海量质谱数据深度解析新方法及其应用
目录 | 第1-8页 |
中文摘要 | 第8-10页 |
Abstract | 第10-12页 |
縮略语索引 | 第12-13页 |
第一章 前言 | 第13-23页 |
1 基于生物质谱的蛋白质鉴定技术 | 第13-17页 |
·蛋白质及其酶切 | 第14-15页 |
·液相色谱-串联质谱联用技术 | 第15-16页 |
·质谱数据分析 | 第16-17页 |
2 蛋白质组学海量质谱数据的解析 | 第17-18页 |
3 基于标准品的蛋白质组学研究 | 第18-19页 |
4 本文立题依据 | 第19-23页 |
·研究背景 | 第19-20页 |
·主要研究内容 | 第20-23页 |
第二章 标准肽段样本的构建与表征 | 第23-35页 |
1 材料与方法 | 第23-28页 |
·主要试剂 | 第23-24页 |
·主要仪器 | 第24页 |
·样品制备 | 第24页 |
·腾冲嗜热厌氧菌样本制备 | 第24页 |
·标准肽段样品制备 | 第24页 |
·实验方法 | 第24-28页 |
·MALDI-TOF/TOF质谱分析 | 第24-25页 |
·LTQ-FT串联质谱分析 | 第25页 |
·LTQ-Orbitrap串联质谱分析 | 第25-26页 |
·高纯度肽段标准品的构建 | 第26-28页 |
2 结果与讨论 | 第28-34页 |
·高纯度合成肽段的色谱表征 | 第28-29页 |
·高纯度合成肽段的MALDI源质谱表征 | 第29-31页 |
·高纯度合成肽段的ESI源质谱表征 | 第31-34页 |
·标准肽段序列的正确性 | 第31-32页 |
·标准肽段样本中的物质组成及含量 | 第32-34页 |
3 本章小结 | 第34-35页 |
第三章 基于标准肽段混合物的质谱数据深度解析 | 第35-55页 |
1 材料与方法 | 第35-38页 |
·主要试剂 | 第35页 |
·主要仪器 | 第35页 |
·样本制备 | 第35-36页 |
·等摩尔标准肽段简单体系样本 | 第35页 |
·等摩尔标准肽段复杂体系样本 | 第35-36页 |
·不等摩尔标准肽段简单体系 | 第36页 |
·不等摩尔标准肽段复杂体系 | 第36页 |
·实验方法 | 第36-38页 |
·数据来源 | 第36-37页 |
·色谱质谱条件 | 第37页 |
·数据库检索 | 第37-38页 |
2 结果与讨论 | 第38-52页 |
·质谱仪精度对质谱数据解析的影响 | 第38-47页 |
·一级高精度扫描对质谱数据解析率的影响 | 第38-44页 |
·二级高精度扫描对质谱谱图解析率的影响 | 第44-47页 |
·不同数据库检索软件对谱图解析的影响 | 第47-48页 |
·样本复杂程度对质谱数据解析的影响 | 第48-52页 |
3 本章小结 | 第52-55页 |
第四章 基于高精度质谱数据的母离子识别算法 | 第55-67页 |
1 材料与方法 | 第55-59页 |
·主要试剂 | 第55页 |
·主要仪器 | 第55页 |
·样品制备 | 第55-56页 |
·等摩尔标准肽段混合物样本 | 第55页 |
·腾冲嗜热厌氧菌蛋白质酶切肽段样本 | 第55-56页 |
·实验方法 | 第56-59页 |
·数据来源 | 第56页 |
·色谱质谱条件 | 第56页 |
·数据库检索 | 第56-57页 |
·基于同位素峰强比值的母离子识别算法 | 第57-59页 |
2 结果与讨论 | 第59-66页 |
·单同位素峰边缘特征的确定 | 第59-60页 |
·混合谱图母离子单同位素峰识别 | 第60-64页 |
·PIRMD算法评价 | 第64-66页 |
3 本章小结 | 第66-67页 |
第五章 基于高精度质谱数据的混合谱图解析算法 | 第67-79页 |
1 试剂与方法 | 第67-68页 |
·主要试剂 | 第67页 |
·主要仪器 | 第67页 |
·样本制备 | 第67-68页 |
2 实验方法 | 第68-69页 |
·高精度质谱数据获取 | 第68页 |
·数据库检索 | 第68页 |
·基于高精度数据的混合谱图解析算法 | 第68-69页 |
3 结果与讨论 | 第69-78页 |
·混合谱图解析算法可行性分析 | 第69-73页 |
·二级谱图中碎片离子对称性分析 | 第70-71页 |
·互补碎片离子误差和的分布 | 第71-72页 |
·碎片离子误差及二级谱图质谱峰间距分布 | 第72-73页 |
·混合谱图解析算法 | 第73-75页 |
·混合谱图解析算法评价 | 第75-78页 |
·混合谱图参考数据集解析 | 第75-76页 |
·标准肽段混合物样本质谱数据解析 | 第76-77页 |
·腾冲嗜热厌氧菌样本质谱数据解析 | 第77-78页 |
4 本章小结 | 第78-79页 |
全文总结 | 第79-81页 |
参考文献 | 第81-89页 |
文献综述 | 第89-97页 |
参考文献 | 第93-97页 |
代表性论著 | 第97-121页 |
攻读博士学位期间发表的文章 | 第121-123页 |
个人简历 | 第123-125页 |
致谢 | 第125页 |