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水稻内源非编码小RNA的多样性

中文摘要第1-7页
英文摘要第7-11页
目录第11-14页
1.引言第14-47页
   ·小RNA的种类第14-33页
     ·干扰小RNA第14-24页
       ·siRNA的发现第14-16页
       ·siRNA介导RNA干扰的分子机制第16页
       ·siRNA的功能第16-18页
       ·RNAi技术的应用第18-24页
         ·siRNA的设计第18页
         ·siRNA的合成第18-22页
         ·RNA干扰技术的利用第22-24页
     ·microRNA(miRNA)第24-32页
       ·miRNA的发现及其特性第24-25页
       ·miRNA基因鉴定及其表达标准第25-26页
       ·miRNA的克隆第26-27页
       ·miRNA转录成熟第27-28页
       ·miRNA的作用机制第28页
       ·动物和植物中的miRNA第28-29页
       ·siRNA和miRNA的比较第29页
       ·miRNA目标预测第29-30页
       ·miRNA生物学功能第30-32页
         ·动物中miRNA第30-32页
         ·植物中miRNA的功能第32页
     ·微小非编码RNA(tncRNA)第32-33页
     ·调节性小双链RNA(smRNAs)第33页
     ·Trans-acting siRNA(tasiRNA)第33页
   ·与微小RNA生物产生及其功能发生相关的部分蛋白第33-41页
     ·核糖核酸酶Ⅲ超家族第33-37页
       ·细菌核糖核酸酶Ⅲ第34-35页
         ·细菌核糖核酸酶Ⅲ功能第34-35页
       ·酵母核糖核酸酶Ⅲ第35页
       ·高等真核生物核糖核酸酶Ⅲ第35-37页
         ·DICER第36-37页
         ·Drosha第37页
     ·Argonaute家族蛋白第37-39页
     ·RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)第39-41页
     ·RNA聚合酶Ⅳ(RNA polymerase Ⅳ)第41页
     ·RISC(RNA iducing silence complex)第41页
   ·水稻基因组计划及其生物信息学第41-44页
     ·水稻基因组计划的概况第42-44页
     ·水稻生物信息学第44页
   ·本研究的目的与意义第44-47页
2.材料与方法第47-60页
   ·材料种植和准备第47页
   ·总RNA的提取第47-48页
   ·阴离子交换层析分离小片段RNA第48页
   ·变性聚丙烯酰胺(PAGE)凝胶分离小RNA片段第48-51页
   ·小RNA的克隆第51-54页
   ·小RNA片段分析第54页
   ·小RNA在染色体的分布第54页
   ·Northen blot杂交第54-56页
   ·快速扩增cDNA末端(RACE)第56-57页
   ·Dicer-like全长cDNA的获得第57-58页
   ·Dicer-like基因的克隆第58-60页
3.结果与分析第60-86页
   ·水稻中小RNA第60-64页
     ·水稻小RNA群体第60-62页
     ·小RNA在水稻9311染色体位置分布第62页
     ·部分重叠小RNA第62-63页
     ·小RNA簇第63-64页
   ·水稻中的miRNA第64-74页
     ·水稻中17个miRNA第64-67页
     ·前体和microRNA长度的多样性第67-68页
     ·miRNA在基因组中的位置第68页
     ·miRNA的目标第68-70页
     ·m29作用目标克隆第70-74页
     ·小RNA附近的茎环结构第74页
   ·与重复序列相关的小干扰RNA(rasiRNAs)第74-76页
   ·微小非编码RNA第76页
   ·水稻中的RNase Ⅲ以及Dicer-like基因第76-86页
     ·水稻中的RNase Ⅲ家族第76-79页
     ·籼稻中一个Dicer-like基因第79-84页
     ·Dicer-like基因的表达第84-86页
4.讨论第86-95页
   ·植物中微小RNA多样性第86-88页
   ·microRNA及其功能第88-89页
   ·siRNA和rasiRNA第89页
   ·小RNA与逆境第89-90页
   ·小RNA与看家非编码RNA第90-91页
   ·小RNA与花药中小孢子发育第91-92页
   ·小RNA研究的方法与策略第92-93页
   ·植物中DCL(Dicer-like)第93-95页
结论第95-97页
参考文献第97-115页
附录Ⅰ第115-135页
附录Ⅱ 英文缩写第135-136页
在读期间发表的论文第136-137页
致谢第137页

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