| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 目录 | 第9-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-20页 |
| 1 QSAM的定义和研究进展 | 第11-14页 |
| ·QSAM的定义 | 第11-12页 |
| ·QSAM的研究进展 | 第12-14页 |
| 2 T细胞表位的QSAM研究 | 第14-16页 |
| ·机体免疫应答 | 第14页 |
| ·T细胞介导的细胞免疫 | 第14-15页 |
| ·MHC分子 | 第15页 |
| ·T细胞表位预测的研究进展 | 第15-16页 |
| 3 启动子的QSAM研究 | 第16-18页 |
| ·启动子的定义 | 第16页 |
| ·原核生物启动子的结构 | 第16-17页 |
| ·原核生物启动子的研究进展 | 第17-18页 |
| 4 主要研究内容和创新点 | 第18页 |
| 5 论文结构编排 | 第18-20页 |
| 第二章 序列参数提取与建模方法 | 第20-24页 |
| 1 序列表征方法 | 第20-21页 |
| ·直接基于氨基酸性质的氨基酸描述子 | 第20页 |
| ·基于氨基酸性质主成分分析的氨基酸描述子 | 第20页 |
| ·基于肽/蛋白质一级结构整体考虑的肽/蛋白质描述子PROFEAT | 第20-21页 |
| 2 特征选择方法 | 第21页 |
| ·特征选择过程 | 第21页 |
| ·特征选择方法分类 | 第21页 |
| 3 偏最小二乘回归与支持向量机 | 第21-24页 |
| ·偏最小二乘回归 | 第21-22页 |
| ·支持向量机 | 第22-24页 |
| 第三章 HLA-A~*0201限制性CTL表位的QSAM研究 | 第24-34页 |
| 1 数据与方法 | 第24-27页 |
| ·数据集 | 第24页 |
| ·多肽序列表征 | 第24页 |
| ·基于SVR二元矩阵重排过滤器 | 第24-25页 |
| ·多轮末尾淘汰非线性精细筛选 | 第25页 |
| ·SVR非线性解释性体系 | 第25-26页 |
| ·模型评价 | 第26-27页 |
| 2 结果与讨论 | 第27-33页 |
| ·模型检验 | 第27-30页 |
| ·模型解释 | 第30-31页 |
| ·高活性肽分子设计 | 第31-32页 |
| ·各位置氨基酸残基与亲和活性的关系 | 第32-33页 |
| 3 小结 | 第33-34页 |
| 第四章 MHCⅡ类分子结合肽预测 | 第34-42页 |
| 1 数据与方法 | 第34-37页 |
| ·数据集 | 第34-35页 |
| ·序列表征 | 第35-36页 |
| ·特征筛选 | 第36页 |
| ·模型评价 | 第36-37页 |
| 2 结果与讨论 | 第37-41页 |
| 3 小结 | 第41-42页 |
| 第五章 大肠杆菌启动子的QSAM研究 | 第42-48页 |
| 1 数据与方法 | 第42-43页 |
| ·数据集 | 第42页 |
| ·启动子序列表征 | 第42-43页 |
| ·特征筛选 | 第43页 |
| ·模型评价 | 第43页 |
| 2 结果与讨论 | 第43-47页 |
| ·模型检验 | 第43-44页 |
| ·模型解释 | 第44-45页 |
| ·大肠杆菌启动子序列特征与启动强度关系分析 | 第45-47页 |
| 3 小结 | 第47-48页 |
| 第六章 总结与展望 | 第48-50页 |
| 1 全文总结 | 第48-49页 |
| 2 论文不足及展望 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
| 作者简介 | 第61页 |