| 摘要 | 第5-8页 |
| ABSTRACT | 第8-11页 |
| 缩略词 | 第15-16页 |
| 第一章 前言 | 第16-29页 |
| 1.1 果实发育的研究进展 | 第16-23页 |
| 1.1.1 植物激素在果实发育过程中的调控作用 | 第16-18页 |
| 1.1.2 转录因子在果实发育过程中的调控 | 第18-19页 |
| 1.1.3 果实发育过程中黄酮类化合物的代谢及调控 | 第19-21页 |
| 1.1.4 果实发育过程中的蔗糖代谢 | 第21-23页 |
| 1.2 转录组测序(RNA-Seq)技术在植物中的应用 | 第23-25页 |
| 1.2.1 转录组测序(RNA-Seq)技术的发展 | 第23-24页 |
| 1.2.2 RNA-Seq技术在植物及果实研究中的应用 | 第24-25页 |
| 1.3 唐古特白刺的应用价值 | 第25-27页 |
| 1.3.1 唐古特白刺的生态价值 | 第25-26页 |
| 1.3.2 唐古特白刺的营养价值 | 第26-27页 |
| 1.4 选题背景和研究意义 | 第27-29页 |
| 第二章 唐古特白刺果实转录组测序及表达谱分析 | 第29-52页 |
| 2.1 实验材料 | 第29-31页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第29-30页 |
| 2.1.2 试剂与药品 | 第30页 |
| 2.1.3 主要仪器设备 | 第30-31页 |
| 2.2 实验方法 | 第31-37页 |
| 2.2.1 RNA提取及纯化 | 第31-32页 |
| 2.2.2 转录组测序 | 第32-33页 |
| 2.2.3 测序数据输出及de novo组装 | 第33-34页 |
| 2.2.4 转录组数据分析 | 第34-35页 |
| 2.2.5 数字基因表达谱数据分析 | 第35-36页 |
| 2.2.6 差异表达基因筛选 | 第36-37页 |
| 2.3 结果与分析 | 第37-48页 |
| 2.3.1 RNA质量的检测 | 第37-38页 |
| 2.3.2 转录组数据输出 | 第38页 |
| 2.3.3 Unigene的功能注释 | 第38-42页 |
| 2.3.3.1 Nr数据库注释 | 第39-40页 |
| 2.3.3.2 GO数据库注释 | 第40页 |
| 2.3.3.3 COG数据库注释 | 第40-41页 |
| 2.3.3.4 KEGG代谢通路分析 | 第41-42页 |
| 2.3.4 差异表达基因的筛选 | 第42-43页 |
| 2.3.5 差异表达基因的GO功能显著性富集分析 | 第43-45页 |
| 2.3.6 差异表达基因的KEGG Pathway显著性富集分析 | 第45-48页 |
| 2.4 讨论 | 第48-50页 |
| 2.5 小结 | 第50-52页 |
| 第三章 筛选的唐古特白刺果实中差异表达基因的聚类分析 | 第52-70页 |
| 3.1 材料和方法 | 第52-54页 |
| 3.1.1 差异表达基因的筛选 | 第52页 |
| 3.1.2 基因表达模式的聚类分析 | 第52-53页 |
| 3.1.3 试剂与药品 | 第53页 |
| 3.1.4 主要仪器设备 | 第53页 |
| 3.1.5 黄酮合成基因的qRT-PCR验证 | 第53-54页 |
| 3.2 结果与分析 | 第54-66页 |
| 3.2.1 植物激素相关差异表达基因表达模式的聚类分析 | 第54-57页 |
| 3.2.2 转录因子相关差异表达基因表达模式的聚类分析 | 第57-60页 |
| 3.2.3 黄酮合成途径差异表达基因表达模式的聚类分析 | 第60-62页 |
| 3.2.4 黄酮合成基因的qRT-PCR验证 | 第62-66页 |
| 3.2.4.1 内参基因和目的基因扩增效率的检测和标准曲线的建立 | 第62-64页 |
| 3.2.4.2 qRT-PCR对基因表达量的分析 | 第64-66页 |
| 3.3 讨论 | 第66-68页 |
| 3.3.1 唐古特白刺果实发育过程中植物激素相关基因的表达分析 | 第66-67页 |
| 3.3.2 唐古特白刺果实发育过程中转录因子的表达分析 | 第67-68页 |
| 3.3.3 唐古特白刺果实发育和成熟过程中黄酮合成相关基因的表达分析 | 第68页 |
| 3.4 小结 | 第68-70页 |
| 第四章 唐古特白刺类黄酮-3-O-葡萄糖基转移酶基因(NtUFGT)的克隆和功能研究 | 第70-88页 |
| 4.1 实验材料 | 第70-71页 |
| 4.1.1 植物材料和菌株 | 第70页 |
| 4.1.2 试剂与药品 | 第70-71页 |
| 4.1.3 主要仪器设备 | 第71页 |
| 4.2 实验方法 | 第71-76页 |
| 4.2.1 NtUFGT基因的克隆 | 第71-72页 |
| 4.2.2 NtUFGT基因的生物信息学分析 | 第72-73页 |
| 4.2.3 NtUFGT基因的组织特异性分析 | 第73页 |
| 4.2.4 NtUFGT基因植物表达载体的构建和拟南芥转化 | 第73-75页 |
| 4.2.4.1 植物表达载体pPZP221的构建 | 第73页 |
| 4.2.4.2 NtUFGT基因转化农杆菌 | 第73-74页 |
| 4.2.4.3 浸花序法侵染拟南芥 | 第74页 |
| 4.2.4.4 转NtUFGT基因拟南芥植株的筛选和鉴定 | 第74-75页 |
| 4.2.5 转NtUFGT基因拟南芥的分析 | 第75-76页 |
| 4.2.5.1 转NtUFGT基因拟南芥的形态学分析 | 第75页 |
| 4.2.5.2 转NtUFGT基因拟南芥在UV-B胁迫下的花青素和原花青素含量的检测 | 第75-76页 |
| 4.3 结果与分析 | 第76-86页 |
| 4.3.1 NtUFGT基因的克隆 | 第76-77页 |
| 4.3.2 NtUFGT基因序列的生物信息学分析 | 第77-79页 |
| 4.3.3 NtUFGT基因的组织特异性表达 | 第79页 |
| 4.3.4 植物表达载体的构建 | 第79-81页 |
| 4.3.5 转NtUFGT基因拟南芥植株的筛选和鉴定 | 第81-82页 |
| 4.3.6 转NtUFGT基因拟南芥的鲜重及根长的检测 | 第82-83页 |
| 4.3.7 转NtUFGT基因拟南芥在UV-B胁迫下花青素和原花青素含量的检测 | 第83-86页 |
| 4.3.7.1 转NtUFGT基因拟南芥在UV-B胁迫下花青素含量的检测 | 第84-85页 |
| 4.3.7.2 转NtUFGT基因拟南芥在UV-B胁迫下原花青素含量的检测 | 第85-86页 |
| 4.4 讨论 | 第86-87页 |
| 4.5 小结 | 第87-88页 |
| 第五章 唐古特白刺果实发育过程中蔗糖代谢相关分析 | 第88-102页 |
| 5.1 实验材料 | 第88-89页 |
| 5.1.1 植物材料 | 第88页 |
| 5.1.2 试剂与药品 | 第88-89页 |
| 5.1.3 主要仪器设备 | 第89页 |
| 5.2 实验方法 | 第89-94页 |
| 5.2.1 基因表达模式的聚类分析 | 第89页 |
| 5.2.2 唐古特白刺果实中淀粉含量的测定 | 第89-90页 |
| 5.2.3 唐古特白刺果实中蔗糖含量的测定 | 第90页 |
| 5.2.4 唐古特白剌果实中葡萄糖含量的测定 | 第90-91页 |
| 5.2.5 唐古特白刺果实中果糖含量的测定 | 第91-92页 |
| 5.2.6 唐古特白剌果实中蔗糖合成酶(SS)活性的测定 | 第92页 |
| 5.2.7 唐古特白剌果实中蔗糖磷酸合成酶(SPS)活性的测定 | 第92-93页 |
| 5.2.8 唐古特白刺果实中酸性转化酶(AI)和中性转化酶(NI)活性的测定 | 第93-94页 |
| 5.3 结果分析 | 第94-99页 |
| 5.3.1 唐古特白刺果实不同发育阶段蔗糖和淀粉代谢相关基因的聚类分析 | 第94-96页 |
| 5.3.2 唐古特白剌果实不同发育阶段淀粉和蔗糖含量的测定 | 第96-97页 |
| 5.3.3 唐古特白刺果实不同发育阶段葡萄糖和果糖含量的测定 | 第97-98页 |
| 5.3.4 唐古特白刺果实不同发育阶段SS和SPS活性的测定 | 第98页 |
| 5.3.5 唐古特白刺果实不同发育阶段AI和NI活性的测定 | 第98-99页 |
| 5.4 讨论 | 第99-101页 |
| 5.5 小结 | 第101-102页 |
| 第六章 结论与讨论 | 第102-104页 |
| 参考文献 | 第104-112页 |
| 附录 | 第112-116页 |
| 攻读学位期间发表的论文 | 第116-117页 |
| 致谢 | 第117页 |
