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应用生物信息学方法从低氧处理人动脉内皮细胞SAGE库中挖掘低氧反应相关新基因

摘要第1-6页
Abstract第6-8页
重要缩略语表第8-9页
第一章 前言第9-38页
 第一节 低氧(hypoxia)研究第9-15页
  一、低氧研究的重要性第9页
  二、低氧信号通路国内外研究现状第9-13页
  三、目前低氧研究中有待解决的问题第13-15页
 第二节 基因表达系列分析方法(SAGE)第15-23页
  一、基因表达差异显示技术第15页
  二、基因表达的系列分析(SAGE)第15-23页
 第三节 生物信息学(bioinformatics)第23-31页
  一、什么是生物信息学第23页
  二、生物信息学的特点第23-24页
  三、网上生物信息学数据库资源第24-28页
  四、生物信息学方法在新基因克隆中的应用第28-30页
  五、总结第30-31页
 参考文献第31-38页
第二章 从低氧处理人动脉内皮细胞SAGE库中挖掘低氧反应相关新基因第38-51页
 第一节 材料和方法第39-41页
  一、本研究中所使用的SAGE库第39页
  二、寻找低氧处理后发生了变化的tags第39页
  三、将tag转化为mRNA-source sequence第39页
  四、有功能的hypothetical genes的筛选第39-40页
  五、选择8个“有功能的”hypothetical genes进行生物信息学分析第40-41页
 第二节 结果与分析第41-47页
  一、“有功能的”hypothetical genes的筛选第41-42页
  二、8个候选基因的生物信息学分析第42-47页
 第三节 讨论第47-49页
 参考文献第49-51页
第三章 基因克隆及基因在低氧条件下表达变化情况的验证第51-60页
 第一节 材料和方法第52-54页
 第二节 结果与分析第54-58页
 第三节 讨论第58-59页
 参考文献第59-60页
第四章 结论第60-61页
附录第61-75页
 附录一、预测为“有功能”的hypothetical genes的分类第61-72页
 附录二、常用生物信息学网站第72-75页
致谢第75页

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