 |
| 3.4 差异表达基因的KEGG Pathway显著性富集分析 | 第71-82页 |
| 3.4.1 KEGG通路分析 | 第71-73页 |
| 3.4.2 四组样品两两比对的KEGG pathway显著性富集 | 第73-81页 |
| 3.4.3 讨论 | 第81-82页 |
| 第四章 结论 | 第82-83页 |
| 参考文献 | 第83-90页 |
| 硕士期间研究成果 | 第90-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
