摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
1 绪论 | 第11-18页 |
1.1 研究背景及意义 | 第11-12页 |
1.2 蛋白质基础知识 | 第12-15页 |
1.2.1 蛋白质的组成 | 第12-13页 |
1.2.2 中心法则 | 第13页 |
1.2.3 蛋白质结构 | 第13-14页 |
1.2.4 蛋白质物理化学性质 | 第14-15页 |
1.3 蛋白质数据库及数据集 | 第15-17页 |
1.3.1 蛋白质数据库 | 第15-16页 |
1.3.2 数据集 | 第16-17页 |
1.4 研究内容与结构安排 | 第17-18页 |
2 蛋白质结构功能预测中氨基酸约化与信息提取的分析比较 | 第18-32页 |
2.1 引言 | 第18页 |
2.2 数据集 | 第18-19页 |
2.3 氨基酸约化 | 第19-20页 |
2.4 蛋白质信息提取方法 | 第20-25页 |
2.4.1 成分提取方法 | 第20-21页 |
2.4.2 氨基酸物理化学性质提取方法 | 第21-22页 |
2.4.3 蛋白质结构信息提取方法 | 第22-24页 |
2.4.4 基因本体论提取方法(GO) | 第24页 |
2.4.5 序列进化信息提取方法(PSSM) | 第24-25页 |
2.5 结果与讨论 | 第25-31页 |
2.5.1 评估方法和指标 | 第25页 |
2.5.2 蛋白质结构类预测中氨基酸约化与信息提取的分析比较 | 第25-27页 |
2.5.3 蛋白质分子伴侣预测中氨基酸约化与信息提取的分析比较 | 第27-29页 |
2.5.4 蛋白质溶解度预测中氨基酸约化与信息提取的分析比较 | 第29-31页 |
2.6 本章小结 | 第31-32页 |
3 蛋白质结构功能预测中特征挑选的分析比较 | 第32-48页 |
3.1 引言 | 第32页 |
3.2 数据集 | 第32-33页 |
3.3 特征挑选方法 | 第33-38页 |
3.3.1 基于互信息的特征挑选 | 第33页 |
3.3.2 基于支持向量机的特征挑选 | 第33-35页 |
3.3.3 基于遗传算法的信息挑选 | 第35-36页 |
3.3.4 基于峰度和偏度的信息挑选方法 | 第36页 |
3.3.5 reliefF和sequentialfs信息挑选 | 第36-38页 |
3.4 结果与讨论 | 第38-46页 |
3.4.1 评估方法和指标 | 第38页 |
3.4.2 蛋白质结构类预测中特征挑选的分析比较 | 第38-40页 |
3.4.3 蛋白质紊乱预测中信息挑选的分析比较 | 第40-43页 |
3.4.4 蛋白质分子伴侣数据集预测中信息挑选的分析比较 | 第43-44页 |
3.4.5 蛋白质溶解度预测中信息挑选的分析比较 | 第44-46页 |
3.5 方法效率 | 第46-47页 |
3.6 本章小结 | 第47-48页 |
4 蛋白质结构功能预测中预测算法的分析比较 | 第48-59页 |
4.1 引言 | 第48页 |
4.2 数据集 | 第48-49页 |
4.3 预测算法 | 第49-53页 |
4.4 结果与讨论 | 第53-57页 |
4.4.1 评估方法和指标 | 第53页 |
4.4.2 蛋白质结构类预测中预测算法的分析比较 | 第53-54页 |
4.4.3 蛋白质分子伴侣数据集预测中预测算法的分析比较 | 第54-55页 |
4.4.4 蛋白质蛋白质紊乱数据集预测中预测算法的分析比较 | 第55-56页 |
4.4.5 蛋白质溶解度数据集预测中预测算法的分析比较 | 第56页 |
4.4.6 蛋白质RNA结合数据集预测中预测算法的分析比较 | 第56-57页 |
4.5 本章小结 | 第57-59页 |
5 总结和展望 | 第59-61页 |
参考文献 | 第61-65页 |
攻读学位期间的研究成果 | 第65-66页 |
致谢 | 第66页 |