| 摘要 | 第7-10页 |
| ABSTRACT | 第10-13页 |
| 本文所用主要缩略词 | 第14-15页 |
| 第一部分 文献综述 | 第15-39页 |
| 第一章 棉属的分类、起源及系统进化 | 第15-25页 |
| 1 棉属的分类 | 第16-21页 |
| 1.1 根据染色体组进行棉种分类 | 第18-19页 |
| 1.2 根据地理分布进行棉种分类 | 第19-21页 |
| 1.2.1 二倍体棉种的分布 | 第19-20页 |
| 1.2.2 异源四倍体棉种的分布 | 第20-21页 |
| 2 异源四倍体棉种的起源 | 第21-23页 |
| 2.1 异源多倍体形成时间 | 第21-22页 |
| 2.2 异源多倍体供体种 | 第22-23页 |
| 3 多倍体的后果 | 第23-25页 |
| 第二章 控制植物开花的研究进展 | 第25-37页 |
| 1 调控高等植物开花的途径 | 第25-28页 |
| 1.1 春化途径 | 第25-26页 |
| 1.2 赤霉素途径 | 第26页 |
| 1.3 自主开花途径 | 第26-27页 |
| 1.4 光周期信号途径 | 第27-28页 |
| 2 光周期信号途径中的开花机理研究 | 第28-33页 |
| 3 COL家族基因研究进展 | 第33-37页 |
| 3.1 COL家族基因的结构特点及分类 | 第33-34页 |
| 3.2 COL家族基因的功能研究 | 第34-37页 |
| 本研究的目的和意义 | 第37-39页 |
| 第二部分 研究报告 | 第39-95页 |
| 第三章 棉花CONSTANS Like转录因子家族全基因组鉴定 | 第39-67页 |
| 1 材料与方法 | 第41-47页 |
| 1.1 植物材料 | 第41页 |
| 1.2 昼夜节律表达材料的光照处理及取样 | 第41页 |
| 1.3 棉花RNA提取 | 第41-42页 |
| 1.4 cDNA第一链合成 | 第42页 |
| 1.5 棉花数据库中COL家族基因的生物信息学分析 | 第42-44页 |
| 1.5.1 棉花COL家族基因的全基因组搜索 | 第42-43页 |
| 1.5.2 棉花COL家族基因序列分析、系统进化树的构建及保守基序的识别 | 第43页 |
| 1.5.3 棉花COL家族基因的染色体定位及共线性分析 | 第43-44页 |
| 1.5.4 棉花COL家族基因的结构分析 | 第44页 |
| 1.6 RT-PCR分析 | 第44-46页 |
| 1.7 棉花COL家族基因的荧光定量PCR分析 | 第46-47页 |
| 2 结果与分析 | 第47-61页 |
| 2.1 棉花COL家族基因的查找及候选基因的获得 | 第47-49页 |
| 2.2 棉花COL家族基因的系统进化分析及保守基序的识别 | 第49-52页 |
| 2.3 棉花COL家族基因的结构分析 | 第52-53页 |
| 2.4 棉花COL家族基因的染色体定位 | 第53-57页 |
| 2.5 陆地棉中COL家族基因的组织特异性表达 | 第57-60页 |
| 2.6 陆地棉及海岛棉中COL家族基因的昼夜节律表达 | 第60-61页 |
| 3 讨论 | 第61-67页 |
| 3.1 不同物种中COL转录因子在调控开花期中功能保守 | 第61-63页 |
| 3.2 棉花COL家族基因的进化 | 第63-64页 |
| 3.3 棉花COL家族基因的组织表达及叶片中昼夜节律表达模式分化 | 第64-67页 |
| 第四章 野生棉及栽培棉中COL Ⅰ类家族基因的系统进化分析 | 第67-95页 |
| 1 材料与方法 | 第68-75页 |
| 1.1 植物材料 | 第68-69页 |
| 1.2 棉花8个COL家族基因引物的设计 | 第69-71页 |
| 1.3 DNA提取 | 第71-72页 |
| 1.4 棉花8个COL家族基因的克隆 | 第72-74页 |
| 1.4.1 PCR扩增及检测 | 第72-73页 |
| 1.4.2 DNA片段的回收及克隆载体的连接 | 第73页 |
| 1.4.3 DNA回收片段的转化及测序 | 第73-74页 |
| 1.5 序列分析 | 第74-75页 |
| 2 结果与分析 | 第75-88页 |
| 2.1 供试棉种中8个COL家族基因的克隆 | 第75-76页 |
| 2.2 8个COL家族基因的结构分析 | 第76-79页 |
| 2.3 异源四倍体中8个COL家族基因在A-及D-亚组之间表现独立进化 | 第79-84页 |
| 2.4 异源四倍体中8个COL家族基因其A-亚组和D亚组进化速率不同 | 第84-85页 |
| 2.5 8个COL基因核酸多样性分析揭示不同棉种间及不同结构域的进化速率 | 第85-88页 |
| 2.6 8个COL家族基因的中性检验揭示3个COL基因受到选择作用 | 第88页 |
| 3 讨论 | 第88-95页 |
| 3.1 Ⅰ类中8个COL基因揭示异源四倍体棉种中两个亚组是独立进化的 | 第88-89页 |
| 3.2 Ⅰ类的8个COL家族基因及不同结构域受驯化或选择的信号 | 第89-91页 |
| 3.3 Ⅰ类中8个COL家族基因不同结构域的进化速率分析 | 第91-95页 |
| 全文结论 | 第95-97页 |
| 本研究的主要创新点 | 第97-99页 |
| 参考文献 | 第99-115页 |
| 附录 | 第115-125页 |
| 致谢 | 第125-127页 |
| 攻读学位期间发表及待发表学术论文 | 第127页 |
