首页--生物科学论文--植物学论文--植物细胞遗传学论文--植物基因工程论文

多枝赖草基因组可转化人工染色体(TAC)文库的构建、鉴定和筛选

中文摘要第1-10页
英文摘要第10-11页
第一部分 文献综述和立题意义第11-33页
 Ⅰ 综述第11-29页
  一、基因克隆的主要策略第11-13页
   1、功能克隆第11页
   2、表型克隆第11-12页
   3、定位克隆第12-13页
   4、序列克隆第13页
  二、基因克隆的常用技术第13-18页
   1、PCR技术第13-14页
   2、基因标记法第14页
   3、mRNA差异显示第14-15页
   4、消减杂交法第15页
   5、基因芯片技术第15-16页
   6、电子克隆技术第16-17页
   7、基因文库技术第17-18页
  三、大片段DNA插入文库的发展史第18-22页
   1、质粒文库第18页
   2、λ噬菌体文库第18页
   3、粘粒文库第18-19页
   4、酵母人工染色体(YAC)文库第19-20页
   5、细菌人工染色体(BAC)文库第20页
   6、P1克隆系统和源于P1的人工染色体(PAC)文库第20-21页
   7、双元细菌人工染色体(BIBAC)文库第21-22页
   8、可转化人工染色体(TAC)文库第22页
  四、可转化人工染色体(TAC)文库的发展史第22-27页
  五、大片段基因组文库的筛选方法第27-28页
  六、多枝赖草的研究现状第28-29页
 Ⅱ 本论文立题依据、研究内容、技术路线第29-33页
  一、立题依据第29页
  二、研究内容第29-32页
  三、技术路线第32-33页
第二部分 多枝赖草基因组可转化人工染色体(TAC)文库的构建、鉴定和筛选第33-108页
 材料与方法第33-75页
  一、实验材料第33-36页
   1、多枝赖草第33页
   2、pYLTAC17和pYLTAC747H质粒载体第33-34页
   3、大肠杆菌感受态细胞第34页
   4、农杆菌感受态细胞LB4404第34页
   5、叶绿体和线粒体DNA探针第34页
   6、谷胱甘肽还原酶第34-35页
   7、多枝赖草抗逆EST第35页
   8、主要仪器第35页
   9、主要试剂和溶液第35-36页
  二、实验方法第36-75页
   1、多枝赖草基因组TAC文库的构建第36-63页
   ·、pYLTAC17和pYLTAC747H两种TAC载体的制备第36-41页
     ·、pYLTAC17和pYLTAC747H质粒载体的分离、纯化和浓度估测第36-38页
     ·、电激转化大肠杆菌感受态细胞检测TAC质粒载体第38页
     ·、闭环TAC载体DNA不同酶用量梯度的酶切和脱磷第38-41页
     ·、线性TAC载体DNA脱磷效果的自连检测第41页
   ·、多枝赖草的2Mb以上核DNA制备第41-46页
     ·、细胞核的提取和镜检第42-43页
     ·、细胞核的低溶点琼脂糖胶块包埋第43页
     ·、蛋白酶K裂解LMP胶中细胞核第43-44页
     ·、含高分子量核DNA的琼脂糖胶块清洗及保存第44页
     ·、琼脂糖胶块中高分子量核DNA质量、大小和浓度的测定第44-45页
     ·、2Mb以上核DNA的回收纯化及保存第45-46页
   ·、多枝赖草2Mb以上核DNA的酶切和酶切片段的回收第46-52页
     ·、部分酶切最佳酶用量的确定第46-47页
     ·、2Mb以上核DNA的大量酶切第47-48页
     ·、酶切片段的选择第48-49页
     ·、选择片段的电洗脱回收第49-50页
     ·、DNA片段的浓缩、纯化和脱盐第50页
     ·、检测DNA大小和纯度第50-52页
   ·、多枝赖草DNA片段与TAC载体的连接反应第52-57页
     ·、两种线性TAC载体DNA与选择片段的比例确定第52-55页
     ·、连接反应条件的优化第55-56页
     ·、连接产物的脱盐纯化第56页
     ·、连接产物的浓度测定第56-57页
   ·、连接产物导入大肠杆菌和阳性克隆的筛选第57-60页
     ·、大肠杆菌DH10B感受态细胞的制备第57-58页
     ·、连接反应产物电转化导入大肠杆菌DH10B感受态细胞第58-59页
     ·、选择培养基中最佳涂板量的确定第59-60页
     ·、阳性克隆的筛选第60页
     ·、阳性克隆的初步鉴定分析第60页
   ·、多枝赖草TAC文库的保存第60-63页
     ·、阳性克隆菌落收集统计第60-61页
     ·、单克隆文库的保存第61页
     ·、混合克隆文库的保存第61-62页
     ·、TAC文库的贮藏与备份第62-63页
   2、多枝赖草TAC文库的鉴定和分析第63-69页
   ·、TAC克隆的限制性酶切分析第63-65页
     ·、文库中TAC克隆的恢复培养第63-64页
     ·、TAC克隆的质粒提取第64页
     ·、HindⅢ酶切分析TAC克隆质粒中插入DNA片段的大小第64页
     ·、继代培养分析TAC克隆质粒的稳定性第64-65页
   ·、叶绿体和线粒体DNA污染分析第65-68页
     ·、含叶绿体高梁psbA,线粒体玉米atp6和atp9基因的菌液培养第65页
     ·、含叶绿体高梁psbA,线粒体玉米atp6和atp9基因质粒的酶切和回收第65-66页
     ·、叶绿体高梁psbA,线粒体玉米atp6和atp9基因探针的DIG标记第66-67页
     ·、斑点杂交检测叶绿体和线粒体DNA的污染第67-68页
   ·、TAC克隆在大肠杆菌和农杆菌中的稳定性鉴定第68-69页
     ·、农杆菌菌株LBA4404感受态细胞的制备第68页
     ·、大肠杆菌DH10B菌液中TAC克隆质粒的提取第68-69页
     ·、TAC克隆质粒电转化导入农杆菌菌株LBA4404感受态细胞第69页
     ·、农杆菌菌株LBA4404菌液中TAC克隆质粒的提取第69页
     ·、TAC克隆质粒重新电转化导入大肠杆菌DH10B感受态细胞第69页
     ·、大肠杆菌和农杆菌中TAC克隆质粒的HindⅢ酶切分析第69页
   3、多枝赖草TAC文库的筛选第69-75页
   ·、高密度杂交膜的制备第69-72页
     ·、杂交膜的准备第70页
     ·、杂交膜的机器手GeneTAC~(TM) G3点样第70-71页
     ·、膜上TAC克隆的培养、固定和裂解第71-72页
   ·、多枝赖草谷胱甘肽还原酶基因(GR)的筛选第72-73页
     ·、克隆菌5'RACE-GR和3'RACE-GR的质粒DNA获得第72页
     ·、胶中克隆菌5'RACE-GR和3'RACE-GR的DNA片段回收第72页
     ·、5'RACE-GR和3'RACE-GR的DNA片段的DIG标记第72-73页
     ·、谷胱甘肽还原酶基因探针与高密度膜的Southern杂交第73页
   ·多枝赖草特异抗性基因EST的电子克隆与筛选第73-75页
     ·、抗性基因EST在数据库中检索第73页
     ·、检索选择后EST的Contig第73-74页
     ·、Contig新序列的循环检索和拼接延伸第74页
     ·、设计不能再延伸的序列DNA的PCR引物第74页
     ·、用PCR-Pool法筛选混合克隆TAC文库第74-75页
 实验结果与分析第75-102页
  Ⅰ、多枝赖草基因组TAC文库的构建第75-90页
   一、pYLTAC17和pYLTAC747H两种TAC载体的制备第75-76页
    1、TAC质粒载体的分离、纯化和浓度估测第75-76页
    2、闭环TAC载体DNA不同酶用量梯度的酶切第76页
   二、多枝赖草的2Mb以上核DNA制备第76-80页
    1、多枝赖草的培养第76-77页
    2、细胞核的分离和镜检第77-78页
    3、蛋白酶K裂解LMP胶中的细胞核第78页
    4、琼脂糖胶块中高分子量核DNA质量、大小和浓度的测定第78-79页
    5、2Mb以上核DNA的回收纯化及保存第79-80页
   三、多枝赖草2Mb以上核DNA的酶切和酶切片段的回收第80-84页
    1、多枝赖草2Mb以上核DNA的部分酶切最佳酶用量的确定第80-81页
    2、2Mb以上核DNA的大量酶切第81页
    3、酶切片段的选择第81-82页
    4、选择DNA片段的电洗脱回收第82-83页
    5、DNA片段的浓缩、纯化和大小估测第83-84页
   四、多枝赖草DNA片段与TAC载体的连接反应第84-86页
    1、两种线性TAC载体DNA与选择片段的比例确定第84页
    2、连接反应条件的优化第84-85页
    3、连接产物的脱盐纯化和浓度测定第85-86页
   五、连接产物导入大肠杆菌和阳性克隆的筛选第86-89页
    1、连接反应产物对电转化的影响第86-87页
    2、选择培养基中最佳涂板量的确定第87-88页
    3、阳性克隆的筛选第88-89页
   六、多枝赖草TAC文库的保存第89-90页
    1、TAC文库的保存与培养第89页
    2、多枝赖草基因组可转化人工染色体(TAC)文库概况第89-90页
    3、所建多枝赖草基因组TAC文库的管理第90页
  Ⅱ、多枝赖草TAC文库的鉴定和分析第90-93页
   一、TAC克隆的限制性酶切分析第90-92页
    1、文库基因组的覆盖率、插入片段大小及空载率的鉴定第90-91页
    2、继代培养分析TAC克隆质粒的稳定性第91-92页
   二、叶绿体和线粒体DNA污染分析第92-93页
   三、TAC克隆在大肠杆菌和农杆菌中的稳定性鉴定第93页
  Ⅲ、多枝赖草TAC文库的筛选第93-102页
   一、高密度杂交膜的制备第93-95页
    1、杂交膜的机器手GeneTAC~(TM) G3点样和培养第93-94页
    2、菌斑裂解和DNA与膜的结合第94-95页
    3、高密度杂交膜和文库的检测第95页
   二、多枝赖草谷胱甘肽还原酶基因(GR)的筛选第95-96页
   三、多枝赖草特异抗性基因EST的电子克隆与筛选第96-102页
    1、多枝赖草的耐蚜虫、耐黄矮病性状相关的EST序列的电子克隆第96-98页
    2、多枝赖草的盐胁迫、耐盐、耐旱性状相关的EST序列的电子克隆第98-101页
    3、电子克隆序列的PCR引物设计第101页
    4、TAC文库的PCR-Pool法筛选第101-102页
 讨论第102-107页
  一、TAC载体的选择和制备第102-103页
  二、多枝赖草材料的选择第103页
  三、核DNA的制备第103-104页
  四、连接条件的优化第104页
  五、电击转化效率的优化第104-105页
  六、多枝赖草TAC文库的鉴定第105-106页
  七、多枝赖草TAC文库的筛选第106-107页
 结论第107-108页
附录第108-110页
参考文献第110-119页
个人简历第119-120页
致谢第120页

论文共120页,点击 下载论文
上一篇:软件测试方法及在综合网管系统测试中的应用与研究
下一篇:中国高速铁路道岔产品招标与技术引进研究