几种基因组评估方法选择效率的比较研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 主要英文缩略表 | 第8-11页 |
| 1 文献综述 | 第11-20页 |
| ·引言 | 第11-12页 |
| ·动物育种技术发展历程 | 第12-15页 |
| ·常规育种方法 | 第12-13页 |
| ·传统数量遗传方法 | 第13-14页 |
| ·分子遗传标记方法阶段 | 第14页 |
| ·分子数量遗传阶段 | 第14页 |
| ·动物育种发展趋势 | 第14-15页 |
| ·全基因组选择 | 第15-18页 |
| ·全基因组选择的概念和原理 | 第15页 |
| ·全基因组选择面临的问题 | 第15-16页 |
| ·全基因组选择的实施 | 第16-17页 |
| ·全基因组选择的优势及其展望 | 第17-18页 |
| ·数据模拟简介 | 第18-20页 |
| ·随机数产生的方法 | 第18页 |
| ·Monte Carlo方法简介 | 第18-19页 |
| ·Markov链简介 | 第19页 |
| ·MCMC算法简介 | 第19-20页 |
| 2 研究的内容和意义 | 第20-21页 |
| 3 材料和方法 | 第21-33页 |
| ·数据描述 | 第21-30页 |
| ·全局参数 | 第21-22页 |
| ·群体的模拟参数设置 | 第22-24页 |
| ·参考群体的模拟参数设置 | 第24-25页 |
| ·全基因组参数的设置 | 第25-28页 |
| ·模拟性状及表型值的模拟 | 第28-30页 |
| ·计算方法及原理 | 第30-33页 |
| ·Bayes方法原理 | 第30页 |
| ·GBLUP方法原理 | 第30-31页 |
| ·SVM方法原理 | 第31-32页 |
| ·交叉验证原理 | 第32-33页 |
| ·程序调试及其运算平台 | 第33页 |
| 4 理论推导过程及结果 | 第33-53页 |
| ·6种方法的理论推导过程 | 第33-45页 |
| ·Bayes A理论推导 | 第34-39页 |
| ·Bayes Cpi理论推导 | 第39-40页 |
| ·Bayesian LASSO理论推导 | 第40-41页 |
| ·Bayes Ridge Regression | 第41页 |
| ·GBLUP理论推导 | 第41-42页 |
| ·支持向量机(SVM)理论推导 | 第42-45页 |
| ·结果及其分析 | 第45-53页 |
| ·全部数据的预测结果 | 第46页 |
| ·交叉验证预测结果 | 第46-51页 |
| ·6种方法10次交叉验证平均结果 | 第51-53页 |
| 5 讨论 | 第53-59页 |
| ·不同育种值估计方法准确度的差异 | 第53-54页 |
| ·GBLUP方法分析 | 第53页 |
| ·Bayes方法分析 | 第53-54页 |
| ·SVM方法分析 | 第54页 |
| ·不同育种值估计方法运行时间的差异 | 第54-55页 |
| ·不同育种值估计方法在不同环境下的预测好坏 | 第55-56页 |
| ·对于全基因组数据模拟方法的讨论 | 第56-57页 |
| ·影响全基因组选择的因素 | 第57-59页 |
| 6 结论 | 第59-60页 |
| ·本研究的创新点 | 第59页 |
| ·全文结论 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第65页 |
