尿蛋白质组学中样品处理方法的改进与验证
| 内容摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7页 |
| 1 引言 | 第12-22页 |
| 1.1 蛋白质组学简介 | 第13-15页 |
| 1.2 尿蛋白质组学简介 | 第15-17页 |
| 1.2.1 尿液的形成 | 第15-16页 |
| 1.2.2 尿液可以作为生物标志物的重要来源 | 第16-17页 |
| 1.3 尿蛋白组学的研究现状 | 第17-20页 |
| 1.4 尿蛋白质组学的应用 | 第20页 |
| 1.5 本文研究内容 | 第20-22页 |
| 2 方法与数据 | 第22-31页 |
| 2.1 实验设计 | 第22-23页 |
| 2.2 方法一——填料内酶解法 | 第23-24页 |
| 2.2.1 材料与方法 | 第23页 |
| 2.2.2 实验流程 | 第23-24页 |
| 2.3 方法二——胶内酶解法 | 第24-26页 |
| 2.3.1 材料与方法 | 第24-25页 |
| 2.3.2 实验流程 | 第25-26页 |
| 2.4 方法三——溶液内酶解法 | 第26页 |
| 2.4.1 实验流程 | 第26页 |
| 2.5 数据采集 | 第26-28页 |
| 2.5.1 液相色谱方法和条件 | 第27页 |
| 2.5.2 质谱方法和条件 | 第27-28页 |
| 2.6 数据处理 | 第28-29页 |
| 2.6.1 蛋白的定性方法 | 第28页 |
| 2.6.2 蛋白的定量方法 | 第28-29页 |
| 2.7 数据分析 | 第29-31页 |
| 2.7.1 皮尔森相关系数 | 第29页 |
| 2.7.2 层次聚类 | 第29-30页 |
| 2.7.3 GO富集分析 | 第30页 |
| 2.7.4 组织特异性蛋白 | 第30-31页 |
| 3 结果与讨论 | 第31-47页 |
| 3.1 三种实验方法比较 | 第31-40页 |
| 3.1.1 蛋白鉴定数比较 | 第31-35页 |
| 3.1.2 组织特异性蛋白比较 | 第35-37页 |
| 3.1.3 动态范围比较 | 第37-39页 |
| 3.1.4 时间比较 | 第39-40页 |
| 3.2 溶液内酶解法验证 | 第40-44页 |
| 3.2.1 可重复性验证 | 第40-42页 |
| 3.2.2 与近期发表的尿蛋白文章比较 | 第42-44页 |
| 3.3 溶液内酶解法的应用 | 第44-47页 |
| 4 总结与展望 | 第47-49页 |
| 4.1 总结 | 第47-48页 |
| 4.2 展望 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-53页 |
| 附录 | 第53-82页 |
| 附录1: 溶液内酶解法共鉴定到的特异性蛋白列表 | 第53-65页 |
| 附录2: 三次操作重复共鉴定到的特异性蛋白列表 | 第65-80页 |
| 附录3: 怀孕组与正常组差异蛋白列表 | 第80-82页 |
| 致谢 | 第82页 |
