社群环境下的短尾猴肠道微生物群落结构及适应进化
| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-29页 |
| 1 肠道微生物概述 | 第16-17页 |
| 2 肠道微生物在动物生态研究中的应用 | 第17-25页 |
| ·肠道微生物与动物营养 | 第19-21页 |
| ·肠道微生物与动物健康 | 第21-22页 |
| ·肠道微生物与动物行为 | 第22-23页 |
| ·肠道微生物与群体演化 | 第23-25页 |
| 3 微生物生态研究技术的发展 | 第25-27页 |
| 4 短尾猴的特点及其优势 | 第27-28页 |
| 5 本研究的目的和意义 | 第28-29页 |
| 第二章 研究对象、研究内容与技术路线 | 第29-36页 |
| 1 研究对象 | 第29-30页 |
| 2 研究地点与研究群体 | 第30-33页 |
| 3 研究内容 | 第33-34页 |
| 4 技术路线 | 第34-36页 |
| 第三章 短尾猴肠道微生物群落组成 | 第36-52页 |
| 1 引言 | 第36-38页 |
| 2 研究方法 | 第38-43页 |
| ·样本的采集与保存 | 第38页 |
| ·样本信息 | 第38-40页 |
| ·粪便总DNA的提取 | 第40-41页 |
| ·粪便总DNA的质量检测 | 第41-42页 |
| ·序列测定 | 第42页 |
| ·数据分析 | 第42-43页 |
| 3 主要结果 | 第43-49页 |
| ·短尾猴肠道微生物门类分布特征 | 第43-44页 |
| ·短尾猴肠道微生物科类分布特征 | 第44-45页 |
| ·短尾猴肠道微生物属类分布特征 | 第45-46页 |
| ·短尾猴肠道核心微生物的组成 | 第46-48页 |
| ·短尾猴肠道微生物的Alpha多样性评估 | 第48-49页 |
| 4 讨论 | 第49-52页 |
| 第四章 社群结构对肠道微生物群落的影响 | 第52-63页 |
| 1 引言 | 第52-54页 |
| 2 研究方法 | 第54-56页 |
| ·样本的采集与保存 | 第54页 |
| ·样本信息 | 第54-55页 |
| ·粪便总DNA的提取 | 第55页 |
| ·粪便总DNA的质量检测 | 第55页 |
| ·序列测定 | 第55页 |
| ·数据分析 | 第55-56页 |
| 3 主要结果 | 第56-61页 |
| ·雌雄间肠道微生物群落组成和功能的差异 | 第56-57页 |
| ·雌性与雄性间肠道微生物群落多样性的差异 | 第57-59页 |
| ·成年与亚成年间肠道微生物群落组成与功能的差异 | 第59页 |
| ·成年与亚成年间肠道微生物群落多样性的差异 | 第59-60页 |
| ·亲缘关系对肠道微生物群落结构的影响 | 第60-61页 |
| 4 讨论 | 第61-63页 |
| 第五章 短尾猴肠道微生物受社群生活的影响 | 第63-84页 |
| 1 引言 | 第63-66页 |
| 2 研究方法 | 第66-70页 |
| ·口腔微样本采集与总DNA提取 | 第67-68页 |
| ·粪便样品总DNA提取 | 第68-69页 |
| ·总DNA的质量检测 | 第69-70页 |
| ·序列测定 | 第70页 |
| ·数据分析 | 第70页 |
| 3 主要结果 | 第70-80页 |
| ·肠道与口腔间的肠道微生物多样性的差异 | 第71-77页 |
| ·肠道微生物群落与口腔微生物群落间的联系 | 第77-80页 |
| 4 讨论 | 第80-84页 |
| 第六章 短尾猴肠道微生物的适应性进化 | 第84-100页 |
| 1 引言 | 第84-86页 |
| 2 材料与方法 | 第86-88页 |
| ·样品收集 | 第86-87页 |
| ·粪便总DNA的提取 | 第87页 |
| ·粪便总DNA的质量检测 | 第87页 |
| ·序列测定 | 第87页 |
| ·数据分析 | 第87-88页 |
| 3 研究结果 | 第88-97页 |
| ·短尾猴冬春季的肠道微生物群落组成的差异 | 第88-92页 |
| ·冬季和春季肠道微生物多样性的差异 | 第92-94页 |
| ·冬季和春季宏基因组的差异 | 第94-97页 |
| 4 讨论 | 第97-100页 |
| 第七章 总结 | 第100-106页 |
| 1 主要结论 | 第100-103页 |
| 2 课题创新 | 第103-104页 |
| 3 研究展望 | 第104-106页 |
| 参考文献 | 第106-116页 |
| 致谢 | 第116-118页 |
| 攻读博士学位期间发表学术论文 | 第118-120页 |
| 攻读博士学位期间参与项目 | 第120-121页 |
| 攻读博士学位期间所获奖励 | 第121页 |
