高原肺水肿全基因组甲基化差异及功能的生物信息学分析
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 略语对照表 | 第9-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-19页 |
| 1.1 高原肺水肿及DNA甲基化检测方法 | 第13-16页 |
| 1.1.1 高原肺水肿概述 | 第13页 |
| 1.1.2 HAPE流行病学特征 | 第13-14页 |
| 1.1.3 HAPE发病机制 | 第14页 |
| 1.1.4 HAPE的临床诊断 | 第14页 |
| 1.1.5 HAPE的治疗措施 | 第14-16页 |
| 1.2 DNA甲基化在研究中的检测方法 | 第16-17页 |
| 1.2.1 以重亚硫酸氢盐转化为基础的方法 | 第16页 |
| 1.2.2 以高通量为基础的检测方法 | 第16-17页 |
| 1.3 生物信息学分析 | 第17-19页 |
| 第二章 全基因组甲基化芯片扫描的差异性分析 | 第19-32页 |
| 2.1 引言 | 第19-22页 |
| 2.2 实验材料与方法 | 第22-27页 |
| 2.2.1 仪器与试剂 | 第22页 |
| 2.2.2 研究对象与血样收集 | 第22-23页 |
| 2.2.3 全血DNA的提取 | 第23-27页 |
| 2.3 芯片数据 | 第27-30页 |
| 2.3.1 数据分析流程 | 第27-28页 |
| 2.3.2 标准化方法 | 第28页 |
| 2.3.3 差异甲基化位点的筛选标准 | 第28-29页 |
| 2.3.4 基因功能富集分析 | 第29-30页 |
| 2.4 课题研究思路 | 第30-32页 |
| 第三章 实验结果及生物信息学分析 | 第32-57页 |
| 3.1 实验结果 | 第32-45页 |
| 3.1.1 DNA的定量及其完整性检测 | 第32-33页 |
| 3.1.2 芯片(内参)报告 | 第33-35页 |
| 3.1.3 差异性甲基化位点及基因的筛选 | 第35-41页 |
| 3.1.4 CpG位点所在区域表达趋势 | 第41-45页 |
| 3.2 生物信息学功能分析 | 第45-57页 |
| 3.2.1 GO功能富集分析 | 第45-51页 |
| 3.2.2 KEGG功能富集分析 | 第51-57页 |
| 第四章 讨论及总结 | 第57-62页 |
| 4.1 讨论 | 第57-60页 |
| 4.2 全文总结 | 第60-62页 |
| 参考文献 | 第62-67页 |
| 致谢 | 第67-68页 |
| 攻读硕士学位期间取得的科研成果 | 第68页 |
