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人神经胶质瘤细胞全基因组拷贝数变异的单核苷酸多态性芯片分析

提要第1-5页
中文摘要第5-11页
Abstract第11-23页
第一章 文献综述第23-43页
   ·发病率第23-24页
   ·生存率第24-25页
   ·危险因素第25-27页
     ·物理因素第25-26页
     ·化学因素第26-27页
     ·生物学因素第27页
     ·其他因素第27页
   ·临床表现第27-28页
   ·诊断第28-30页
   ·治疗和预后第30-31页
   ·脑胶质瘤的遗传因素第31-43页
     ·研究脑胶质瘤遗传变异采用的方法第33-35页
     ·脑胶质瘤基因组中的遗传变异现象第35-38页
     ·研究拷贝数变异的方法第38-40页
     ·检测 CNVs 的数据处理第40-43页
第二章 材料与方法第43-63页
   ·实验材料第43页
     ·脑胶质瘤患者的 CNVs 检测样本收集第43页
     ·脑胶质瘤患者的诊断及病理分级第43页
     ·脑胶质瘤患者的临床生化检查第43页
   ·实验仪器第43-44页
   ·试剂及耗材第44-48页
     ·全基因组 SNP 芯片及配套试剂第44-47页
     ·DNA 实验试剂和耗材第47-48页
     ·实验所用特殊试剂第48页
     ·实验中所用分析软件第48页
   ·实验方法第48-63页
     ·外周血基因组 DNA 提取第49页
     ·胶质瘤组织基因组 DNA 提取第49-50页
     ·脑胶质瘤细胞及外周血基因组的 DNA 定量及 DNA 浓度的调整第50页
     ·美国 Illumina 公司 370 SNP 芯片标准实验流程(Fig.5)第50-60页
     ·实验质量控制第60页
     ·数据处理第60-63页
第三章 实验结果第63-85页
   ·脑胶质瘤患者病例、脑胶质瘤组织样本和自体外周血样本的采集第63-64页
   ·脑胶质瘤患者的胶质瘤细胞及外周血的基因组 DNA 提取和定量结果第64-65页
   ·全基因组 SNP 芯片技术对脑胶质瘤和外周血的基因组 CNV 检测结果的质量控制第65-66页
   ·全基因组 SNP 芯片实验数据分析结果第66-85页
     ·脑胶质瘤基因组和自体外周血 PBMC 基因组 CNV 的比较:第66-72页
     ·高、低分化脑胶质瘤基因组非遗传 CNV 的比较第72-79页
     ·脑胶质瘤基因组发生 CNV 的基因及其所涉及的细胞信号传导通路第79-81页
     ·脑胶质瘤发生 CNV 的基因所涉及的细胞生命过程第81-85页
第四章 讨论第85-105页
第五章 结论第105-107页
参考文献第107-121页
攻读学位期间发表的学术论文及取得的科研成果第121-122页
个人简历第122-123页
致谢第123页

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