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山羊PPARγ和FABP家族基因的分离鉴定、组织表达及其多态性检测

摘要第1-7页
Abstract第7-14页
1 文献综述第14-24页
   ·脂肪酸结合蛋白家族第14-20页
     ·FABP1的研究进展第14-16页
       ·FABP1基因的分布、定位与结构第14-15页
       ·FABP1的生物学功能第15页
       ·畜禽FABP1基因的研究进展第15-16页
     ·FABP2的研究进展第16-17页
       ·FABP2基因的分布、定位与结构第16页
       ·FABP2的生物学功能第16-17页
       ·畜禽FABP2基因的研究进展第17页
     ·FABP3的研究进展第17-19页
       ·FABP3基因的分布、定位与结构第17-18页
       ·FABP3的生物学功能第18页
       ·畜禽FABP3基因的研究进展第18-19页
     ·FABP4的研究进展第19-20页
       ·FABP4基因的分布、定位与结构第19页
       ·FABP4的生物学功能第19-20页
       ·畜禽FABP4基因的研究进展第20页
   ·PPARγ的研究进展第20-23页
     ·PPARγ的组织分布第21页
     ·PPARγ的结构第21页
     ·PPARγ的生物学功能第21-22页
     ·畜禽PPARy基因的研究进展第22-23页
   ·本研究的目的和意义第23-24页
2 材料与方法第24-40页
   ·试验材料第24页
     ·试验组织样品第24页
     ·试验血样及耳样第24页
   ·仪器与试剂第24-26页
     ·主要仪器第24-25页
     ·肌内脂肪(IMF)含量测定仪器第25页
     ·主要试剂盒与试剂第25页
     ·常用试剂的配制第25-26页
     ·肌内脂肪(IMF)含量测定试剂第26页
   ·试验方法第26-38页
     ·总RNA的提取第26-27页
     ·总RNA质量检测第27页
     ·cDNA第一条链的合成第27-28页
     ·基因的克隆第28-32页
       ·引物设计第28-29页
       ·RT-PCR扩增第29-30页
       ·PCR产物的胶回收第30-31页
       ·PCR产物的载体连接第31页
       ·连接产物的转化第31页
       ·扩增子菌液PCR鉴定第31页
       ·测序第31页
       ·生物信息学分析第31-32页
     ·基因表达检测第32-34页
       ·半定量及定量引物设计第32-33页
       ·半定量RT-PCR扩增第33-34页
       ·实时荧光定量PCR第34页
     ·肌内脂肪含量的测定第34-35页
     ·FABP4基因的多态性检测第35-38页
       ·基因组DNA的提取第35页
       ·基因组DNA的纯度和浓度检测第35页
       ·FABP4基因的SNPs检测第35-37页
       ·PCR-RFLP第37-38页
   ·数据处理第38-40页
     ·基因相对表达量及IMF含量数据处理第38页
     ·基因频率和基因型频率计算第38-39页
       ·基因频率和基因型频率第38-39页
       ·群体Hardy-Weinberg平衡状态的检验第39页
     ·遗传多样性分析第39-40页
3 试验结果与分析第40-61页
   ·基因的克隆与序列分析第40-52页
     ·RNA质量第40-41页
     ·RT-PCR扩增结果第41页
     ·目的片段测序结果第41页
     ·基因生物信息学分析第41-52页
       ·CDS区序列分析第41页
       ·CDS序列的碱基组成第41-44页
       ·基因的系统发育分析第44-46页
       ·山羊FABP1-4、PPARγ1和PPARγ2磷酸化位点预测第46-48页
       ·山羊FABP1-4、PPARγ1和PPARγ2蛋白二级结构的预测第48-50页
       ·山羊FABP1-4和PPARγ1-2保守结构域预测第50-52页
   ·基因的组织表达第52页
   ·各基因在南江黄羊肌肉组织不同阶段中的表达第52-55页
     ·山羊FABP3基因在肌肉不同发育阶段的表达规律第52页
     ·山羊FABP4基因在肌肉不同发育阶段的表达规律第52-53页
     ·山羊PPARγ基因的两种亚型在肌肉不同发育阶段的表达规律第53-55页
   ·不同阶段南江黄羊背最长肌肌内脂肪含量第55-56页
   ·不同阶段南江黄羊背最长肌中IMF含量与各基因表达相关性分析第56-57页
   ·FABP4基因的多态检测第57-61页
     ·山羊基因组DNA的检测第57页
     ·PCR扩增结果与分析第57-58页
     ·测序结果与分析第58-59页
     ·PCR产物酶切结果第59-60页
       ·山羊FABP4基因T143C位点限制性酶切检测结果第59-60页
       ·山羊FABP4基因T546C位点限制性酶切检测结果第60页
     ·不同基因型(基因)频率的分布与遗传特性分析第60-61页
4 讨论第61-69页
   ·各基因的克隆与序列分析第61-62页
     ·山羊FABP1-4基因的克隆与序列分析第61页
     ·山羊PPARγ基因的克隆与序列分析第61-62页
   ·山羊各基因的组织表达第62-64页
     ·山羊FABP1-4基因的组织表达第62-63页
     ·山羊PPARγ基因组织表达第63-64页
   ·南江黄羊各基因的表达与肌内脂肪沉积关系第64-67页
     ·南江黄羊背最长肌中IMF含量的变化趋势第64页
     ·南江黄羊FABP3-4基因的表达及其与IMF沉积的关系第64-65页
     ·南江黄羊PPARγ基因的表达及其与肌内脂肪沉积关系第65-67页
   ·南江黄羊FABP4基因多态性分析第67-69页
5 结论第69-70页
参考文献第70-78页
致谢第78-79页
附件第79-82页
攻读学位期间发表的论文及获奖情况第82页

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