| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 缩略词（Abbreviation) | 第9-14页 |
| 引言 | 第14-16页 |
| 1 文献综述 | 第16-26页 |
| ·赤霉素的合成、信号转导和生理作用 | 第16-19页 |
| ·赤霉素的合成 | 第16-17页 |
| ·赤霉素的信号转导 | 第17页 |
| ·赤霉素的生理作用 | 第17-19页 |
| ·赤霉素对杨树生长和木材形成的影响 | 第19页 |
| ·植物响应赤霉素转录调控的研究进展 | 第19-21页 |
| ·基因与赤霉素响应 | 第20-21页 |
| ·非编码RNA与赤霉素响应 | 第21页 |
| ·关联作图在林木中的研究进展 | 第21-24页 |
| ·关联作图在林木中的优势和重要性 | 第22页 |
| ·关联作图在林木中的应用 | 第22-23页 |
| ·关联作图在林木中的发展趋势 | 第23-24页 |
| ·立题依据与技术路线 | 第24-26页 |
| 2 赤霉素处理对毛白杨生理、生长和木材品质的影响 | 第26-32页 |
| ·材料方法 | 第26-28页 |
| ·试验材料 | 第26页 |
| ·赤霉素处理及取样 | 第26页 |
| ·生理指标测定 | 第26-27页 |
| ·光合作用指标的测定 | 第27页 |
| ·生长指标的测定 | 第27页 |
| ·木材品质性状的测定 | 第27-28页 |
| ·数据分析 | 第28页 |
| ·结果与分析 | 第28-30页 |
| ·赤霉素对毛白杨生理生化指标的影响 | 第28-29页 |
| ·赤霉素对毛白杨光合作用的影响 | 第29页 |
| ·赤霉素对毛白杨生长性状的影响 | 第29-30页 |
| ·赤霉素对毛白杨木材品质的影响 | 第30页 |
| ·讨论 | 第30-31页 |
| ·小结 | 第31-32页 |
| 3 毛白杨赤霉素响应基因的发现和分析 | 第32-62页 |
| ·材料方法 | 第32-36页 |
| ·试验材料、赤霉素处理及取样 | 第32-33页 |
| ·RNA提取、文库构建及RNA测序 | 第33页 |
| ·差异表达基因的鉴定 | 第33页 |
| ·差异表达基因的Realtime-PCR验证 | 第33-35页 |
| ·亚细胞定位和顺式作用元件分析 | 第35页 |
| ·Gene ontology(GO)和通路富集分析 | 第35页 |
| ·关联群体 | 第35-36页 |
| ·关联群体重测序和SNP发现 | 第36页 |
| ·关联分析 | 第36页 |
| ·结果与分析 | 第36-58页 |
| ·赤霉素响应基因的发现、GO和通路富集分析 | 第36-44页 |
| ·与光合作用和生长相关的赤霉素响应基因 | 第44-48页 |
| ·与光合作用相关的赤霉素响应基因的启动子分析 | 第48-50页 |
| ·单标记关联分析 | 第50-55页 |
| ·上位效应分析 | 第55-58页 |
| ·讨论 | 第58-60页 |
| ·树木中调控光合作用的赤霉素响应通路 | 第58-59页 |
| ·赤霉素响应通路中基因内的SNP与光合、生长和木材品质性状显著关联 | 第59-60页 |
| ·赤霉素响应通路中基因之间的上位效应 | 第60页 |
| ·小结 | 第60-62页 |
| 4 毛白杨赤霉素响应lncRNA的发现和分析 | 第62-84页 |
| ·材料方法 | 第63-65页 |
| ·试验材料、赤霉素处理及取样 | 第63页 |
| ·RNA提取、文库构建及RNA测序 | 第63页 |
| ·lncRNA的预测和赤霉素响应lncRNA的鉴定 | 第63-64页 |
| ·Realtime-PCR验证lncRNA表达模式 | 第64页 |
| ·lncRNA的特征分析 | 第64页 |
| ·赤霉素响应lncRNA靶基因的预测、GO和通路富集分析 | 第64-65页 |
| ·关联群体 | 第65页 |
| ·关联群体重测序和SNP发现 | 第65页 |
| ·关联分析 | 第65页 |
| ·结果与分析 | 第65-79页 |
| ·毛白杨lncRNA的发现和特征分析 | 第65-66页 |
| ·赤霉素响应lncRNA的发现与表达分析 | 第66-68页 |
| ·赤霉素响应lncRNA靶基因的预测和功能分析 | 第68-73页 |
| ·赤霉素响应lncRNA与靶基因之间的表达关系 | 第73-75页 |
| ·赤霉素响应lncRNA及其靶基因内的SNP与生长和木材品质的关联分析 | 第75-78页 |
| ·上位效应分析 | 第78-79页 |
| ·讨论 | 第79-81页 |
| ·毛白杨lncRNA的特征分析 | 第79-80页 |
| ·赤霉素响应lncRNA的潜在功能 | 第80-81页 |
| ·赤霉素响应lncRNA及其靶基因与生长和木材品质显著关联 | 第81页 |
| ·小结 | 第81-84页 |
| 5 毛白杨赤霉素响应miRNA的发现和分析 | 第84-112页 |
| ·材料方法 | 第85-86页 |
| ·试验材料、赤霉素处理及取样 | 第85页 |
| ·RNA提取、文库构建及MicroRNA-seq测序 | 第85页 |
| ·sRNA测序数据的生物信息学分析及novel miRNA预测 | 第85页 |
| ·赤霉素响应miRNA的发现 | 第85-86页 |
| ·Realtime-PCR表达分析 | 第86页 |
| ·miRNA靶基因的预测和分析 | 第86页 |
| ·关联群体 | 第86页 |
| ·关联群体重测序和SNP发现 | 第86页 |
| ·关联分析 | 第86页 |
| ·结果与分析 | 第86-107页 |
| ·sRNA测序数据分析 | 第86-87页 |
| ·鉴定已知miRNA和预测novel miRNA | 第87-92页 |
| ·赤霉素响应miRNA的鉴定 | 第92-95页 |
| ·靶基因预测和分析 | 第95-100页 |
| ·赤霉素响应miRNA及其靶基因的SNP发现 | 第100-101页 |
| ·单标记关联分析 | 第101-103页 |
| ·上位效应分析 | 第103-107页 |
| ·讨论 | 第107-110页 |
| ·新发现的毛白杨miRNA | 第107-108页 |
| ·赤霉素响应miRNA | 第108-109页 |
| ·赤霉素响应miRNA及其靶基因的等位变异解析 | 第109-110页 |
| ·小结 | 第110-112页 |
| 6 毛白杨基因、lncRNA和miRNA之间的相互作用 | 第112-122页 |
| ·材料方法 | 第112-113页 |
| ·lncRNA作为miRNA前体的预测 | 第112-113页 |
| ·lncRNA作为miRNA靶位点的预测 | 第113页 |
| ·lncRNA作为target mimic的预测 | 第113页 |
| ·通路分析 | 第113页 |
| ·Realtime-PCR表达分析 | 第113页 |
| ·结果与分析 | 第113-120页 |
| ·lncRNA作为miRNA前体间接调控基因表达 | 第113-115页 |
| ·lncRNA作为miRNA的靶位点与miRNA互作 | 第115-117页 |
| ·lncRNA作为miRNA的target mimic间接调控基因表达 | 第117-118页 |
| ·生长素信号转导通路中毛白杨基因、lncRNA和miRNA之间的相互作用 | 第118-120页 |
| ·讨论 | 第120-121页 |
| ·小结 | 第121-122页 |
| 7 结论与展望 | 第122-124页 |
| ·结论 | 第122-123页 |
| ·展望 | 第123-124页 |
| 参考文献 | 第124-136页 |
| 附录 | 第136-202页 |
| 个人简介 | 第202-204页 |
| 导师简介一 | 第204-206页 |
| 导师简介二 | 第206-208页 |
| 获得成果目录清单 | 第208-212页 |
| 致谢 | 第212页 |
