| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 引言 | 第10-16页 |
| 1.转录组与数字基因表达谱技术研究进展 | 第11-13页 |
| 2. Siglecs 研究进展 | 第13-15页 |
| 3. 本研究目的与意义 | 第15-16页 |
| 第一章 攻毒前后尼罗罗非鱼转录组与数字基因表达谱分析 | 第16-39页 |
| 第一节 无乳链球菌攻毒前后尼罗罗非鱼转录组测序与数据分析 | 第16-26页 |
| 1 材料与方法 | 第16-20页 |
| ·实验鱼与菌株 | 第16页 |
| ·攻毒实验 | 第16页 |
| ·罗非鱼脾脏与肾脏总 RNA 提取 | 第16-17页 |
| ·样品准备与测序 | 第17-18页 |
| ·转录组测序数据分析 | 第18-20页 |
| ·序列拼接组装 | 第18-19页 |
| ·Unigene 序列方向确定与功能注释 | 第19-20页 |
| 2 实验结果与分析 | 第20-26页 |
| ·转录组测序数据拼接组装结果 | 第20-23页 |
| ·Unigene 功能注释 | 第23-26页 |
| 第二节 受无乳链球菌感染的尼罗罗非鱼数字基因表达谱分析 | 第26-36页 |
| 1 材料与方法 | 第26-30页 |
| ·实验鱼与菌株 | 第26页 |
| ·主要试剂 | 第26页 |
| ·攻毒实验与脾、肾总 RNA 提取 | 第26页 |
| ·Tag 制备与测序 | 第26-27页 |
| ·数据处理与评估 | 第27页 |
| ·基因表达注释 | 第27页 |
| ·差异表达基因的筛选及富集分析 | 第27-28页 |
| ·实时定量 PCR 实验分析部分基因的表达变化 | 第28-30页 |
| ·引物设计以及 cDNA 合成 | 第28-29页 |
| ·标准曲线的建立 | 第29-30页 |
| ·组织定量分析 | 第30页 |
| 2 实验结果与分析 | 第30-36页 |
| ·测序产量统计及评估 | 第30-32页 |
| ·差异表达基因的筛选及其 GO 与 KEGG 通路富集分析 | 第32-35页 |
| ·qRT-PCR 实验结果 | 第35-36页 |
| 本章讨论 | 第36-39页 |
| 第二章 尼罗罗非鱼 siglecs 基因的克隆与表达分析 | 第39-49页 |
| 1 材料与方法 | 第39-42页 |
| ·实验动物与主要试剂 | 第39页 |
| ·尼罗罗非鱼嗜中性粒细胞的获得 | 第39页 |
| ·尼罗罗非鱼 Siglec-1 和 Siglec-14 基因的克隆 | 第39-41页 |
| ·尼罗罗非鱼 Siglec-1 和 Siglec-14 序列分析与进化树构建 | 第41页 |
| ·qRT-PCR 分析罗非鱼 Siglec-1 和 Siglec-14 的组织分布 | 第41-42页 |
| ·总 RNA 的提取与反转录 | 第41页 |
| ·引物设计及标准曲线的建立 | 第41-42页 |
| ·组织定量分析 | 第42页 |
| 2 实验结果 | 第42-47页 |
| ·尼罗罗非鱼 Siglec-1 和 Siglec-14 的序列分析 | 第42-46页 |
| ·尼罗罗非鱼 Siglec-1 和 Siglec-14 的组织分布 | 第46-47页 |
| 3 讨论 | 第47-49页 |
| 全文总结 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-55页 |
| 附录 A 缩略词表 | 第55-56页 |
| 附录 B 攻读硕士学位期间发表论文及参加会议情况 | 第56-57页 |
| 致谢 | 第57页 |
