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水黄皮种子转录组构建与分析及多态性EST-SSR的筛选

摘要第1-6页
Abstract第6-10页
第1章 前言第10-19页
   ·水黄皮生物学特性第10-11页
   ·水黄皮油脂做生物柴油的研究进展第11-14页
   ·转录组学研究方法简介第14-16页
   ·微卫星标记简介第16-17页
   ·本研究的目的与意义第17-19页
第2章 材料和方法第19-28页
   ·实验材料第19-21页
     ·植物材料第19页
     ·化学试剂第19-20页
     ·实验仪器及设备第20-21页
   ·实验方法第21-28页
     ·水黄皮种子的取样第21页
     ·种子形态及含油特性测定第21-22页
     ·种子总RNA的提取及检测第22-23页
     ·转录组测序、序列组装及Mpseed-Unigene数据注释第23-25页
     ·预测蛋白编码框第25页
     ·RT-PCR验证九个油脂代谢相关基因第25页
     ·潜在EST-SSR位点查找第25-26页
     ·水黄皮DNA提取第26页
     ·多态性EST-SSR位点筛选第26-28页
第3章 结果与分析第28-43页
   ·种子形态及含油特性测定结果第28-29页
   ·种子总RNA提取及质量检测第29-30页
   ·转录组文库构建及测序第30页
   ·de novo组装第30-33页
   ·Mpseed-Unigene功能注释分析第33-35页
     ·功能注释第33页
     ·NR数据库注释结果分析第33-35页
     ·COG分类第35页
   ·GO功能条目分析第35-38页
   ·KEGG代谢通路分析第38-39页
   ·九个油脂代谢相关基因的RT-PCR验证结果第39-40页
   ·Mpseed-Unigene中的EST-SSR分析第40-41页
     ·潜在EST-SSR位点的查找及分析第40页
     ·引物设计和筛选第40-41页
   ·多态性EST-SSR位点筛选第41-43页
第四章 讨论第43-47页
   ·水黄皮的应用价值第43页
   ·种子转录组测序结果分析第43-44页
   ·油脂代谢相关基因的筛选第44-45页
   ·多态性EST-SSR位点筛选第45-46页
   ·小结第46-47页
附表第47-54页
附图第54-57页
参考文献第57-65页
致谢第65-66页
攻读硕士学位期间发表的论文第66-67页

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