| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 第一章 前言 | 第12-23页 |
| ·问题的提出 | 第12-13页 |
| ·前人研究进展 | 第13-16页 |
| ·DNA甲基化及其特点 | 第13-14页 |
| ·DNA甲基化在植物发育过程中起着重要作用 | 第14-15页 |
| ·DNA甲基化与植物防御系统 | 第15页 |
| ·DNA甲基化的变化规律 | 第15-16页 |
| ·DNA甲基化与逆境 | 第16页 |
| ·DNA甲基化的研究方法 | 第16-20页 |
| ·基于重亚硫酸处理的DNA甲基化的分析技术 | 第17-19页 |
| ·基因组重亚硫酸盐测序法 | 第17页 |
| ·MALDI-TOF MS | 第17-18页 |
| ·亚硫酸氢钠联合限制性内切酶分析法(COBRA) | 第18页 |
| ·甲基化特异性PCR(MS-PCR) | 第18-19页 |
| ·不依赖重亚硫酸盐处理的DNA甲基化的分析技术 | 第19页 |
| ·Southern blotting法 | 第19页 |
| ·色谱或电泳法 | 第19页 |
| ·MSAP技术 | 第19-20页 |
| ·微卫星标记开发的研究进展 | 第20-23页 |
| ·SSRs的生物学功能 | 第20页 |
| ·SSRs的丰度和分布规律 | 第20-21页 |
| ·SSRs标记的类型和应用 | 第21页 |
| ·SSRs标记的开发方法及工具 | 第21-23页 |
| 第二章 柑橘单胚系的建立及MSAP分析 | 第23-37页 |
| ·实验材料 | 第23页 |
| ·方法 | 第23-27页 |
| ·材料的准备 | 第23页 |
| ·单胚系的建立 | 第23-24页 |
| ·AFLP和MSAP分析 | 第24-27页 |
| ·引物和接头(adapter)合成 | 第24-25页 |
| ·AFLP模板DNA制备 | 第25页 |
| ·DNA扩增反应 | 第25-26页 |
| ·凝胶电泳 | 第26-27页 |
| ·MSAP分析 | 第27页 |
| ·SOUTHERN BLOTTING | 第27页 |
| ·结果与分析 | 第27-35页 |
| ·山金柑和伏令夏橙单胚系的建立 | 第27-29页 |
| ·山金柑和伏令夏橙胚状体的诱导和植株的再生的特点 | 第28页 |
| ·再生过程中的畸形现象 | 第28-29页 |
| ·再生过程中MSAP(Methylation Sensitive Amplification Polymorphism)分析 | 第29-33页 |
| ·AFLP分析 | 第29页 |
| ·HpaII,MspI/EcoRI酶切组合的MSAP | 第29-31页 |
| ·PstI/MseI酶切组合的MSAP | 第31-33页 |
| ·MSAP结果的Southern blotting验证 | 第33-35页 |
| ·讨论 | 第35-37页 |
| ·MSAP是一种有效的检测DNA甲基化变化的方法 | 第35页 |
| ·愈伤的长期继代与DNA甲基化 | 第35-36页 |
| ·愈伤再生与DNA甲基化 | 第36-37页 |
| 第三章 MSAP多态性片断的克隆与分析 | 第37-55页 |
| ·材料和方法 | 第37-42页 |
| ·材料 | 第37页 |
| ·多态性片段的克隆测序分析 | 第37-38页 |
| ·TAIL-PCR | 第38-40页 |
| ·TAIL-PCR引物 | 第38页 |
| ·PCR反应体系 | 第38-40页 |
| ·TAIL—PCR的改进 | 第40-42页 |
| ·BlastX分析和聚类 | 第40页 |
| ·特异引物和简并引物 | 第40页 |
| ·PCR反应及产物筛选及测序 | 第40-42页 |
| ·结果与分析 | 第42-53页 |
| ·多态性带回收,测序及序列分析 | 第42页 |
| ·片段361的序列分析 | 第42-46页 |
| ·片段361特点及southern blotting分析 | 第42-46页 |
| ·片段361侧翼序列的克隆 | 第46页 |
| ·片段Ms02的序列分析 | 第46-53页 |
| ·简并引物的设计 | 第47-50页 |
| ·Ms02侧翼序列的克隆 | 第50-53页 |
| ·Blast及表达分析 | 第53页 |
| ·讨论 | 第53-55页 |
| ·片段361是否来自反转录转座子,是否受DNA甲基化调控 | 第53-54页 |
| ·片段Ms02的作用,是否受DNA甲基化调控 | 第54页 |
| ·提高了效率的TAIL-PCR | 第54-55页 |
| 第四章 柑橘SSR标记的开发与应用 | 第55-68页 |
| ·材料和方法 | 第55-59页 |
| ·植物材料 | 第55页 |
| ·总DNA的提取 | 第55页 |
| ·PC的配置 | 第55-56页 |
| ·MISA使用环境的建立及使用 | 第56-57页 |
| ·Activeperl引擎的建立 | 第56页 |
| ·MISA的安装及使用 | 第56-57页 |
| ·Sputnik的使用方法 | 第57页 |
| ·Alignment工具 | 第57页 |
| ·引物设计 | 第57-58页 |
| ·PCR扩增反应体系 | 第58页 |
| ·SSR的检测 | 第58-59页 |
| ·结果与讨论 | 第59-66页 |
| ·序列的获取与预处理 | 第59-60页 |
| ·不同软件效率的比较 | 第60-61页 |
| ·SSR的出现频率与密度 | 第61-63页 |
| ·各类SSR的分布规律 | 第63-64页 |
| ·冗余和非冗余数据组的比较 | 第64页 |
| ·SSR标记的开发 | 第64-66页 |
| ·讨论 | 第66-68页 |
| 参考文献 | 第68-81页 |
| 附录 | 第81-87页 |
| 图版和说明 | 第87-91页 |
| 发表的有关文章 | 第91-92页 |
| 致谢 | 第92页 |
